数据集概述
本数据集是bioRxiv预印本“Chromatin Accessibility Plays a Key Role in Selective Targeting of Hox Proteins”的补充表格，包含6个Excel文件，涵盖ChIP-seq数据概述、Hox蛋白结合区域统计、染色质可及性分析等内容，支持研究Hox蛋白靶向机制与染色质可及性的关联。
文件详解
- 文件名称：Table S1 ChIP-seq read overview.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：ChIP-seq测序数据的基本统计信息，可能包含样本ID、测序深度、比对率等关键指标
- 文件名称：Table S2 ChIP-Seq binding region numbers.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：Hox蛋白及相关因子的ChIP-seq结合区域数量统计，可能包含不同实验条件下的结合区域总数、重叠区域数等
- 文件名称：Table S3 Stable cell lines ATAC-seq read overview.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：稳定细胞系的ATAC-seq测序数据概述，可能包含样本信息、测序质量指标、可及性区域统计等
- 文件名称：Table S4 Hox group peak regions.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：不同Hox蛋白家族的ChIP-seq峰值区域信息，可能包含峰值位置、信号强度、基因注释等
- 文件名称：Table S5 Exd_Hth-enhanced binding analysis.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：Exd/Hth辅助因子增强Hox蛋白结合的分析数据，可能包含结合区域的共定位统计、信号强度比较等
- 文件名称：Table S6 Increased chromatin accessibility analysis.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：染色质可及性增加的相关分析结果，可能包含差异可及性区域的位置、关联基因功能注释等
数据来源
bioRxiv预印本“Chromatin Accessibility Plays a Key Role in Selective Targeting of Hox Proteins”
适用场景
- 表观遗传学研究：分析染色质可及性对Hox蛋白靶向特异性的调控机制
- 转录因子结合分析：利用ChIP-seq数据研究Hox蛋白及辅助因子的基因组结合特征
- 生物信息学验证：验证染色质开放区域与Hox蛋白结合位点的关联性
- 基因调控网络构建：基于可及性数据和结合区域信息，构建Hox蛋白介导的基因调控网络
- 细胞生物学研究：探索稳定细胞系中染色质可及性变化对Hox蛋白功能的影响
