MARV_Genomic_Based密码子使用进化分析数据

数据集概述

本数据集为马尔堡病毒(MARV)基因组密码子使用模式的分析数据,包含病毒全核苷酸序列及密码子分析结果。通过多种分析方法探究突变压力、自然选择及宿主(人类、埃及果蝠)对MARV密码子使用的影响,揭示其进化机制,共包含2个文件。

文件详解

  • 文件名称:marburg.full.nucleotide.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含马尔堡病毒完整基因组的核苷酸序列,示例内容为GenBank登录号EF446132.1对应的病毒全基因组序列片段,以FASTA格式存储,含序列标识及核苷酸碱基信息。
  • 文件名称:Marburg.codon.analysis.output.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含密码子使用分析结果,可能涵盖核苷酸组成、相对同义密码子使用(RSCU)、有效密码子数、奇偶规则2分析等统计数据,反映突变压力、自然选择及宿主对MARV密码子使用的影响。

数据来源

论文“Genomic analysis of codon usage shows influence of mutation pressure, natural selection, and host features on Marburg virus evolution”

适用场景

  • 病毒进化机制研究:分析突变压力、自然选择对马尔堡病毒密码子使用模式的影响,揭示其进化规律。
  • 宿主-病毒相互作用分析:探究人类与埃及果蝠对MARV密码子使用的选择压力差异。
  • 病毒基因组特征研究:基于核苷酸序列及密码子分析数据,解析MARV基因组的碱基偏好性及密码子使用 bias。
  • 病毒适应性进化研究:为马尔堡病毒对宿主环境的适应性进化机制提供数据支持。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.95 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。