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分类: 公开数据 标签: RefSeq

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  • NCBI_GenBank_Based_红藻源复杂质体进化模型与定年研究数据

    2026年1月21日 30 77 53

    数据集概述 本数据集为红藻源复杂质体进化模型与定年研究的支撑数据，包含经处理的蛋白质序列比对文件、原始序列文件及物种-蛋白质对应矩阵。数据选取自NCBI RefSeq和GenBank数据库，涵盖112种生物的97个保守质体编码蛋白氨基酸序列，用于系统发育和分子钟分析。 文件详解 序列比对文件包（SequenceAlignments.zip）...
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  • PacBio_16S_rRNA_Based_木蜂种群细菌微生物组组成比较数据

    2026年1月20日 30 82 0

    数据集概述 本数据集通过PacBio全长16S rRNA基因测序，比较两种初始社会性木蜂（Xylocopa sonorina和Xylocopa tabaniformis）不同地理种群的嗉囊与肠道微生物组结构，包括核心分类群、物种特异性变异及种群水平分化特征，揭示微生物组与宿主的关联机制。 文件详解 README_Xylocopa.docx...
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  • Bionomia_Linked_Fungal_28S核糖体RNA项目标本采集者与鉴定者关联数据

    2026年1月12日 30 101 31

    数据集概述 本数据集为“Fungal 28S核糖体RNA（LSU）RefSeq靶向位点项目”关联的自然历史标本数据，包含标本与采集者、鉴定者的关联信息，由Bionomia志愿者标注，基于全球生物多样性信息机构（GBIF）聚合的标本数据，以Frictionless Data数据包格式组织，共9个文件。 文件详解 数据包描述文件...
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  • Metagenomics_Based_Elkhorn_Slough微生物垫宏基因组分箱与注释数据集

    2026年1月6日 30 133 31

    数据集概述 本数据集为Elkhorn Slough微生物垫宏基因组分箱与注释的补充测序及注释数据，包含3个共组装数据集的MG-RAST注释、不同k-mer值（k29、k45、k63）共组装的 scaffolds 及Prodigal预测ORFs，以及用于分箱的scaffold覆盖度和注释信息，共5个压缩文件。 文件详解...
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  • Bionomia_Based_Bacterial_16S核糖体RNA_RefSeq项目采集者鉴定者关联数据

    2025年12月30日 30 140 48

    数据集概述 本数据集关联了“Bacterial 16S Ribosomal RNA RefSeq Targeted Loci Project”中的自然历史标本数据与采集者、鉴定者信息。数据由Bionomia志愿者标注，基于Global Biodiversity Information Facility聚合的标本数据，以Frictionless...
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  • AMRProfiler抗菌耐药基因与突变识别工具数据集

    2025年12月22日 30 25 4

    数据集概述 本数据集包含AMRProfiler工具的源代码及配套数据库，该工具可识别近18000种细菌的获得性耐药基因、耐药相关点突变及rRNA基因突变，整合CARD、ResFinder等数据库数据，支持多格式基因组分析。 文件详解 amrprofiler-main.zip：工具源代码压缩包，为GitHub仓库文件，需配合其他数据库文件夹本地运行...
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  • MITOS2设置参数表_蛙类分类修订研究

    2025年12月14日 30 46 17

    数据集概述 本数据集为MITOS2软件的参数设置表，用于支持对印度支那地区Phrynoglossus属蛙类的分类修订研究，具体参数包括遗传密码、蛋白/RNA预测开关、重叠长度等关键配置项。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射: 包含MITOS2软件的参数配置信息，核心参数及取值如下： RefSeq: 63...
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  • Maximillian_R_W_Jones博士论文补充数据集

    2025年12月8日 30 161 126

    数据集概述 本数据集是Maximillian R. W. Jones博士论文的补充数据集合，涵盖论文第2、3、4章的配套数据与文档。包含基因型、代谢物、表型、基因表达、实验设计等多类型数据，支持论文研究结果的验证与扩展分析。 文件详解 该数据集包含22个文件，按章节分类说明如下： - 第2章补充数据: - Supplementary_Data_2.1:...
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  • 肺炎支原体全基因组多位点序列分型方案数据集

    2025年12月6日 30 123 37

    数据集概述 本数据集包含肺炎支原体全基因组多位点序列分型（wgMLST）方案构建所需的数据，涉及基因组组装文件及最终的wgMLST分型方案，为肺炎支原体的基因分型研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称：NCBI_assemblies.zip 文件格式：ZIP压缩包 内容：包含用于构建分型方案的RefSeq登录号列表及基因组组装FASTA文件...
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