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Supplemental_Based_淋巴瘤细胞系缺氧适应多组学补充数据表
数据集概述 本数据集为淋巴瘤细胞系长期缺氧适应分子机制研究的补充数据表,包含代谢组、转录组差异表达、转录组基因集分析、蛋白质组差异表达及细胞系单核苷酸变异(SNV)特征五个表格文件,记录了Ramos和HBL2细胞系在常氧与缺氧适应状态下的多组学数据及变异信息。 文件详解 Supplemental Data Table - Metabolome.xlsx...
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Montipora_capitata_Source_多组学研究补充表格数据
数据集概述 本数据集是Montipora capitata多组学研究的补充表格集合,包含五份Excel文件,分别记录了微生物组16S rRNA数据的读取统计、蛋白质与转录本的倍数变化值、主要KEGG通路、PERMANOVA统计结果以及多样性指标的统计测试结果,为该珊瑚多组学研究提供结构化的补充数据支持。 文件详解...
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Villiers等人急性早幼粒细胞白血病PML_RARA基因调控多组学源数据
数据集概述 本数据集是论文“Multi-omics and machine learning reveal context-specific gene regulatory activities of PML::RARA in Acute Promyelocytic...
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Zostera_marina_Based_系统地理分化与转录组热适应研究数据
数据集概述 本数据集围绕全球重要海草Zostera marina展开,聚焦其跨热梯度种群的系统地理分化与转录组热适应机制。通过空间代时间设计,在欧洲和北美沿岸南北种群的公共花园中模拟热浪,记录控制、热应激及恢复阶段的转录组响应,包含约1.3万个注释基因数据,可用于解析热适应的分子基础及系统地理分化对适应的影响。 文件详解...
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PrediXcan_v7_Based_克罗恩病抗TNF治疗应答预测转录组数据
数据集概述 本数据集为克罗恩病抗TNF治疗非持久应答预测机器学习模型的支撑数据,通过PrediXcan v7从基因型推导转录组表达值,筛选可区分英夫利昔单抗疗效的基因特征。包含全血、横结肠、小肠末端回肠三种组织模型的预测基因表达值及样本表型信息,共4个文件。 文件详解...
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Dryad_Nebria_vandykei_高山步甲虫环境适应与进化研究数据
数据集概述 本数据集围绕高山步甲虫Nebria vandykei的环境适应展开研究,包含RNA测序分析的环境胁迫响应分子通路、与近缘物种的进化关系分析,以及高低海拔种群间正选择作用的检测结果,涉及冷、热、干旱胁迫下的基因表达与适应性进化机制。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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Dryad_Subset4_贝加尔湖特有端足类转录组系统发育与正选择分析数据
数据集概述 本数据集基于64种贝加尔湖特有端足类及2种非特有外类群的部分转录组数据,包含该物种群的系统发育修订结果与特有支系的正选择分析证据,涉及两次独立入侵事件、形态特征平行演化及正选择基因功能分析等内容。 文件详解 文件名称:Subset4Dryad_aBSRELresultsBy(edge).xlsx 文件格式:XLSX...
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RNA_sequencing_Based_子宫内膜外植体基因表达对比研究数据
数据集概述 本数据集为子宫内膜外植体RNA测序实验结果,旨在对比附睾精子与射精精子对子宫内膜转录组的影响差异。实验通过将发情期母牛子宫内膜外植体分别与附睾精子、射精精子共孵育(含空白对照),分析基因表达变化,揭示精浆成分对子宫内膜环境的调控作用,包含2个核心文件。 文件详解...
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Pomacea_De_novo_assembly福寿螺转录组分子生态应用数据
数据集概述 本数据集为入侵物种福寿螺的转录组从头组装数据,包含128,436条unigenes(平均长度419bp)、2,439个含转座元件的unigenes、3,196个微卫星位点、15,412个ORF单核苷酸多态性(SNPs)及878个幼螺蛋白质组数据,支持入侵物种分子生态研究。 文件详解 文件名称:Pomacea_SNP.xlsx...
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Oligohymenophorea_PL0344_微生物基因组转录组测序数据
数据集概述 本数据集包含Oligohymenophorea sp. PL0344的基因组与转录组测序数据,以压缩包形式存储,无分层目录结构及数据划分,未提供说明文档或内容预览。 文件详解 文件名称:Oligohymenophorea_PL0344.zip 文件格式:ZIP...
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Dryad_Based_辣椒疫霉miRNA调控RNPII磷酸化与转录研究数据
数据集概述 本数据集支持辣椒疫霉中转录调控机制的研究,核心内容为miRNA(pcamiR1)通过调控PcCDK7影响RNA聚合酶II(RNPII)羧基末端结构域(CTD)磷酸化状态的实验数据,涉及形态转换过程中的转录变化及调控模块的进化保守性分析。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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向日葵_Helianthus_annuus_干旱胁迫下的转录组和表型响应数据
数据集概述 本数据集记录了栽培向日葵在早期和晚期干旱胁迫下的转录组与表型响应差异。通过常见园实验,对六个油葵品系在对照和干旱条件下的表型(如生物量、叶面积、水分利用效率)及转录组(差异表达基因、共表达模块)数据进行采集分析,揭示相似转录响应在不同生育期引发不同表型的机制。包含21个文件,涵盖基因列表、表型指标、富集分析等多类型数据。 文件详解...
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Caryophyllales_Based石竹目植物全基因组复制与多样化研究数据
数据集概述 本数据集围绕石竹目(Caryophyllales)植物的全基因组复制(WGD)事件展开,包含系统发育树构建、多样化分析及气候占据转移相关数据。通过整合转录组和基因组分析识别的WGD事件,结合物种演化速率与气候适应性变化,为研究WGD在植物演化中的作用提供支持,共包含3个文件。 文件详解 压缩文件1(divers.zip)...
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Gypsophila_paniculata_美国满天星入侵种群转录组分析数据集
数据集概述 本数据集聚焦美国密歇根州和华盛顿州的入侵物种满天星(Gypsophila paniculata)种群,通过RNA-seq技术分析其分子过程对不同环境的响应机制。内容涵盖转录组表达谱、SNP变异、表型数据(如萌发率)及相关分析脚本,旨在揭示该物种入侵成功的分子可塑性与遗传分化因素,共包含11个文件。 文件详解 数据文件...
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Bombus_terrestris_Based_熊蜂蜂后滞育遗传生理工具包数据
数据集概述 本数据集聚焦熊蜂(Bombus terrestris)蜂后的滞育现象,包含滞育相关的生理参数与基因表达数据。通过对比滞育蜂后与经CO₂处理绕过滞育蜂后的转录组变化,验证昆虫滞育遗传工具包的保守性及社会性昆虫中该工具包与品级分化的关联,为昆虫环境适应与社会性演化研究提供支撑。 文件详解 文件名称:physiological...
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Arabidobsis_Super50_2020_RNAseq_抗逆性研究数据
数据集概述 本数据集包含拟南芥(Arabidopsis thaliana)在SuperFifty(SF)预处理后对百草枯(PQ)诱导的氧化胁迫响应的转录组、代谢组和脂质组分析数据。研究显示SF预处理可预防PQ引起的坏死损伤,通过多组学分析揭示SF调控的基因表达、代谢物积累及脂质变化,为植物抗逆机制研究提供数据支持。 文件详解...
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Thalassiosirales_硅藻_海洋淡水过渡_系统发育基因组学研究数据
数据集概述 本数据集为硅藻(主要是盘藻目Thalassiosirales)海洋淡水过渡研究的补充材料,包含59个硅藻类群的基因组与转录组系统发育数据,用于解析其栖息地转换的进化机制,涉及基因树冲突、祖先状态重建及适应性基因分析等内容。 文件详解 README-dryad.txt 文件格式:TXT...
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Dryad_MsatsGenotypes_树蛙微卫星跨物种扩增与多态性研究数据
数据集概述 本数据集为树蛙微卫星标记研究数据,包含18个匿名基因组微卫星位点与17个转录组来源微卫星位点在9种树蛙中的基因型信息。通过对比两类标记的跨物种扩增成功率与多态性水平,验证转录组微卫星在远缘物种中的适用性及匿名微卫星的种内变异检测优势,为两栖动物多物种调查及保护进化研究提供标记资源。 文件详解...
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Pinus_halepensis_Based_地中海松转录组与基因组工具开发数据
数据集概述 本数据集为地中海广泛分布的树种地中海松(Pinus halepensis Mill.)的转录组研究数据,包含转录组组装结果、功能注释及分子标记开发信息,用于解析该物种对干旱和火灾的适应分子机制,助力群体基因组学与关联遗传学研究。 文件详解 文件名称:Pinus halepensis__KEGG_annotation.xlsx...



