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分类: 公开数据 标签: contigs

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  • Symphonia_Based热带树种基因组工具开发及遗传标记数据

    2026年1月27日 30 49 39

    数据集概述 本数据集包含热带树种Symphonia globulifera的基因组工具开发成果，包括首个低覆盖度（11X）基因组草图、单核苷酸多态性（SNP）及简单序列重复（SSR）标记数据。数据覆盖该树种67.5%的预估基因组大小，含基因注释、SSR标记及跨地理种群的遗传多态性信息，可支持种群遗传学及比较基因组学研究。 文件详解...
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  • Mesodesma_donacium_SNP_Based_基因注释与多态性分析数据

    2026年1月15日 30 28 14

    数据集概述 本数据集围绕软蛤Mesodesma donacium的表达序列标签（EST）数据展开，通过454焦磷酸测序生成180159条EST，经从头组装得到10178个contigs和41765个singletons，最终发现2594个SNP位点，涉及613条共识序列，还包含基因本体（GO）分析及SNP验证相关信息，为该物种遗传研究提供基础数据。...
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  • Colletotrichum_Comparative_Genomic_半活体营养阶段转变研究数据

    2026年1月8日 30 88 55

    数据集概述 本数据集围绕Colletotrichum属真菌的半活体营养阶段转变展开，包含C. orbiculare和C. gloeosporioides两种病原菌的基因组测序与分析结果。通过比较基因组学和转录组学方法，识别与病原菌侵染阶段相关的基因扩张类群，揭示其致病机制。数据集含4个文件，涵盖基因组组装说明文档与压缩包。 文件详解...
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  • Sequencing_Haloarchaeal_Genomes_七种盐古菌基因组测序与功能分析数据

    2026年1月7日 30 191 83

    数据集概述 本数据集包含七种盐古菌（Haloferax和Haloarcula属）的基因组测序数据及相关分析文件。这些古菌因易培养、遗传工具成熟成为古菌生物学研究模型，其独特生理特性也为生物技术酶发现提供候选。数据覆盖度约20倍，组装平均50个contigs，可用于比较基因组学、功能基因富集及DNA代谢机制研究。 文件详解...
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  • 束带蛇转录组_焦磷酸测序_从头组装及性别特异性差异数据集

    2025年12月20日 30 5 1

    数据集概述 本数据集包含西部 terrestrial 束带蛇（Thamnophis elegans）的转录组数据，通过焦磷酸测序技术生成，涵盖雌雄性别特异性转录本差异。数据经从头组装得到基因序列，结合注释分析识别性别特异性基因、SNPs、INDELs及进化相关基因，为爬行动物分子资源研究提供支持。 文件详解...
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  • InstaNexus通用直接蛋白质测序补充数据集

    2025年12月18日 30 115 50

    数据集概述 本数据集是论文《Generalizable direct protein sequencing with InstaNexus》的补充数据，包含InstaNexus软件在不同测试样本类型上的输出结果，以及复现论文图表所需的必要数据，按样本类型组织并标注了运行参数。 文件详解 文件名称：supplementary_data.zip...
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