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按蚊亚科线粒体蛋白编码基因系统发育数据集
数据集概述 本数据集围绕按蚊亚科的系统发育研究,通过分析150种按蚊亚科新测序线粒体基因组及18种库蚊属外群物种的13个蛋白编码基因氨基酸序列,结合GenBank的23个线粒体基因组数据,探究按蚊亚科内属及亚属的分类关系,为其分类系统修订提供数据支持。 文件详解 文件名称: GenomeRegion_Seq.xls,文件格式: XLS。 文件名称:...
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鳕形目鱼类系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集围绕鳕形目鱼类系统发育分析展开,包含系统发育重建方法验证、模型选择、分支支持度评估等相关研究材料,为解决鳕形目鱼类历史争议性亲缘关系提供数据支持。 文件详解 文档类文件(PDF格式,共15个):...
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生物医学补充信息数据集
数据集概述 该数据集为生物医学领域的补充信息集合,包含蛋白质相关序列文件与压缩存档文件,涉及蛋白质、CT等生物医学关键词,为相关研究提供辅助数据支持。 文件详解 文件名称:SI,download_1-5.zip 文件格式:ZIP(.zip) 内容说明:压缩存档文件,具体内容未提供预览 文件名称:CS_selection.fasta...
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RefPlantNLR实验验证植物NLR数据集及脚本20200528_415
数据集概述 该数据集是RefPlantNLR的补充资料,包含经实验验证的植物NLR(核苷酸结合寡聚化结构域样受体)相关序列、注释及分析结果,涵盖氨基酸序列、CDS序列、基因组序列、结构域注释、系统发育树等多类型数据,为植物免疫研究提供基础数据支持。 文件详解 该数据集包含补充表格和数据集文件,具体说明如下: - 补充表格文件: -...
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辅助NLR通道细胞器钙触发植物免疫补充数据集
数据集概述 本数据集为《辅助NLR通道细胞器钙触发植物免疫》手稿的补充数据,包含13个文件,涵盖氨基酸序列、钙传感器强度原始数据、系统发育树等内容,支持植物免疫机制相关研究。 文件详解 氨基酸序列与比对文件: Data_S1.zip(压缩包):NbNRG1与AtNRG1的氨基酸比对数据 Data_S6.fasta(FASTA):用于系统发育分析的NB-...
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挪威牛呼吸道疾病暴发中牛呼吸道合胞体病毒的发生与系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集围绕挪威牛呼吸道疾病(BRD)暴发中牛呼吸道合胞体病毒(BRSV)的发生情况与系统发育分析展开,包含BRSV感染检测结果、G基因序列分析及遗传进化关系研究相关资料,为探究BRSV在挪威BRD流行中的病原学作用提供数据支持。 文件详解 文件名称:Amino acid sequences 60 to 215 of the G...
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光栖息地中鲈形目鱼类视觉特征数据集
数据集概述 本数据集围绕两种不同光环境中鲈形目鱼类的视觉特征展开,包含水下光测量、视网膜转录组学、眼睛形态及光谱反射率数据,用于分析环境与物种对其视觉系统及信号特征的影响。 文件详解 该数据集包含以下文件: - README.md:数据集说明文档,介绍研究背景、数据内容及分析方法 -...
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非蓝细菌固氮菌全球多样性分布生理生态及海洋活性数据集
数据集概述 本数据集为论文《非蓝细菌固氮菌:全球多样性、分布、生理生态及海洋水域活性》的配套数据,包含海洋水体nifH基因丰度数据库、nifH基因序列目录、分类聚类表等文件,为研究海洋非蓝细菌固氮菌提供多维度数据支持。 文件详解 基因丰度数据库文件:...
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共受体BAK1的变构激活与免疫信号启动补充信息数据集
数据集概述 该数据集为研究论文《共受体BAK1的变构激活与免疫信号启动》的补充信息集合,包含质粒图谱、系统发育分析文件、复制信息、图像裁剪信息、基因ID及蛋白质序列等关键支撑材料,用于验证和补充论文核心研究内容。 文件详解 文档类文件: ReplicationInformation.pdf:PDF格式,提供实验复制相关的说明信息...
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农杆菌系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集为拟议新物种Agrobacterium bohemicum sp. nov.的系统发育分析提供完整数据支持,包含基因组序列、基因文件、系统发育树及相关分析文件,覆盖从原始序列到分析结果的全流程数据。 文件详解 该数据集包含82个文件,具体说明如下: - 基因组序列文件: -...
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补充图表S1与补充表格S1_S8数据集
数据集概述 本数据集包含补充图表S1及补充表格S1至S8,涉及蛋白质相关的功能预测、序列信息、定位分析等生物学研究内容,以Excel表格、文档及PDF图表形式存储,为相关研究提供补充数据支持。 文件详解 数据文件(.xlsx格式,共8个): Table S1. Accessions.xlsx:包含登录号相关数据 Table S2 Amino acid...
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系统发育基因组分析中替代异质性处理模拟研究数据集
数据集概述 本数据集围绕系统发育基因组学中替代异质性处理方法展开,通过模拟氨基酸序列数据对比CAT模型(CAT-F81、CAT-GTR)与数据分区策略的性能差异,分析不同模型对系统发育树推断准确性的影响,为相关研究提供数据支持。 文件详解 压缩文件: NexusFiles_PartitionFiles_ProgramCommands.zip:...
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天然通道视紫红质目录数据集
数据集概述 本数据集是天然通道视紫红质(ChRs)的目录资源,包含原始列表与更新列表两个核心Excel文件,以及AlphaFold3预测的结构压缩包。数据覆盖序列信息、分类归属、功能活性等维度,为通道视紫红质的研究提供系统性参考。 文件详解 该数据集包含3个核心文件,具体说明如下: - 原始列表文件: - 文件名称:...
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泛甲壳动物系统发育组学中丝氨酸密码子使用偏好数据集
数据集概述 本数据集围绕泛甲壳动物系统发育关系研究,分析Regier等2010年组装的62个蛋白质编码基因中,核苷酸与氨基酸数据构建系统发育树的差异,重点探究丝氨酸等同义密码子使用偏好对拓扑结构的影响。 文件详解 文件名称: ser_rev_suppl.info.pdf 文件格式: PDF 内容说明:...
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节肢动物化学感觉相关基因家族进化历史数据集
数据集概述 本数据集围绕节肢动物门化学感觉相关基因(CRG)家族的进化历史展开,包含多类支持文件。通过整合新节肢动物基因组、转录组及桡足类(如近亲真宽水蚤)的基因组数据,分析CRG家族的起源、扩张与丢失,为理解节肢动物化学感觉系统的演化提供基础数据。 文件详解 补充材料文档:...
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库蚊昼夜节律基因tim外显子1序列比较分析补充材料
数据集概述 本数据集为库蚊昼夜节律基因tim外显子1序列比较分析的补充材料,包含两种库蚊(Culex pipiens)tim基因外显子1的核苷酸与氨基酸序列,及其与致倦库蚊(Culex quinquefasciatus)序列的对比数据,支持库蚊昼夜节律基因的比较研究。 文件详解 文件名称: oo_105863.pdf 文件格式: PDF 文件内容:...
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蜘蛛蝇系统发育基因组学研究补充材料数据集
数据集概述 本数据集为蜘蛛蝇(双翅目,Acroceridae)系统发育基因组学研究的补充材料,包含支撑论文结论的补充图表、核苷酸与氨基酸序列比对及基因分区文件,用于揭示其演化关系及核苷酸与氨基酸数据的不一致性。 文件详解 该数据集包含六个独立文件,具体说明如下: - 文档类文件: -...
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凤蝶科全基因组鸟枪法系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集包含凤蝶科(Papilionidae)蝴蝶的全基因组鸟枪法测序数据及系统发育分析结果,涵盖45种凤蝶科物种和16种外群物种的6621个直系同源蛋白编码基因序列,用于解析其进化关系与分化时间。 文件详解 附录文档(PDF格式): Appendix S12 - Phylogenomic tree with cross-...
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早期陆生植物线粒体系统发育基因组学数据集
数据集概述 本数据集围绕早期陆生植物线粒体系统发育基因组学展开,通过新建20种苔藓植物线粒体基因组并补充40种链型植物数据,构建含60个分类群、41个线粒体基因的矩阵,分析核苷酸与氨基酸数据对系统发育推断的影响,探讨饱和效应、组成异质性等系统误差的作用。 文件详解 数据矩阵文件(.nex格式): Matrix_nt.nex:核苷酸序列数据矩阵文件...
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Nebulin_SR1_SR22_Based_人类nebulin超重复序列实验数据完整数据集
数据集概述 本数据集包含人类nebulin的核苷酸和氨基酸序列文件,以及设计的SR1和SR22 nebulin超重复序列(带标签,用于克隆到表达载体),共3个PDF文件,无目录结构,为分子生物学实验提供序列参考。 文件详解 文件名称:Sekwencja aminokwasowa i nukleotydowa ludzkiej nebuliny...



