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Passer_domesticus_Based_肯尼亚麻雀范围扩张表观遗传研究数据
数据集概述 本数据集围绕肯尼亚家麻雀约七十年范围扩张过程中的表观遗传潜力展开研究，包含五个区域的CpG位点数量及DNA甲基化数据。核心探索CpG位点数量在扩张前沿与核心区域的分布差异，分析其是否受选择驱动，以及DNA甲基化在扩张中的变化规律，为表观遗传机制推动物种扩张提供数据支撑。 文件详解...
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真核生物元转录组_基于高山土壤样本的真核生物转录组数据及其与生态系统功能的关联分析
数据集概述 本数据集通过宏转录组学方法研究两种积雪持续时间不同的高山土壤（晚融雪点LSM和早融雪点ESM）中真核微生物的基因表达，探索植物与土壤真核微生物的功能关联。数据集包含12个文件，涵盖转录组序列数据、注释说明及上下文数据，可用于分析土壤微生物代谢通路差异及生态系统功能关联。 文件详解...
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Ofu_Island_Reef_Lagoon_珊瑚热胁迫转录组弹性与白化抗性研究数据
数据集概述 本数据集为Ofu岛（美属萨摩亚）礁湖珊瑚热胁迫实验的转录组研究数据，包含20个Acropora hyacinthus珊瑚群体在29℃（对照）和35℃（加热）条件下暴露5小时、20小时后的白化情况与转录组响应数据，涉及基因表达调控、转录组弹性与白化抗性的关联分析，共8个文件。 文件详解 设计与原始数据文件...
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Eriophyoidea_Based_植食性瘿螨类高级系统发育与线粒体基因组研究数据
数据集概述 本数据集围绕植食性瘿螨类（Eriophyoidea）的高级系统发育研究展开，包含153种瘿螨的完整线粒体基因组测序结果，涉及54种线粒体基因重排模式。数据支持瘿螨类整体及内部6个分支的单系性，结合分子定年揭示其起源于三叠纪、白垩纪多样化的特征，与被子植物演化相关。 文件详解 README.txt 文件格式：TXT...
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Salmon_Hybridization_奇努克与银大麻哈鱼杂交繁殖与转录组研究数据
数据集概述 本数据集围绕奇努克与银大麻哈鱼的杂交潜力及后果展开，包含行为繁殖实验、体外受精实验结果及全转录组基因表达数据，用于分析两者间不完全的繁殖隔离机制及杂交后代的转录组响应，涉及18个相关文件。 文件详解 代码文件...
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Phasmid_Wings_Evolution_竹节虫翅膀进化可逆性宏进化分析数据集
数据集概述 本数据集为竹节虫翅膀进化可逆性的宏进化分析研究提供支持，包含超300种竹节虫的基因序列、系统发育树、性状数据及分析文件。数据用于探究复杂性状（翅膀）在进化中丢失后重新获得的可能性，揭示翅膀进化的动态可逆过程，支持物种分化速率与性状进化关系的研究。 文件详解 基因序列文件（.fasta格式，共8个） 12s.fasta：12S基因序列比对文件...
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Didimosphenia_geminata_Based_全球种群遗传多样性研究数据
数据集概述 本数据集包含硅藻Didimosphenia geminata的序列与形态数据，涉及全球多个地区种群。数据用于研究该物种的全球遗传多样性、地理分布格局及入侵机制，支持 phylogeographic 分析，探究其跨半球扩散与全球环境变化的关联。 文件详解 图像文件（.tif格式，12个文件）...
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OGRDB开放的种系受体数据库_小鼠BALB_c_ByJ品系IGKV基因胚系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的小鼠BALB/c/ByJ品系免疫球蛋白κ轻链可变区（IGKV）基因胚系参考集，包含基因序列及相关元数据，为免疫学研究提供标准化的基因参考数据。 文件详解 文件名称：licence.txt 文件格式：TXT...
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OGRDB_Based_小鼠LEWES_EiJ品系IGKV免疫球蛋白受体种系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的小鼠LEWES/EiJ品系免疫球蛋白κ链可变区（IGKV）受体种系参考集，包含4个文件，涵盖序列数据、元信息及许可文件，为免疫遗传学研究提供标准化的种系受体序列资源。 文件详解 EiJ IGKV_rev_1.json 文件格式：JSON...
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Pythium_Comparative_Genomics_植物病原卵菌毒力策略研究数据
数据集概述 本数据集包含十三种不等鞭毛类物种（含十一种植物病原卵菌）的比较基因组学分析数据，重点研究卵菌致病相关的基因组特征，如分泌效应子、细胞壁降解酶等毒力相关基因家族的扩张与差异，揭示不同卵菌（如疫霉属、腐霉属）的毒力策略演化机制，共含十二份文件。 文件详解 文档文件（.txt格式，共6个）...
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Genomic_basis_coral_climate_resilience_研究数据
数据集概述 本数据集聚焦珊瑚对气候变化的基因组适应性机制，通过RNA-Seq技术比较热敏和耐热珊瑚的转录组基因表达差异，识别与珊瑚抗逆性相关的分子通路，包括热休克蛋白、抗氧化酶等关键基因的表达特征，为理解珊瑚应对环境胁迫的生理机制提供基础数据。 文件详解 文件名称：33496_Ahyacinthus_CoralContigs.fasta.zip...
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North_Pacific_Based_港湾鼠海豚SNP微单倍型线粒体控制区单倍型数据
数据集概述 本数据集包含北太平洋港湾鼠海豚的SNP、微单倍型基因型及线粒体控制区单倍型序列数据，覆盖加州至不列颠哥伦比亚南部沿岸及内陆水域样本。通过292个位点的多重扩增子测序（271个样本）和mtDNA序列（413个样本），揭示种群遗传结构、隔离距离模式及潜在适应性，为该近岸物种保护管理提供依据。 文件详解...
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CPR_Genome_Subset_Jaffe_et_al_2020_微生物基因组数据
数据集概述 本数据集为Jaffe et al. 2020论文相关的候选门辐射（CPR）基因组子集，内容为CPR微生物的基因组序列数据，以压缩包形式存储，可用于微生物基因组学研究。 文件详解 压缩包文件 文件名称：jaffe_et_al_cpr_genomes.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：压缩包内包含与Jaffe et al....
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Triturus_Based_平衡致死系统比较基因组学研究数据_Version_1_0
数据集概述 本数据集记录了用于研究Triturus蝾螈平衡致死系统比较基因组学的生物信息学流程，包含连锁图谱、目标捕获序列、原始数据关联信息及分模块研究内容压缩包，支持对该特殊遗传系统的进化机制分析，共含4个核心文件。 文件详解 文件名称：Triturus and Lissotriton Linkage Maps.xlsx 文件格式：XLSX...
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Amplicon_sorter_Based_无参考扩增子排序与共识序列构建工具配套数据
数据集概述 本数据集为Amplicon_sorter工具的配套数据，该工具用于基于序列相似性和长度对Oxford Nanopore Technologies（ONT）测序的扩增子进行无参考排序，并构建高质量共识序列。数据集包含6个文件，支持工具的使用与验证，适用于生态学研究中扩增子测序数据的分析。 文件详解 README.txt 文件格式：TXT...
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Tympanuchus_cupido_Based_草原松鸡免疫基因选择漂变对比研究数据
数据集概述 本数据集为草原松鸡免疫基因研究数据，包含主要组织相容性复合体（MHC）等免疫受体基因与免疫介导基因的序列、基因型及种群比较数据，用于验证不同功能免疫基因在选择与遗传漂变上的差异假设，涉及9个相关文件。 文件详解 序列与基因型文件 文件名称：T. cupido MHC class II sequences alignment.fasta、T....
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Brachycephalus_Bd_GPL_Brazil_两栖动物宿主免疫反应研究数据
数据集概述 本数据集是论文“Host immune responses to enzootic and invasive pathogen lineages vary in magnitude, timing, and efficacy”的第二次发布版本，用于Zenodo存档。包含18个文件，涉及Brachycephalus pitanga暴露于Bd-...
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Dryad_Based_Tarchonantheae族分子系统发育与生物地理学研究数据
数据集概述 本数据集来自论文“Out of Africa to Madagascar - then back? Molecular phylogenetics and biogeography of tribe...
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Peromyscus_leucopus_Based_白足鼠城市与农村种群转录组资源数据
数据集概述 本数据集为白足鼠（Peromyscus leucopus）的转录组资源，包含通过454和SOLiD 5500XL平台测序组装的参考转录组、注释信息、SNP、SSR标记及基因表达差异分析结果，用于研究城市与农村种群的生态遗传分化及对城市化的进化响应，共9个文件。 文件详解 转录组序列文件...
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Siegel_Lab_Based_布氏锥虫Tb427菌株基因组组装流程数据0_0_3版
数据集概述 本数据集为布氏锥虫Lister 427菌株（Tb427）的基因组组装数据，包含0.0.3版本发布的v12和v11两个版本的基因组组装文件。v12版本提供了不同类型的组装形式（coreA、coreB、二倍体、二倍体 scaffolded），v11版本包含二倍体 scaffolded组装，所有组装文件均附带序列和注释信息。 文件详解...
