ABC_Inference_Based_多群体分化与基因流推断研究数据

数据集概述

本数据集为基于近似贝叶斯计算(ABC)的三群体分化与基因流推断研究相关文件,包含模拟脚本、分析脚本、实例数据脚本及ms命令行示例文本,用于验证ABC框架在群体基因组数据中的模型选择与参数估计效果,支持探索不同采样策略对推断质量的影响。

文件详解

  • 模拟脚本文件:
  • 文件名称:simulation-scripts.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 内容说明:包含用于模拟三群体分化与基因流历史数据的脚本,通过msABC工具指定模拟过程中的统计量计算参数。
  • 分析脚本文件:
  • 文件名称:analysis-scripts.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 内容说明:包含对模拟数据及实例数据进行ABC模型选择与参数估计的分析脚本。
  • 实例数据脚本文件:
  • 文件名称:Bpal-scripts.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 内容说明:包含橡树瘿蜂(Biorhiza pallida)数据的应用分析脚本,用于展示ABC方法的实际应用。
  • ms命令行示例文件:
  • 文件名称:ms-lines.txt
  • 文件格式:TXT
  • 内容说明:提供模拟研究中7种模型对应的ms命令行示例,说明模拟过程的参数设置。

适用场景

  • 群体基因组学研究:用于推断非模式生物的群体分化历史与基因流事件。
  • 近似贝叶斯计算方法验证:测试ABC框架在模型选择与参数估计中的性能。
  • 采样策略优化:探索不同位点数量、位点长度及个体数量对群体历史推断质量的影响。
  • 生物信息学方法应用:以橡树瘿蜂数据为例,展示ABC方法在实际研究中的应用流程。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.11 MiB
最后更新 2026年1月23日
创建于 2026年1月23日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。