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Drosophila_melanogaster_Based_果蝇全基因组重测序数据_2016
数据集概述 本数据集包含Sussex-LHM和RG品系黑腹果蝇的全基因组重测序相关数据，涵盖比对代码、日志文件及质量控制数据。数据支持下一代测序数据的比对分析，可用于研究果蝇基因组特征及变异情况，总计包含12个文件。 文件详解 比对代码文件 文件名称：lhm_mapping_scripts.zip 文件格式：ZIP...
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Pachyptila_belcheri_Based_海鸟微卫星标记跨物种适用性进化因素研究数据
数据集概述 本数据集围绕亚南极海鸟细嘴锯鹱（Pachyptila belcheri）微卫星标记的跨物种适用性展开，包含通过下一代测序开发的标记在近缘物种中的扩增测试结果，以及相关的进化因素分析数据，共4个文件，涉及基因组测序、基因型数据、系统发育树及遗传距离矩阵等内容。 文件详解 Tree files and pairwise distance...
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Le_Roux_etal_JEcol_Based_澳大利亚金合欢入侵土壤遗留效应与共生互作数据集
数据集概述 本数据集围绕澳大利亚金合欢属植物入侵南非核心开普次区域的土壤遗留效应展开，通过对比入侵与未入侵区域土壤的固氮微生物群落差异，结合温室实验分析金合欢生长表现与根瘤菌互作的关系，揭示入侵植物与土壤生物/非生物因子的正反馈机制。 文件详解 文件名称：README_for_Datasets-for-Le-Roux-etal-JEcol.docx...
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Pooled_NGS_Based_莱奥佩尔马蛙种群遗传多样性与结构评估数据_Conservation
数据集概述 本数据集包含针对新西兰保护关注蛙类Leiopelma hochstetteri的20个种群的池化样本并行标记下一代测序数据，用于评估该方法在生态保护领域种群遗传分析中的准确性与实用性。数据对比了池化NGS与个体Sanger测序的种群遗传参数（核苷酸多样性π、分化指数FST），验证了池化方法的可靠性。 文件详解...
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PredatorFeeding_Stream_Ecology_牧场集约化对溪流捕食者摄食互作影响研究数据
数据集概述 本数据集基于牧场集约化对溪流广食性捕食者摄食互作影响的研究，通过下一代测序技术分析近400个捕食性无脊椎动物个体的肠道内容物，探究土地利用强度梯度下捕食者食性变化。数据包含6个文件，涵盖猎物丰度、测序标签分配、基因序列、位点理化特征等信息，为研究人为干扰对溪流群落的影响提供支撑。 文件详解 Allpreyabundance.csv...
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Next_Gen_phylogeography_rainforest_trees_叶绿体基因组变异研究数据
数据集概述 本数据集为雨林树木叶绿体基因组变异研究数据，通过下一代测序技术分析12种非模式雨林树木的叶绿体全基因组变异，涉及南北两个进化区域。数据包含叶绿体参考序列及核rDNA标记信息，可用于识别生物地理屏障、分析遗传多样性分布及进化历史。 文件详解...
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Next_generation_Sequencing_Based_湖泊沉积物休眠卵DNA测序富营养化特征数据
数据集概述 本数据集包含湖泊沉积物中休眠卵DNA的下一代测序补充数据，通过分析休眠卵DNA特征，反映湖泊富营养化状态。数据以单一表格文件形式呈现，用于支持相关研究的补充信息展示。 文件详解 文件名称：SupplementaryTable1_revision.xlsx 文件格式：XLSX...
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Genomic_repeat_abundances_phylogenetic_signal_系统发育分析数据
数据集概述 本数据集围绕基因组重复序列丰度的系统发育信号展开，包含3个附录文件。通过比较基于图的下一代测序读长聚类方法，估计不同类别基因组重复序列的丰度，并将其作为连续变化特征推断系统发育树。数据适用于6个案例（5种被子植物、1种昆虫）的系统发育分析，支持种间及属间关系研究。 文件详解 文件名称：Online Appendix 1.docx...
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Wolbachia_Read_mapping_NCBI_SRA_SRP091004_测序数据比对代码与QC数据
数据集概述 本数据集包含针对Wolbachia的下一代测序数据比对相关的代码、日志文件及质量控制（QC）数据，NCBI SRA登录号为SRP091004。Wolbachia测序并非项目核心目标，而是为最大化从以果蝇为宿主的原始基因组测序数据中提取的信息量而开展的工作。 文件详解 代码、日志文件及QC数据...
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ZooKeys_Supplementary_Material_1_双背甲马陆线粒体基因组测序研究数据_2016
数据集概述 本数据集为论文配套的补充材料1，包含双背甲马陆（Polydesmida目）的线粒体基因组测序相关补充表格。数据由下一代测序技术获得，是2016年发表于ZooKeys期刊的研究成果的补充支撑材料，用于记录和展示研究中的详细数据信息。 文件详解 补充表格文档 文件名称：oo_112696.docx 文件格式：DOCX...
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儿科肺炎克雷伯菌blaNDM_16b携带IncX3质粒首次鉴定数据集
数据集概述 本数据集包含儿科肺炎克雷伯菌中blaNDM-16b携带IncX3质粒的首次鉴定相关数据，涉及临床信息、下一代测序数据及基因序列文件，为研究该耐药质粒的跨物种传播及临床风险模式提供支持。 文件详解 Clinical Information.xlsx：Excel格式文件，为去标识化的临床信息数据文件，原含潜在可识别信息的Sample...
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酿酒酵母盐胁迫适应性实验室进化数据集
数据集概述 本数据集记录了酿酒酵母在盐胁迫下的实验室进化研究结果，包含3个重复品系经300代NaCl胁迫进化后的基因表达变化（微阵列分析）与遗传变化（下一代测序）数据，以及基因组倍性分析结果，为复杂多基因性状的进化适应研究提供支持。 文件详解 文件名称: README_for_Sequencing_Data_Dhar.tar.pdf 文件格式: PDF...
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女性与雌性犬乳腺癌液体活检诊断预后工具数据集
数据集概述 该数据集包含对女性与雌性犬乳腺癌液体活检中获得的基因变异的多项分析。研究收集了女性和雌性犬的核心活检及血浆样本，通过下一代测序（NGS）处理并提交至Genome Analysis ToolKit（GATK），旨在探究液体活检在乳腺癌诊断与随访中的有效性。 文件详解 数据文件： Table S2 Genetic variants...
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EPA_ng大规模并行进化序列定位数据集
数据集概述 该数据集与EPA-ng相关，EPA-ng是进化定位算法（EPA）的重新实现，用于解决宏遗传学中下一代测序（NGS）数据的可扩展性问题。数据包含相关补充文档和数据集压缩包，支持研究EPA-ng在宏遗传序列进化定位中的性能表现，为分子序列数据分析提供技术支持。 文件详解 文件名称: supplement.pdf 文件格式: PDF (.pdf)...
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VirAnimalOne_Based_动物病毒基因生物信息学分析完整数据
数据集概述 本数据集为VirAnimalOne项目的初步成果，包含生物信息学分析流程文档及配套数据表。项目聚焦于挖掘ENA/SRA数据库中宠物、 livestock及野生动物的组学数据，研究内容涉及冠状病毒序列识别、宿主基因变异与病毒易感性关联、宿主受体结构分析等方向。 文件详解 文件名称:...
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大麦属物种水平系统发育与多倍体关系数据集
数据集概述 本数据集围绕大麦属（Hordeum）物种的系统发育及多倍体关系展开，通过结合PCR与下一代测序技术，对13个基因座（含1个叶绿体基因和12个核单拷贝基因座）的序列数据进行分析，首次在单一分析中揭示所有二倍体和多倍体大麦属物种的系统发育及祖裔关系。 文件详解 文档文件：...
