数据集概述
本数据集为Heuchera longiflora物种分化研究的整合分析数据，包含56个种群的7个分子标记及12个代表性种群的277个核标记数据，通过Sanger测序和NGS技术结合形态学数据，识别该物种的初始谱系，为种下分类单元界定提供证据支持。
文件详解
- 系统发育树文件（.tre格式，6个文件）
- 文件名示例：RAxML_bipartitions.all_longiflora_30_missing_unpartitioned.tre.renamed.tre
- 内容说明：包含不同分析条件下的系统发育树结果，用于展示种群遗传结构与谱系关系
- 压缩文件（.zip格式，5个文件）
- 文件名示例：phased_loci.zip、unphased_loci.zip
- 内容说明：包含相位化/非相位化基因座、叶地标数据、NGS基因比对结果及bootstrap分析数据
- 文本文件（.txt格式，2个文件）
- 文件名：partitionlongifloratest_edited_gaps.txt、allele_table_longiflora.txt
- 内容说明：前者定义DNA片段分区及位置，后者记录等位基因信息
- 表格文件（.xlsx格式，1个文件）
- 文件名：floral_dimensions_final.xlsx
- 内容说明：包含花部形态测量数据
- 比对文件（.phy格式，1个文件）
- 文件名：all_longiflora_trimmed_concatenated_gaps.phy
- 内容说明：整合后的序列比对数据
数据来源
论文“Integrative identification of incipient lineages in Heuchera longiflora (Saxifragaceae)”
适用场景
- 植物系统发育研究: 利用系统发育树文件分析Heuchera longiflora种群的遗传结构与谱系分化
- 种下分类单元界定: 结合分子标记与形态数据（花部维度）识别初始谱系
- 基因座分析: 通过相位化/非相位化基因座数据研究遗传变异特征
- 分类学方法验证: 评估多源数据整合在种下分类中的应用效果
