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ABC_Inference_Based_多群体分化与基因流推断研究数据
数据集概述 本数据集为基于近似贝叶斯计算(ABC)的三群体分化与基因流推断研究相关文件,包含模拟脚本、分析脚本、实例数据脚本及ms命令行示例文本,用于验证ABC框架在群体基因组数据中的模型选择与参数估计效果,支持探索不同采样策略对推断质量的影响。 文件详解 模拟脚本文件: 文件名称:simulation-scripts.zip 文件格式:ZIP...
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Hokkaido_Japan_北海道人工林保留阔叶树对鸟类影响实验数据
数据集概述 本数据集为日本北海道中部针叶林采伐时保留天然更新阔叶树的操控实验数据,包含采伐前1年及采伐后连续3年的鸟类调查结果,通过分层群落模型分析保留阔叶树对森林鸟类种群的影响,验证土地共享策略在人工林生物多样性保护中的有效性。 文件详解 README.docx:DOCX格式,实验背景、设计及数据说明文档...
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Matsumura_Based_地球外核液态铁状态方程贝叶斯建模输入数据
数据集概述 本数据集为Matsumura等人研究地球外核液态铁状态方程的贝叶斯建模输入数据,包含一份Excel文件,无训练测试、数据标签或原始处理数据的拆分,可用于地球物理领域液态铁状态方程的贝叶斯建模分析。 文件详解 文件名称:InputData.xlsx 文件格式:XLSX...
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QUDOS_2015_Based_软件性能模型参数估计自动化工具支持数据
数据集概述 本数据集是论文“Filling the Gap: A Tool to Automate Parameter Estimation for Software Performance Models”的配套数据,用于支持论文中提出的软件性能模型参数估计自动化工具的研究结果。数据集以单一压缩包形式提供,无分层目录结构。 文件详解...
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PLOS_One_Based_HIV病毒衰减第二阶段药物限制隔间感染研究数据
数据集概述 本数据集围绕HIV病毒衰减第二阶段的替代解释展开,通过病毒动力学模型探究短期存活细胞在药物限制隔间中的感染机制。包含13个.mat格式的模型参数文件和1个.docx格式的文件描述文档,总计14个文件,用于模型构建、参数估计及数值实验分析。 文件详解 科学数据文件(.mat格式,13个)...
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QE_VIRUNGA_Based_伊丽莎白女王国家公园非洲狮种群密度估计数据
数据集概述 本数据集包含伊丽莎白女王国家公园(QE)非洲狮种群密度的关键参数估计数据,采用空间显式搜索相遇法,记录了93天内8243.5公里的搜索努力,检测到30只个体狮子,分析其种群密度、家域范围、性别比例等指标,揭示该区域狮子种群的濒危状态及人为猎物枯竭的影响。 文件详解 数据文件(CSV格式,共4个)...
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BAMM_Supplementary_Data_宏进化混合分析理论性能评估数据
数据集概述 本数据集为BAMM(宏进化混合贝叶斯分析)理论与性能评估的补充数据。BAMM用于估计系统发育树分支的多样化速率参数并推断速率变化位置,数据集聚焦其理论误差与统计问题的验证,包含1个压缩文件。 文件详解 文件名称:supplementary_data.zip 文件格式:ZIP...
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Johnson_Benson_Grin_Based暗物质晕浓度随机游走模型参数数据
数据集概述 本数据集包含Johnson, Benson & Grin(2020)提出的暗物质晕浓度随机游走模型相关的MCMC链文件和最大似然模型参数文件,共六十六个文件,用于支持该模型的参数分析与验证。 文件详解 MCMC链文件...
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phenotypic_evolution_rate_表型进化速率测量与模式研究数据
数据集概述 本数据集是论文“Measuring rates of phenotypic evolution and the inseparability of tempo and...
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NTLH_Model_Misspecification_进化生态学中性理论检验数据
数据集概述 本数据集用于复现论文“Wolf in sheep's clothing: model misspecification undermines tests of the neutral theory for life...
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Heredity_Population_divergence_种群分化与混合模型ABC方法遗传数据
数据集概述 本数据集包含论文所用的遗传数据分析文件,聚焦种群分化与混合模型选择。通过近似贝叶斯计算(ABC)方法,分析微卫星数据以区分种群分化(无混合)与混合模型,验证了20个位点数据可高准确率识别生成模型,并应用于伊比利亚淡水鱼类种群遗传模式研究。 文件详解...
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phylocurve_Package_Based_高维系统发育比较模型参数估计数据
数据集概述 本数据集为高维系统发育比较模型参数估计相关数据,聚焦距离法在高维性状进化研究中的局限性,提出基于参数自举和最大伪似然估计的替代方法,支持复杂进化模型参数估计、多假设结合等功能,相关方法已实现于R包phylocurve,数据集包含1个压缩文件。 文件详解 文件名称:sim_scripts.zip 文件格式:ZIP...
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DRYAD_Source_Salix_melanopsis_系统地理学模型选择研究数据
数据集概述 本数据集为Salix melanopsis(一种分布于西北太平洋沿岸及内陆的河岸柳属植物)的系统地理学研究数据,包含通过序列捕获探针和Illumina测序获得的400余个基因座数据,用于评估先验系统地理学假说、进行模型选择及参数估计,揭示其冰后期扩散及避难所动态。 文件详解 文件名称:DRYAD-Smel.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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Spatially_explicit_Based_历史种群遗传推断空间显式汇总统计数据
数据集概述 本数据集包含用于历史种群遗传推断的空间显式汇总统计相关数据,涵盖新空间统计量的介绍与评估,以及通过空间显式种群动态模拟SNP数据得到的结果。这些统计量结合空间遗传算法,可捕捉遗传变异的空间分布与自相关性,用于优化种群历史模型选择与参数估计,弥补传统统计量忽略空间信息的局限。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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SXS_BBH_1910_Simulation_Based_双黑洞系统模拟数据_原始实验
数据集概述 本数据集为SXS:BBH:1910双黑洞系统模拟数据,由SpEC代码生成,包含36个文件,涵盖.h5和.json两种格式,各占百分之五十。数据记录了双黑洞系统的演化信息,包括应变数据、视界面数据、额外波形数据及元数据等,是研究双黑洞合并及引力波特性的基础数据。 文件详解 .h5格式文件(共18个)...
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Phylogenies_Speciation_Based_物种形成持续时间系统发育估计研究数据
数据集概述 本数据集为物种形成持续时间系统发育估计研究的支持数据,包含实现 protracted 物种形成模型参数估计的方法及模拟分析结果。通过模拟现存物种系统发育树,研究物种形成起始率、灭绝率、完成率及持续时间的估计效果,并应用于灵长类系统发育案例。数据集含2个文件,支持相关模型参数计算与模拟分析。 文件详解...
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Champaign_Urbana_Human_Bird_美国伊利诺伊州居民互动调查数据_2023
数据集概述 本数据集为2023年美国伊利诺伊州尚佩恩-厄巴纳地区居民人鸟互动调查结果,采用"投放-回收"法收集数据,包含调查数据文件与分析代码文件各1份,共2个文件,用于研究该地区人与鸟类的互动关系。 文件详解 数据文件 文件名称:DOPU_Survey_For_Zenodo.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:包含2023年尚佩恩-...
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Penalized_Likelihood_Occupancy_Models_参数估计优化研究数据
数据集概述 本数据集是论文“Penalized likelihood methods improve parameter estimates in occupancy...
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Penalized_Likelihood_Based_高维系统发育比较方法及新世界猴脑进化应用数据
数据集概述 本数据集围绕高维系统发育比较方法展开,包含惩罚似然框架的理论方法及应用案例。框架用于解决高维性状(p)接近或超过物种数量(n)时的参数估计与模型比较问题,支持BM、EB、OU等进化模型分析。应用案例以新世界猴脑形态三维数据为例,验证方法有效性,数据集含补充材料与代码文件。 文件详解 补充材料文件...
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FLP_Ornstein_Uhlenbeck_极乐鸟性选择辐射Fisher_Lande过程研究数据
数据集概述 本数据集围绕Fisher-Lande过程(FLP)模型能否解释极乐鸟等性选择辐射展开研究,包含支持模型验证、性状分析及参数估计的相关文件,涉及极乐鸟属的系统发育拓扑、雄性翅膀性状数据、实测数据文档及R脚本等内容。 文件详解 文件名称:topo7.txt 文件格式:TXT...



