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Pst104E_Genome_Based小麦条锈菌核相位基因组组装注释数据
数据集概述 本数据集为小麦条锈菌（Puccinia striiformis f. sp. tritici）104 E137 A-（Pst104E）菌株的端粒到端粒核相位基因组组装与注释数据，包含基因组序列、基因注释、转座元件注释及补充表格，支撑该菌株的分子生物学研究。 文件详解 基因组序列文件...
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Prokka_Based_南极细菌菌株基因注释与功能分析数据_全基因组分析
数据集概述 本数据集包含从南极海葵分离的AG3和AT9两株细菌的全基因组分析结果，通过Prokka进行基因注释，使用antiSMASH分析生物合成基因簇（BGCs），并通过CARD数据库和RGI工具识别抗生素耐药基因（ARGs），为南极微生物功能研究提供基础数据。 文件详解 Prokka注释文件...
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Limonium_Based_海薰衣草质体基因组正选择基因列表数据2021
数据集概述 本数据集为论文的补充材料3，包含海薰衣草（Limonium属）质体基因组中被鉴定出的正选择基因列表，是研究该属植物质体基因组倒位重复区扩展及适应性进化的关键数据支撑。 文件详解 文件名称：oo_527177.xlsx 文件格式：XLSX...
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Prochlorococcus_Based_海洋蓝细菌多样分离株基因组数据
数据集概述 本数据集包含27株海洋蓝细菌Prochlorococcus的全基因组序列（2株完整闭合，25株草稿质量），覆盖5个主要系统发育分支，分离自全球不同海域。同时提供预计算的蛋白质直系同源组（COGs）聚类数据，可用于比较基因组学研究，是微生物生态学、进化和海洋学领域的重要参考资料。 文件详解 文档文件（document_files）...
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OGRDB_Published_小鼠C3H_HeJ品系IGLV种系基因参考集
数据集概述 本数据集是小鼠C3H/HeJ品系的IG受体种系基因参考集，包含IGLV基因的间隙型、无间隙型序列文件、许可文件及JSON文件，由Open Germline Receptor Database（OGRDB）发布，共4个文件，支持免疫遗传学领域的基因序列研究。 文件详解 HeJ IGLV_rev_1_gapped.fasta...
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Citrus_Genetic_Basis_柑橘杂交驯化细胞质核冲突研究数据集
数据集概述 本数据集围绕柑橘杂交、驯化及多样化过程中的细胞质核冲突遗传基础展开，包含184份样本的叶绿体、线粒体及核基因组变异图谱，线粒体异质性分析序列，基因表达归一化数据，GWAS分析文件，基因注释结果及基因组组装文件等，共14个文件，为柑橘细胞质核互作机制研究提供全面数据支撑。 文件详解 基因组变异图谱类...
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Drosophila_orphan_genes_生命周期研究数据_论文补充文件
数据集概述 本数据集为论文《The life cycle of Drosophila orphan genes》的补充文件，聚焦果蝇孤儿基因的生命周期研究，包含果蝇伪暗果蝇（D. pseudoobscura）基因注释的各类特征，涉及孤儿基因的出现、丢失模式及保留相关的表达特征等内容，共包含两个文件。 文件详解...
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Arabidopsis_GWAS_Based拟南芥种子油熔点适应性性状研究数据
数据集概述 本数据集为拟南芥种子油熔点自然变异的全基因组关联研究（GWAS）数据，包含391份自然种质的种子油成分分析结果及GWAS关联分析数据，验证了种子油熔点与采集地春秋季温度的适应性关联，定位到FAD2等关键基因位点。数据集共9个文件，支持植物适应性性状的遗传机制研究。 文件详解 核心数据文件（CSV格式，7个）...
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OGRDB_打开小鼠种系基因组数据库_BALB_c小鼠IGH受体种系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠BALB/c亚群的IGH受体种系参考集，由Open Germline Receptor Database（OGRDB）发布。包含IGH受体基因的种系序列数据及相关说明文件，共4个文件，支持免疫遗传学领域对小鼠BALB/c亚群IGH受体基因的研究与分析。 文件详解 许可文件： 文件名称：licence.txt 文件格式：TXT...
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Saltugilia_Comparative_花大小进化发育比较转录组分析数据
数据集概述 本数据集为Saltugilia属（花荵科）花大小进化发育的比较转录组分析数据，包含转录组从头组装、质体与核基因序列比对及注释报告，用于探究花大小进化的遗传基础，支持植物花形态与传粉者协同进化的研究。 文件详解 denovo_assemblies.tar 文件格式：TAR...
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OGRDB_Source_小鼠A_J品系IGL_V基因胚系参考数据集_CC0许可
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的小鼠A/J品系IGL-V基因胚系参考数据，包含未对齐、带空位的FASTA序列文件、JSON数据文件及许可说明文档，共4个文件，支持免疫受体基因相关研究。 文件详解 数据文件 文件名称：J IGLV_rev_2_ungapped.fasta...
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Kozak_Splicing_Factors_真菌界翻译控制与剪接体功能研究数据
数据集概述 本数据集为论文“Quantitative global studies reveal differential translational control by start codon context across the fungal...
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Tigriopus_californicus_热应激适应与表型转录可塑性研究数据
数据集概述 本数据集围绕海洋桡足类Tigriopus californicus的热应激适应展开，通过杂交具不同耐热表型的种群并筛选耐热性增强的品系，对比分析其耐热性及表型可塑性变化；同时结合转录组测序，探究表型可塑性与基因表达可塑性的关联，揭示热应激响应中水解及催化活性相关基因的作用。 文件详解 LT50_analysis.zip 文件格式：ZIP...
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Asian_arowana_Based_三种变种染色体水平基因组组装与基因注释数据
数据集概述 本数据集包含亚洲龙鱼（Scleropages formosus）三种常见变种（金色、红色、绿色）的基因组序列与注释数据。其中金色龙鱼为染色体水平组装，红、绿龙鱼为草图组装，分别注释了22016、21256、21524个蛋白编码基因，旨在解决其生物学研究与育种种质缺乏参考基因组的问题。 文件详解...
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bioRxiv_Preprint_Hox蛋白选择性靶向染色质可及性研究补充表格数据
数据集概述 本数据集是bioRxiv预印本“Chromatin Accessibility Plays a Key Role in Selective Targeting of Hox Proteins”的补充表格，包含6个Excel文件，涵盖ChIP-...
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Platyplectrum_Dryad_Files_蛙类基因组转录组研究数据_压缩包
数据集概述 本数据集包含澳大利亚装饰穴居蛙（Platyplectrum ornatum）的基因组和转录组数据，其基因组大小约1.06 Gb，是目前已知蛙类中最小的基因组之一。数据用于研究基因组大小缩减的分子机制，包括转座元件（TEs）动态、内含子长度变化、Piwi基因家族扩张及piRNA通路表达等，并通过比较近缘物种验证TE减少对基因组缩减的驱动作用。...
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Cyclonephilic_ProA_北太平洋亚热带环流原绿球藻种群动态研究补充数据
数据集概述 本数据集为支持论文“Mesoscale eddies shape Prochlorococcus population dynamics in the open...
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Clitarchus_hookeri_De_novo_新西兰普通竹节虫转录组分析数据
数据集概述 本数据集为新西兰普通竹节虫Clitarchus hookeri的从头转录组分析结果，包含嗅觉、消化及有性生殖相关基因信息。通过对不同组织转录组的分析，识别出嗅觉相关基因家族、消化酶基因（如纤维素酶、果胶酶）及雄性生殖相关候选蛋白，为研究竹节虫功能生物学提供分子基础，共含3个文件。 文件详解...
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Pinus_ponderosa_Based_黄松环境变异与耐旱表型遗传变异关联研究数据
数据集概述 本数据集聚焦黄松（Pinus ponderosa）的遗传变异与环境适应性研究，通过基因型-环境关联（GEA）和基因型-表型关联（GPA）分析，识别与干旱耐受相关的遗传变异。包含223个加利福尼亚内华达山脉个体的遗传数据，筛选后保留92万余SNPs进行关联分析，涉及气候变量、温室耐旱性状等关联结果及基因注释信息。 文件详解 数据文件...
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Placozoa_Supplementary_Data_扁盘动物门系统基因组学分类研究数据
数据集概述 本数据集是论文“Placozoa系统基因组学与首个高级分类”的补充资料，包含扁盘动物门（Placozoa）的基因组学、形态学及分类学相关数据。通过7个关键基因组的蛋白质序列分析，构建了首个核系统基因组重建，提出了完整的林奈分类系统，涉及新类群命名及进化关系分析。数据集共11个文件，涵盖系统发育树、基因注释、形态学文档等内容。 文件详解...
