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Lung_Microbiota_Pulmonary_Fibrosis_肺微生物群促凋亡肽抑制实验数据
数据集概述 本数据集包含肺纤维化急性加重相关实验数据，涵盖针对corisin的单克隆抗体表位作图芯片数据、新分离溶血葡萄球菌菌株（1b、7b、12b）的完整蛋白序列，以及所有图表的原始数据，共8个文件，用于支持肺微生物群衍生促凋亡肽抑制作用的研究。 文件详解 芯片数据文件（共5个） 文件名称：Microarray Data Rat mAtb...
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TransadriaticNiphargus_Based_亚得里亚海地下端足类系统发育与生物地理数据
数据集概述 本数据集为亚得里亚海两侧地下端足类（Niphargus属）的生物地理研究数据，包含系统发育分析、物种界定、生物地理模型构建等相关文件，用于验证海退-海侵循环对端足类分布模式的影响，支持“扩散-隔离交互作用塑造分布”的结论，共9个文件。 文件详解 系统发育分析文件...
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Francisella_tularensis_Based_临床样本全基因组捕获测序数据_原始与组装数据
数据集概述 本数据集包含土拉弗朗西斯菌的RNA寡核苷酸诱饵设计文件及17个样本的基因组组装数据。诱饵设计针对该菌染色体和质粒，排除人类同源序列；组装数据含17个样本的基因组序列及组装统计元数据，支持从临床样本直接进行全基因组捕获测序的验证与应用研究。 文件详解 Francisella_tularensis_RNA_baits_INSA_PT.tsv...
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Eimeria_Mitochondrial_Based澳大利亚鸡艾美耳球虫线粒体基因组物种多样性研究数据
数据集概述 本数据集包含澳大利亚鸡艾美耳球虫的25个完整线粒体基因组数据，涉及该国已知的10个物种（含OTU-X、-Y、-Z）。数据支持艾美耳球虫物种的遗传多样性分析及系统发育研究，显示澳大利亚菌株遗传多样性较低，为疫苗有效性评估提供依据。 文件详解 README文档...
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Porites_Identification_Based_印度洋西部多孔鹿角珊瑚白斑综合征病原菌鉴定数据
数据集概述 本数据集为印度洋西部多孔鹿角珊瑚白斑综合征（PWPS）病原菌鉴定研究相关数据，包含16S rRNA基因、pyrH基因等的序列文件、系统发育树文件、细菌培养及感染试验相关数据文件，用于支持PWPS病原菌的分离、鉴定及温度依赖性分析。 文件详解 基因序列文件（.fasta格式，共5个） 文件名称：PWPS bacterial...
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Rhithrogena_Heptageniidae_Based欧洲高山蜉蝣分子系统发育与分化时间研究数据
数据集概述 本数据集为欧洲高山Rhithrogena蜉蝣的分子系统发育与分化时间研究数据，包含线粒体和核基因序列、系统发育树文件、贝叶斯分析输入输出文件及R脚本等31个文件，覆盖物种分类、演化关系及分化时间等核心研究内容，支持物种群定义、分化速率及祖先状态重建等分析。 文件详解 基因序列文件 格式：FASTA...
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Marasmius_Based_Marasmius_oreades基因组组装v2_连锁图谱与重复序列库数据
数据集概述 本数据集包含Marasmius oreades（仙环蘑菇）基因组组装v2的遗传连锁图谱和重复序列库，支持该物种基因组的重新组装、基因与重复序列预测，为突变积累研究提供自然模型系统的基础数据，共包含3个文件。 文件详解 Maror2.repeat.library.2.2.fasta 文件格式：FASTA 字段映射介绍：包含Marasmius...
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Marbled_crayfish_genes_Stein_et_al_2022_大理石纹小龙虾基因序列档案
数据集概述 本数据集为Stein等人2022年研究中发现的大理石纹小龙虾新基因序列档案，对应论文《Combining old and new tricks: the study of genes, neurons, and behavior in...
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Campylobacter_virulence_genes_db_弯曲杆菌毒力相关基因核苷酸与蛋白质数据库
数据集概述 本数据集包含334个弯曲杆菌毒力相关基因的核苷酸与蛋白质数据库，共3个文件。核心内容为毒力相关基因的详细信息，包括基因来源菌株、基因座标签、基因及蛋白质长度、毒力因子类别分类，以及相位变异基因标识和其功能性蛋白质序列，支持通过BLAST工具进行基因搜索与功能分析。 文件详解 database_information.xlsx...
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Hyla_splendens_Based_Gastrotheca分类学澄清与Bolivian种群挑战数据集
数据集概述 本数据集为论文配套数据，包含用于澄清Hyla splendens物种身份及挑战Bolivian地区Gastrotheca种群分类学的相关信息，涵盖序列数据、系统发育树及地理溯源信息，共3个文件，支持两栖动物分类学研究。 文件详解 文件名称：16S sequences used - Koehler et al Gastrotheca...
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Cactophilic_Drosophila_Genomes_Based_嗜仙人掌果蝇物种基因组及注释数据
数据集概述 本数据集包含嗜仙人掌果蝇物种的基因组序列、基因注释、转座元件（TE）注释及质量控制数据，用于支持“转座元件促进嗜仙人掌果蝇宿主转移相关基因进化”的研究。数据集涵盖多种果蝇物种的基因组组装、注释文件及测序质量控制文件，共27个文件，是研究果蝇基因组进化与功能的基础数据资源。 文件详解 基因组组装文件...
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Daphnia_similoides_sinensis_Based_中华拟同形溞Hox基因cDNA序列数据集
数据集概述 本数据集包含中华拟同形溞的14个Hox基因cDNA序列数据，这些基因是后生动物重要的转录调控因子，参与生物生长发育。数据来源于前期转录组研究，可用于分析铜绿微囊藻对中华拟同形溞亲代及子代Hox基因表达的影响，共包含2个文件。 文件详解 文件名称：README_file_for_describe_dataset.xlsx 文件格式：XLSX...
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Prochlorococcus_Single_cell_Genomics_野生原绿球藻亚群研究数据_2014
数据集概述 本数据集为Kashtan et al 2014年研究的补充数据，通过单细胞基因组学技术揭示野生原绿球藻中数百个共存亚群的基因组多样性。包含基因序列比对文件、映射表、复合基因组文件等，共9个文件，用于展示原绿球藻亚群的核心基因等位基因与柔性基因组合特征。 文件详解 序列比对文件（.fasta格式，共5个）...
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Fragile_foundations_Based_长期微气候影响下细木质残体与土壤细菌群落演替模式研究数据集
数据集概述 本数据集为论文配套的序列数据与元数据，聚焦长期微气候影响下细木质残体和土壤中细菌群落的演替模式，包含2012年样本的信息表及序列文件，共2个文件，用于支撑相关微生物生态学研究。 文件详解 Sample_info_for_2012_samples.xlsx 文件格式：XLSX...
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Development_validation_high_throughput_非模式物种序列标记设计与分析数据
数据集概述 本数据集围绕非模式物种序列标记的开发、验证及高通量分析展开，提供了适用于无参考基因组物种的遗传标记设计框架相关数据，包含标记序列、基因型数据、生物信息学脚本及参考序列等，可支持群体遗传学、系统发育学研究中标记的应用与分析。 文件详解 VCF_files.tar 文件格式：TAR（压缩包）...
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位点与谱系异质性下不变量与经典四元组推断数据集
数据集概述 本数据集围绕位点与谱系异质性下的系统发育四元组推断展开，包含相关研究的附录文档、代码说明及数据压缩包，为比较不变量方法与经典系统发育重建方法（如邻接法、最大似然法）的性能提供数据支持。 文件详解 README_for_Erik2.txt:...
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烟草天蛾基因组从头组装数据集
数据集概述 本数据集提供烟草天蛾（Manduca sexta）的新参考基因组JHU_Msex_v1.0，通过现代技术从头组装，提升连续性、准确性和完整性。基因组大小470 Mb，连续性为原版本的约25倍，scaffold N50超14 Mb，注释含25,256个基因，可供公开使用。 文件详解...
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Galaxy平台MaxQuant与Msstats无标记分析训练数据集
数据集概述 该数据集包含用于Galaxy平台上MaxQuant和Msstats分析的输入文件及中间结果，围绕皮肤癌组织样本展开，为相关训练提供数据支持。 文件详解 主文件列表： input_protein_database.fasta：FASTA格式，MaxQuant分析所需的人类蛋白质数据库文件...
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五桠果属五桠果高质量基因组组装数据集
数据集概述 本数据集提供五桠果（Dillenia turbinata）的染色体级高质量基因组组装及注释结果。五桠果属于五桠果目，是理解被子植物演化的关键类群。基因组组装长度约7.24亿碱基对，BUSCO完整性达97%，包含36,967个蛋白编码基因模型，为比较与演化基因组学研究提供核心资源。 文件详解 文件名称: README.md，格式:...
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代谢型谷氨酸受体4靶向癌症免疫治疗研究数据集
数据集概述 本数据集围绕代谢型谷氨酸受体4（GRM4）在癌症免疫治疗中的作用展开，包含基因敲除、药物抑制实验及单细胞测序等相关数据，支撑GRM4靶向作为癌症免疫治疗新策略的研究结论。 文件详解 差异表达基因数据文件：...
