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Hartfield_Otto_有害等位基因重组与搭车效应模拟数据_2011
数据集概述 本数据集为论文“Recombination and hitchhiking of weak deleterious alleles”的配套模拟数据,包含2个文件,涉及有害等位基因在低重组区域随有利等位基因搭车固定的概率计算及基因组模拟,用于研究有利突变对有害等位基因负荷的影响及重组谱系的存续效应,可支撑群体遗传学中选择信号与进化负荷的分析。...
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LUPA_Based_中国15个本土犬种基因组遗传多样性与选择信号研究数据
数据集概述 本数据集基于170K SNP芯片对15个中国本土犬种的169只无亲缘关系个体进行基因组分析,对比中国与西方犬种的基因组结构,包含群体结构、连锁不平衡模式、选择信号等核心内容,揭示中国本土犬种的遗传多样性特征及适应性进化机制,为复杂性状相关基因研究提供资源。 文件详解 文件名称:CW_ind_maf005_geno01_mind005.zip...
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Motacilla_alba_Based白鹡鸰亚种杂交区基因组与形态分化数据
数据集概述 本数据集聚焦白鹡鸰(Motacilla alba)alba与personata亚种杂交区,包含19,437个SNP位点的基因组数据及多种形态特征数据,通过3000公里样带分析表型分化对生殖隔离的作用,核心探究头部羽色等性状与基因组分化的关联及 assortative交配偏好的维持机制。 文件详解 文件名称:Sampling, genomic...
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Baoulé_Zebu_Based_布基纳法索杂交牛锥虫感染选择信号分析数据
数据集概述 本数据集基于Illumina Bovine SNP50芯片的高密度基因组标记,分析布基纳法索Baoulé与Zebu杂交牛的个体...
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King_Penguins_Based_亚南极王企鹅种群遗传分化与扩散研究数据
数据集概述 本数据集为亚南极王企鹅种群遗传分化与扩散研究的核心数据,包含通过RADSeq技术生成的5154个高覆盖度单核苷酸多态性(SNP)位点数据,覆盖福克兰群岛、南乔治亚、克罗泽群岛及麦夸里岛的王企鹅种群。数据用于分析种群遗传结构、扩散模式及殖民化历史,揭示跨数千公里海域的王企鹅种群遗传分化极轻微的特征,为物种保护规划提供依据。 文件详解...
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DRYAD_Data_Set_猴面花入侵种群基因组多样性与选择研究数据2014
数据集概述 本数据集为猴面花(Mimulus guttatus)入侵种群的基因组研究数据,包含10个英国入侵种群与12个北美本地种群的基因组重测序信息,通过分析单核苷酸多态性(SNP)位点,探究入侵种群的遗传多样性变化、地理起源及选择信号,涉及14条染色体的相关基因区域。 文件详解 文件名称:README_for_Data Set for...
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Echinolittorina_Based_滨螺壳雕多态性AFLP基因组扫描数据
数据集概述 本数据集包含滨螺Echinolittorina hawaiiensis壳雕多态性相关的AFLP基因组扫描数据,来自四个重复位点不同生境的光滑型和雕刻型螺类样本。数据用于检测选择信号,探讨广布海洋生物在分歧选择压力下的基因组分化,共含两个文件。 文件详解 文件名称:README_for_Tice&Carlon_JEB_data.txt...
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Konijnendijk_Based_三刺鱼小尺度盐度过渡带选择信号数据2015
数据集概述 本数据集包含三刺鱼在小尺度咸淡水过渡带的基因组选择信号研究数据,基于87个微卫星标记的基因组扫描结果,探索强基因流背景下相邻种群的局部适应机制,为理解弱生态差异下的自然选择基因组靶标提供支持。 文件详解 文件名称:Konijnendijk et al-EE-2015.xlsx 文件格式:XLSX...
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地方搭便车行为_全球搭便车现象_贻贝_Mytilus_edulis_种群分化遗传数据
数据集概述 本数据集包含海洋贻贝Mytilus edulis种群分化研究相关的遗传数据,用于区分局部 hitchhiking 和全局 hitchhiking 对种群遗传结构的影响。数据支持分析染色体区域遗传结构变化,验证全局 hitchhiking 假说在海洋无脊椎动物中的作用,共包含2个文件。 文件详解 序列文件...
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Walleye_Harvest_Associated_野生白斑狗鱼种群体型与基因组变化研究数据
数据集概述 本数据集记录了魁北克Mistassini湖三个捕捞种群及一个低捕捞参考种群15年间的体型、年龄及基因组变化,包含约9000个SNP位点的分析数据,结合原住民知识,揭示捕捞诱导的表型与遗传耦合变化,为渔业资源管理提供依据。 文件详解 VCF文件(2个) 文件名称:Bowles_et_al-...
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East_Adriatic_Sheep_X染色体_选择信号识别_畜牧基因组研究数据
数据集概述 本数据集记录东亚得里亚海绵羊X染色体的选择信号识别结果,包含8个克罗地亚本地绵羊品种(101只雌性、100只雄性)及10只摩弗伦羊的基因组数据,通过经典方法与新方法HRiD识别出14个选择信号及34个注释基因,为研究绵羊X染色体适应性基因提供支持。 文件详解 README_Overall.txt 文件格式:TXT...
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Labrador_Retriever_Based基因组数据_遗传结构与选择分析数据
数据集概述 本数据集为英国拉布拉多寻回犬基因组研究相关数据,包含群体结构、近交程度及选择信号分析结果,涉及犬只用途(工作、宠物、展示)、毛色与遗传分化的关联,以及颅面特征相关选择区域等内容,共包含2个文件。 文件详解 数据文件: 文件名称:final_data.xlsx 文件格式:XLSX...
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Picea_rubens_Source_红皮云杉空气污染适应性遗传选择信号研究数据
数据集概述 本数据集聚焦北美东部红皮云杉对空气污染的适应性遗传选择信号研究,通过36个候选基因分析气候与人为污染对林木基因组的选择压力。含5个地理种群、3个年龄组的遗传与环境关联数据,识别出与气候及硫酸盐污染相关的7个SNPs,其中气候相关信号在老年龄组最强,污染相关信号在年轻组最显著,为非模式林木物种适应性进化研究提供支撑。 文件详解...
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SheepGenetics_Based_瑞士本地绵羊品种纯合子运行与选择信号分析数据集
数据集概述 本数据集包含8个瑞士本地绵羊品种的基因组数据,涉及787只高密度SNP芯片(346,774个SNP)和939只中密度SNP芯片(33,828个SNP)基因型样本。通过分析群体结构、基于纯合子运行的基因组近交系数及选择信号,揭示品种间遗传多样性差异及候选基因功能,如体型、产羔数、毛色等性状相关基因。 文件详解...
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Populus_Speciation_更新世气候振荡触发的胡杨与灰叶胡杨物种形成研究数据
数据集概述 本数据集围绕更新世气候振荡触发的两种沙漠杨树(胡杨与灰叶胡杨)物种形成研究展开,包含60个个体的11个核基因座测序数据、样本分析代码等内容,用于估计物种分化时间、检测基因流及选择信号,揭示更新世气候对种间分化的影响。 文件详解 Populus euphratica sequence.zip 文件格式:ZIP...
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Momigliano_et_al_2017_Based_灰礁鲨遗传结构与选择信号研究数据集
数据集概述 本数据集包含灰礁鲨(Carcharhinus amblyrhynchos)的基因组研究数据,通过5517个核 SNPs 和线粒体 DNA 基因分析其遗传结构与选择信号。样本来自澳大利亚、印度尼西亚及印度洋远洋 reef,揭示地理隔离对基因流的影响、性别偏向扩散及局部适应的选择位点,为可持续管理提供基因组学依据。 文件详解...
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Crepidula_fornicata_Based_海洋软体动物基因组多态性研究数据_存档
数据集概述 本数据集为海洋软体动物Crepidula fornicata的基因组多态性研究数据,包含其原生地(西北大西洋)与入侵地(东北大西洋、东北太平洋)的种群遗传信息。数据覆盖7个原生种群和15个入侵种群的683个个体,通过微卫星和AFLP标记分析遗传多样性与选择信号,共含2个文件。 文件详解 README_for_MEC-12-0950.txt...
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紫海胆_Strongylocentrotus_purpuratus_在异常位点数据中的选择信号
数据集概述 本数据集包含紫海胆(Strongylocentrotus purpuratus)的基因序列数据,聚焦其在环境异质景观中适应性基因的选择信号。通过分析5个候选适应基因和2个中性基因,探究高扩散物种的局部适应机制,验证基因变异与温度等环境变量的关联,为理解异质环境下的选择模式提供支持。 文件详解...
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Iberian_Apis_mellifera_iberiensis_选择信号基因组扫描分析数据
数据集概述 本数据集为伊比利亚蜜蜂(Apis mellifera iberiensis)的基因组扫描分析结果,包含单核苷酸多态性(SNP)基因型数据及采样位置与环境变量信息,用于研究其适应性群体分化的遗传机制,识别受选择的基因组区域及与环境变量的关联,共含2个文件。 文件详解 SNP genotypes.txt 文件格式:TXT...



