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Aglieri_Based_地中海港口鱼类eDNA检测与非本地物种传播数据集2023
数据集概述 本数据集为地中海港口鱼类环境DNA(eDNA)宏条形码检测数据,2018年和2019年在多个地中海港口采集表层水样(2018年为2升单重复,2019年为1升四重复),通过12S rRNA和线粒体COI基因标记生成数据。包含各采样周期及标记对应的生物信息学分析后ASV/MOTUs表、 curated注释表,以及OTU存在-缺失表,共一个文件。...
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Pyrenean_desman_Based_濒危食虫动物粪便饮食宏条形码引物选择数据
数据集概述 本数据集来自比利牛斯鼬鼹粪便饮食分析的引物筛选研究,针对该濒危食虫动物的粪便样本,测试五种宏条形码引物(Brandon-Mong、Gillet、Leray、Meusnier、Zeale)的PCR扩增及测序效果,通过OTU聚类与数据库比对分析引物性能,为优化该物种食性研究方法提供数据支持。 文件详解...
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Supplementary_material_7_昆虫宏条形码非破坏性DNA提取协议评估数据
数据集概述 本数据集为论文《Evaluation of non-destructive DNA extraction protocols for insect metabarcoding: gentler and shorter is...
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Buchner_Haase_Leese_无脊椎动物湿磨样本PCR引物数据2021
数据集概述 本数据集为无脊椎动物湿磨样本宏条形码和宏基因组学研究的补充材料,包含研究中使用的PCR引物信息表格。数据支持对无脊椎动物样本处理及分子实验方法的参考,共包含一个文件。 文件详解 文件名称:oo_568786.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:包含Table...
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mbmg_8_128689_Source_MIEM指南环境宏条形码数据报告补充材料
数据集概述 本数据集为MIEM指南(环境宏条形码数据报告最低信息标准)的补充材料,来自论文《The MIEM guidelines: Minimum information for reporting of environmental metabarcoding data》,包含一份Excel格式的补充文件,用于辅助理解环境宏条形码数据的规范报告要求。...
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eDNA_Metabarcoding_东欧淡水非本土物种入侵检测引物数据_2022
数据集概述 本数据集为论文配套补充材料,包含用于生物多样性检测的eDNA宏条形码qPCR检测方法及对应引物组信息,支持东欧淡水非本土物种入侵的环境DNA检测研究,共含一个文件。 文件详解 文件名称:oo_694443.docx 文件格式:DOCX...
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MycoKeys_Supplementary_真菌rDNA分类数据补充材料2015
数据集概述 本数据集是论文的补充材料7,包含真菌宏基因组rDNA的分类数据。数据以表格形式呈现,记录了真菌rDNA的分类信息,为研究宏条形码分析中的偏差提供支持,是真菌分类学研究的重要参考资料。 文件详解 文件名称:oo_43577.xlsx 文件格式:XLSX...
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补充材料_3_基于池塘鱼类_eDNA_宏条形码的未分配_BLAST_数据_2020
数据集概述 本数据集为论文补充材料3,包含池塘鱼类环境DNA(eDNA)宏条形码分析中的未分配BLAST数据。数据源于2020年关于排水池塘中鱼类丰度、生物量与eDNA宏条形码读数计数关系的研究,可用于分析eDNA宏条形码技术在鱼类监测中的未匹配序列情况,共包含1个文件。 文件详解 文件名称:oo_466522.xlsx 文件格式:XLSX...
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Metabarcoding_Based_河流eDNA样本DADA2处理ASVs表格数据
数据集概述 本数据集为河流环境DNA(eDNA)样本经DADA2去噪后的扩增子序列变体(ASVs)表格数据,包含三种分子标记(12S、18S、COI)的处理结果及元数据文档,共4个文件,用于河流生物多样性相关研究。 文件详解 数据文件(CSV格式,共3个)...
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Bombus_Pollen_metabarcoding_DNA提取协议补充材料2023
数据集概述 本数据集为论文补充材料2,包含用于熊蜂(Bombus)花粉DNA提取的实验协议文档。数据支持博物馆标本与近期采集熊蜂的花粉宏条形码研究,涉及DNA提取的标准化操作流程,为相关生物分子实验提供方法参考。 文件详解 文件名称:oo_873417.docx 文件格式:DOCX...
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Spatio_temporal_Based_深海沉积物群落DNA和RNA宏条形码监测数据
数据集概述 本数据集为西北地中海海底峡谷及邻近斜坡区域的深海沉积物群落时空多样性监测数据,采用18S rRNA基因v7区域的真核生物标记进行宏条形码分析,包含5569个分子操作分类单元(MOTUs),主要类群为后生动物、囊泡虫和有孔虫,涉及季节和深度梯度的群落组成差异,以及DNA与RNA数据集的对比分析。 文件详解...
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Supplementary_material_3_DNA模板与引物错配评分方案_补充材料
数据集概述 本数据集为论文《Does phylogeny explain bias in quantitative DNA metabarcoding?》的补充材料3,核心内容是DNA模板与引物错配的评分方案,用于支撑DNA宏条形码技术中系统发育对定量偏差影响的研究,仅包含1个文件。 文件详解 文件名称:oo_863450.docx 文件格式:DOCX...
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Supplementary_material_6_卢森堡野生蜜蜂宏条形码模拟群落结果数据
数据集概述 本数据集是论文《A metabarcoding framework for wild bee assessment in Luxembourg》的补充材料6,包含模拟群落宏条形码分析结果。数据以单个Excel文件形式呈现,用于支持卢森堡野生蜜蜂评估宏条形码框架的研究,为野生蜜蜂多样性监测提供技术验证数据。 文件详解...
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metabarcoding_Nematode_Based土壤线虫群落新宏条形码策略实验数据
数据集概述 本数据集是基于新宏条形码策略研究土壤线虫群落的实验数据,包含四种引物组(JB3/JB5、SSU_04F/SSU_22R、Nemf/18Sr2b、MMSF/MMSR)对86份DNA样本(线虫个体、模拟群落、土壤样本等)的测序结果,用于评估不同引物组检测土壤线虫群落的效率。 文件详解 JB_otutable_added taxa.xlsx...
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Environmental_DNA_Based_第勒尼安海深海头足类多样性宏条形码测序数据
数据集概述 本数据集包含第勒尼安海深海头足类多样性环境DNA宏条形码研究的原始分拆测序读段。样本来自水体和沉积物基质,使用Ceph18S引物靶向扩增头足类DNA,经IonTorrent平台测序。数据文件按采样站位、重复编号及环境基质命名,反映深海头足类群落多样性特征。 文件详解 文件名称:Reads.zip 文件格式:ZIP...
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Plant_Insect_Diversity_Based热带景观植物昆虫多样性关联研究数据
数据集概述 本数据集围绕热带景观中植物多样性与昆虫多样性的关联展开,通过 metabarcoding 技术分析两处热带景观的 Malaise 诱捕样本,验证植物物种丰富度对昆虫物种丰富度的预测能力及群落组成相关性。包含测序数据、环境参数、生物信息学脚本等16个文件,支持生物多样性机制研究与保护应用。 文件详解 环境参数文件...
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MycoKeys_Supplementary_material_1_土壤样本特征数据_2015
数据集概述 本数据集是论文补充材料1,包含研究中使用的土壤样本特征信息。数据旨在支持宏条形码分析真菌的偏差研究,为微生物组研究提供土壤样本的基础特征数据,共包含1个文件。 文件详解 文件名称:oo_43571.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:作为补充表格(Table...
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MBMG_Supplementary_日本温带热带沿岸潮间带鱼类eDNA物种检测列表_2024
数据集概述 本数据集为期刊补充材料3,记录日本房总半岛和本部半岛温带、热带沿岸区域72份样本的环境DNA宏条形码检测鱼类物种列表。样本覆盖3个采样点、4轮采样、2个半岛,每点3个样本袋,是潮间带鱼类多样性与潮汐影响研究的核心物种数据。 文件详解 文件名称:oo_1203227.xlsx 文件格式:XLSX...
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Supplementary_material_1_COI与16S捕获探针实验补充材料数据2022
数据集概述 本数据集是论文《COI通用引物捕获探针无法排除细菌DNA,但16S捕获遗漏后生动物》的补充材料,包含一份文档文件,记录了COI和16S捕获探针实验相关的补充信息,为研究分子生物学实验中捕获探针的特异性表现提供支持。 文件详解 文件名称:oo_690382.docx 文件格式:DOCX...
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Supplementary_material_5_海洋生物多样性检测优化替代统计模型数据2018
数据集概述 本数据集为论文补充材料5,包含用于优化海洋生物多样性检测的替代统计模型。研究聚焦环境DNA宏条形码技术,分析过滤材料、孔径和提取方法对检测结果的影响,为海洋生物分类多样性检测提供技术优化参考。 文件详解 文件名称:oo_240208.docx 文件格式:DOCX...



