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Faster_X_Effects_Based_果蝇X染色体与常染色体进化速率比较研究数据
数据集概述 本数据集为研究果蝇X染色体快速进化效应的相关数据,包含黑腹果蝇和拟暗果蝇两个类群的全基因组编码序列进化率分析结果,涉及X染色体与常染色体基因座的适应性替换差异,以及拟暗果蝇类群中祖先X染色体与常染色体融合事件对基因进化的影响,共含一个文件。 文件详解 文件名称:Alignments.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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Greater_Flamingo_MHC_Class_IIB_Diversity研究数据
数据集概述 本数据集记录了地中海地区四个繁殖群中116只大火烈鸟的MHC IIB基因分型数据,包含2个基因座的109个等位基因信息。数据用于研究该种群MHC基因多样性及空间分化情况,发现其具有极高的基因多样性且无种群结构差异,为分析病原体介导的选择机制提供支持。 文件详解...
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Astyanax_mexicanus_Based_墨西哥丽脂鲤洞穴与表层种群基因型研究数据
数据集概述 本数据集聚焦墨西哥丽脂鲤(Astyanax mexicanus)洞穴、表层及杂交种群的基因型信息,包含2个文件。核心数据为ABI3730测序仪输出的片段大小或基因型数据,对应Borowsky 2022研究中表2的原始数据,涉及M1、M2、M3等基因座,用于探究种群分化维持机制及选择对表型的影响。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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INNUENDO_Based_小肠结肠炎耶尔森氏菌wgMLST与cgMLST数据_2018
数据集概述 本数据集包含小肠结肠炎耶尔森氏菌的全基因组多位点序列分型(wgMLST)和核心基因组多位点序列分型(cgMLST)方案及相关数据。数据基于2018年8月检索的252个公开基因组和79个INNUENDO项目新菌株,经INNUca组装、chewBBACA处理后形成,含元数据、基因组组装结果、MLST方案文件及等位基因谱。 文件详解 元数据文件...
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Integrative_Based_Heuchera_longiflora物种分化研究数据
数据集概述 本数据集为Heuchera longiflora物种分化研究的整合分析数据,包含56个种群的7个分子标记及12个代表性种群的277个核标记数据,通过Sanger测序和NGS技术结合形态学数据,识别该物种的初始谱系,为种下分类单元界定提供证据支持。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,6个文件)...
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Enterobase_Source_沙门氏菌cgMLST方案chewBBACA适配数据2018
数据集概述 本数据集为沙门氏菌(Salmonella enterica)的cgMLST方案,2018年6月11日通过Enterobase网络API下载。方案包含Enterobase原3002个基因座中的3000个可用于chewBBACA工具的编码序列基因座,用于微生物基因组分型分析,数据集以压缩包形式提供。 文件详解...
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Providencia_rettgeri_Based_果蝇细菌感染抗性与耐受性遗传架构研究数据
数据集概述 本数据集为果蝇(Drosophila melanogaster)对雷氏普罗威登斯菌(Providencia rettgeri)感染的抗性与耐受性遗传架构研究数据,包含基因组关联分析结果、感染后适合度与感染强度的回归残差数据,以及30个耐受相关基因座信息,用于探究宿主防御策略的遗传基础及抗性与耐受性的关联。 文件详解 TXT文件(共7个)...
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Pygospio_elegans_DNA_Methylation_发育模式表观遗传调控研究数据
数据集概述 本数据集围绕多毛类蠕虫Pygospio elegans的DNA甲基化展开研究,对比了不同发育模式后代的怀卵雌性、非繁殖雌性的甲基化谱,验证该物种存在基因内CpG位点甲基化及相关甲基化基因,探讨表观遗传调控对发育模式转变的潜在作用。 文件详解 文件名称:README_for_MS-AFLP_data.txt 文件格式:TXT...
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Drosophila_mojavensis_Based_种内分化模型比较与种群历史关系研究数据
数据集概述 本数据集围绕嗜仙人掌果蝇Drosophila mojavensis的种内遗传分化展开,包含基于隔离迁移模型分析的序列数据,涉及下加利福尼亚、索诺拉-亚利桑那大陆及莫哈韦沙漠种群的15个X连锁内含子基因座,还对比了8个常染色体基因座的既有数据,用于解析种群历史关系及分化时间。 文件详解 IMa2 input files.zip...
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Posidonia_oceanica_Based_地中海特有海草深度与纬度梯度适应性响应研究数据
数据集概述 本数据集聚焦地中海特有海草Posidonia oceanica,通过离群值分析和全基因组转录组分析,筛选受环境选择的基因,探究其沿深度和纬度梯度的适应性响应,涉及种群基因流、局部适应及长期存续风险等核心内容。 文件详解 README_for_matrix_MLGs_for_all_loci_dryad.txt.docx 文件格式:DOCX...
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Drosophila_melanogaster_Source_黑腹果蝇翅膀形态性冲突进化研究数据
数据集概述 本数据集围绕黑腹果蝇翅膀大小与形状的性冲突展开,记录了通过限制染色体向雄性传递消除基因座内性冲突的实验结果,包含雌雄两性翅膀形态、体型、生长速率等表型变化及发育稳定性数据,为研究性二态性进化约束提供支撑。 文件详解 文件名称:Abbottetal.JEBdryaddata.xlsx 文件格式:XLSX...
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Sinelobus_kisui_Supplementary_日本新种甲壳动物分类研究补充材料2022
数据集概述 本数据集是论文《日本一新种咸淡水糠虾类Sinelobus kisui sp. nov.(甲壳纲,囊虾总目,糠虾目),附Sinelobus属物种检索表及两个基因座的条形码信息》的补充材料1,包含1个Excel文件,用于支持该新种的分类学描述与分子信息记录。 文件详解 文件名称:oo_708115.xlsx 文件格式:XLSX...
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Echinopsis_terscheckii_Based阿根廷西北部种群遗传结构与植被覆盖关联研究数据
数据集概述 本数据集为阿根廷西北部巨柱仙人掌Echinopsis terscheckii种群遗传结构研究数据,包含4个研究站点的30株个体基因型及空间坐标信息,结合植被覆盖(数字化斑块、NDVI)、气候等因素分析其精细尺度空间遗传结构(SGS),验证胁迫梯度遗传假说,为干旱区植物保护与恢复提供依据。 文件详解 文件名称:Quipildor et...
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Ambystoma_ordinarium_Source_墨西哥濒危蝾螈物种界定研究数据_Archive
数据集概述 本数据集源自关于墨西哥濒危蝾螈(Ambystoma ordinarium)物种界定的实证研究,探讨基因座数量与信息含量对物种界定结果的影响。包含两组基因数据集:8个基因座、137个个体的数据集,以及89个基因座、7个个体的数据集,用于物种发现、验证及整合 demographic 模型选择分析。数据集以压缩包形式存储,共1个文件。 文件详解...
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Sistrurus_catenatus_landscape_gene_flow_analysis_data
数据集概述 本数据集围绕东部猪鼻响尾蛇(Sistrurus c. catenatus)的景观基因流研究展开,包含基因型数据及相关模拟输入文件,旨在分析景观组成与配置对该蛇类基因流的影响,为理解种群结构形成机制提供支持。 文件详解 文件名称:genotypes.csv 文件格式:CSV...
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SelectionComponents_Simulation_Based_性选择基因组选择组分分析模拟数据
数据集概述 本数据集为性选择基因组选择组分分析的模拟数据,基于个体模型探究该方法检测选择信号的效用。模拟二倍体有性繁殖种群,引入强配偶选择定量性状模拟性选择,通过加权FST值比较成体与后代基因组等位基因频率,分析选择位点检测效果,包含6个相关文件。 文件详解 代码文件...
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Genome_wide_association_studies_Source_共生扩展表型遗传结构分析数据
数据集概述 本数据集基于根瘤菌-苜蓿共生系统的全基因组关联研究(GWAS),探索共生扩展表型的遗传结构。通过191株根瘤菌与两种苜蓿基因型在不同环境下的配对实验,识别出环境依赖型、宿主依赖型及通用型三类调控宿主适合度的根瘤菌基因座,为构建可靠的基因型-表型(G→P)图谱提供数据支持。 文件详解 关联分析结果文件(Excel格式)...
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Microsatellite_Data_Based_Dactylogyrus_vistulae种群微卫星数据
数据集概述 本数据集包含西古北界不同种群的Dactylogyrus vistulae(一种寄生虫)的微卫星数据,记录各基因座的等位基因信息,为种群遗传学研究提供基础数据,共包含1个文件。 文件详解 文件名称:usat_list_vistulae.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:包含Dactylogyrus...
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韩国特有鱼类种群遗传指数数据_2025_注_此处可能存在文件名称或标题的误译_正确的文件名应为_韩国特有鱼类种群遗传指数数据_2025
数据集概述 本数据集为论文《韩国半岛特有鳅类Iksookimia hugowolfeldi和I. longicorpa的种群遗传学研究》的补充材料16,包含两种特有鳅类各种群及基因座的遗传指数数据,涉及核DNA(nDNA)及串联nDNA相关信息,是研究其分类学、古水系及河流袭夺的关键遗传参考。 文件详解 文件名称:oo_1354434.xlsx...
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酿酒酵母临床分离株生物膜形成遗传结构数据集
数据集概述 本数据集围绕酿酒酵母临床分离株的生物膜形成遗传结构展开,通过数量性状位点定位识别出13个与生物膜结构异质性相关的基因座,重点解析了环磷酸腺苷-蛋白激酶A通路相关基因(如CYR1)对生物膜形成的调控作用,揭示了遗传变异与信号网络功能及表型的关联机制。 文件详解 数据文件:...



