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OGRDB_Based_小鼠AKR_J品系IGKV基因胚系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠AKR/J品系的IGKV基因胚系参考序列集，包含未加间隙、加间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可文件，共4个文件，由Open Germline Receptor Database（OGRDB）发布，用于免疫学领域基因序列相关研究。 文件详解 未加间隙序列文件 文件名称：J...
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Alvinella_pompejana_热液喷口多毛类种群分化研究数据
数据集概述 本数据集来自深海热液喷口多毛类Alvinella pompejana种群分化研究，包含1个线粒体基因和11个核基因的DNA序列数据，覆盖该物种已知分布范围（东太平洋海隆23°N至太平洋南极海隆38°S）的10个热液喷口采样点。数据用于分析赤道和复活节微板块边界对种群地理分化的影响，揭示遗传多样性与构造扩张速率的相关性，共包含2个文件。...
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CRAB_基于基因组学的AMPSUL_CAZAVI联合用药机制模型数据
数据集概述 本数据集包含针对产金属β-内酰胺酶的碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌（CRAB）的抗生素联合用药研究数据，涉及AMP/SUL与CAZ/AVI联合用药的药效动力学分析、机制模型构建及菌株基因组信息，支持耐药菌治疗策略的研究。 文件详解 AMA133.fasta 文件格式：FASTA...
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arch_3_In_silico_Based_古紫质3结构预测建模文件包
数据集概述 本数据集包含使用Medeller和RosettaCM算法预测古紫质3（arch-3）蛋白质结构所需的全部文件，支持从序列比对、模板处理到结构建模、优化及结果评估的完整流程，可用于生物信息学领域的蛋白质结构预测研究。 文件详解 核心输入文件 文件名称：P96787.fasta、1UAZ.fasta 文件格式：FASTA...
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Betula_Based阿拉斯加基奈半岛桦树全基因组测序研究数据2019
数据集概述 本数据集为阿拉斯加基奈半岛桦树（Betula）的全基因组测序数据，旨在探究1899年被描述后身份仍存疑的Kenai桦树（Betula kenaica）的物种信息。包含2019年8月采集的2份桦树标本（BK01为Betula kenaica、BP01为Betula pendula subsp....
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OGRDB_Source_小鼠CAST_EiJ品系IGH基因胚系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠CAST/EiJ品系的IGH基因胚系参考序列，发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）。包含无间隙、有间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可证文件，共4个文件，可用于免疫受体基因的序列分析与研究。 文件详解 EiJ IGH_rev_1_ungapped.fasta...
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Arbacia_lixula_Based_地中海海胆组织转录组与基因表达数据
数据集概述 本数据集为地中海生态关键物种Arbacia lixula的转录组与基因表达数据，包含体组织（体腔细胞、消化组织）和生殖组织（卵巢、睾丸）的转录组测序结果，以及从头组装的参考转录组和差异表达分析结果，共186084条转录本，可用于研究该物种的组织特异性基因表达及进化适应机制。 文件详解 Arbacia...
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Pool_Seq_Inference_果蝇自然与实验室种群染色体倒位动态数据
数据集概述 本数据集基于Pool-Seq技术，提供用于推断黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）7种世界性染色体倒位频率的诊断标记SNP数据。数据应用于实验进化研究及北美、澳大利亚纬度渐变群分析，揭示倒位频率的选择动态与地理分布模式，是研究果蝇种群染色体倒位演化的关键资源。 文件详解...
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OGRDB_Published_小鼠C3H_HeJ品系IGLV种系基因参考集
数据集概述 本数据集是小鼠C3H/HeJ品系的IG受体种系基因参考集，包含IGLV基因的间隙型、无间隙型序列文件、许可文件及JSON文件，由Open Germline Receptor Database（OGRDB）发布，共4个文件，支持免疫遗传学领域的基因序列研究。 文件详解 HeJ IGLV_rev_1_gapped.fasta...
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OGRDB_Based_NOD_ShiLtJ小鼠IGKV种系受体基因参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的小鼠NOD/ShiLtJ品系IGKV基因座的种系参考集，包含4个相关文件，覆盖基因序列、元数据及许可说明三类文件类型，为免疫学研究提供标准化的基因参考数据。 文件详解 许可文件 文件名称：licence.txt 文件格式：TXT...
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Dryad_Myrmelachista_Based蚁_植物共生趋同演化研究数据
数据集概述 本数据集为蚁-植物共生系统趋同演化研究相关数据，包含Myrmelachista属蚂蚁的超保守元件（UCE）基因组学数据、祖先状态重建文件、系统发育树文件等。研究通过分子系统发育分析揭示该属蚂蚁从机会主义到专性共生的独立演化事件，支持趋同演化假说，共包含七个文件。 文件详解 说明文档 文件名称：README.md 文件格式：MD...
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AutoFixMark_Based_精选化能自养生物基因组列表及蛋白质序列数据
数据集概述 本数据集包含359个精选化能自养生物基因组的列表，其中347个用于AutoFixMark工具的基准测试。数据集提供了这347个基因组的蛋白质序列FASTA文件，文件来源于NCBI RefSeq和INSDC，共包含2个文件，无目录结构。 文件详解...
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Selasphorus_sasin_Based_艾伦蜂鸟南加州种群基因研究数据
数据集概述 本数据集围绕加州艾伦蜂鸟（Selasphorus sasin）的三个种群（迁徙型、南加州大陆定居型、海峡群岛定居型）开展基因研究，通过单核苷酸多态性（SNP）分析探究其遗传关系，核心发现南加州大陆种群为两个亚种的杂交后代。数据集包含基因数据、样本信息、分析代码等11个文件，支持种群基因组学分析。 文件详解 数据文件...
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Coghlan_Based_中药DNA毒理重金属多维度审计工具包数据_2015
数据集概述 本数据集为中药药物警戒审计工具包相关数据，通过DNA测序、毒理学检测及重金属筛查多学科方法，对26种中药的分子成分进行评估，揭示成分替换、污染物及未申报药物等问题，为中药监管提供技术支持。 文件详解 文件名称：Coghlan et al 2015 fasta files.zip 文件格式：ZIP（压缩包）...
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OGRDB_打开小鼠种系基因组数据库_BALB_c小鼠IGH受体种系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠BALB/c亚群的IGH受体种系参考集，由Open Germline Receptor Database（OGRDB）发布。包含IGH受体基因的种系序列数据及相关说明文件，共4个文件，支持免疫遗传学领域对小鼠BALB/c亚群IGH受体基因的研究与分析。 文件详解 许可文件： 文件名称：licence.txt 文件格式：TXT...
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OGRDB_Based_小鼠CAST_EiJ品系IGLV免疫受体种系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠CAST/EiJ品系的IGLV免疫受体种系参考数据，发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB），包含种系序列的带间隙、无间隙Fasta文件、JSON格式数据及许可文件，共4个文件，支持免疫受体相关的生物信息学研究。 文件详解 EiJ IGLV_rev_1.json 文件格式：JSON...
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Sardina_pilchardus_Based欧洲沙丁鱼线粒体基因组研究数据
数据集概述 本数据集包含欧洲沙丁鱼（Sardina pilchardus）线粒体基因组相关的测序与分析文件，涵盖139个个体的全线粒体基因组序列、13个线粒体基因序列，以及60个欧洲沙丁鱼和3个沙丁鱼属样本的12个线粒体基因序列，支持系统发育分析与进化研究。 文件详解...
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Xcc_BrA1_Genome_Transcriptome_Based铜胁迫研究数据
数据集概述 本数据集包含实验室重测序的Xcc菌株BrA1基因组拼接contigs、基因组注释文件，以及铜胁迫转录组研究中通过Trinity从头组装的差异表达基因（DEG）转录本。数据来自Behlau et al 2017的菌株，采用混合RNA-seq分析流程生成，共包含5个文件，支持Xcc菌株基因功能与铜胁迫响应机制研究。 文件详解...
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OGRDB_Source_小鼠DBA_2J品系IG轻链可变区受体胚系参考数据集_V1
数据集概述 本数据集为小鼠DBA/2J品系的免疫球蛋白轻链可变区（IGLV）受体胚系参考数据集，发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）。包含胚系序列的带间隙、无间隙FASTA文件、JSON格式数据及许可文件，共4个文件，支持免疫受体胚系序列的相关研究与分析。 文件详解 licence.txt 文件格式：TXT...
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Salmon_Hybridization_奇努克与银大麻哈鱼杂交繁殖与转录组研究数据
数据集概述 本数据集围绕奇努克与银大麻哈鱼的杂交潜力及后果展开，包含行为繁殖实验、体外受精实验结果及全转录组基因表达数据，用于分析两者间不完全的繁殖隔离机制及杂交后代的转录组响应，涉及18个相关文件。 文件详解 代码文件...
