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PinustaedaSNP_Based_火炬松外生菌根性状关联作图研究数据
数据集概述 本数据集为火炬松外生菌根性状关联作图研究的相关数据，通过克隆复制田间实验，分析火炬松与外生菌根真菌共生相关性状的遗传基础，包括不同外生菌根真菌的相对丰度、每厘米根被外生菌根真菌定殖的根尖总数等性状，以及候选基因中的单核苷酸多态性（SNPs）与这些性状的关联情况。 文件详解...
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Ostrea_lurida_Based_北美西海岸种群结构与适应性研究数据
数据集概述 本数据集围绕北美西海岸奥林匹亚牡蛎（Ostrea lurida）的种群结构、遗传连通性及适应性展开，通过13,424个单核苷酸多态性（SNPs）分析其区域种群结构、基因流障碍及适应性分化，含中性位点与235个候选选择位点数据，覆盖从加州南部到温哥华岛的物种分布范围，共9个文件。 文件详解 配置与参数文件 文件名称：params-...
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Brachionus_基于轮虫入侵实验_性倾向迁移率遗传多样性交互作用数据
数据集概述 本数据集为轮虫（Brachionus plicatilis）入侵实验数据，探究性倾向、迁移率与本地遗传多样性对种群入侵成功率的交互影响。通过全基因组测序追踪移民特有等位基因，分析三者单独及联合作用，包含实验数据、处理代码及SNP数据，共4个文件，用于揭示扩散定居阶段的生态进化机制。 文件详解 数据文件 文件名称：propensity...
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Pooled_RNA_Seq_Based_田鼠等位基因频率估计准确性研究数据
数据集概述 本数据集为验证混合RNA-Seq是否能准确预测真实等位基因频率的研究数据，以10只银行田鼠肝脏转录组为研究对象，对比单样本测序与混合样本测序的等位基因频率差异，包含参考转录组、基因型数据、频率估计结果及分析脚本等9个文件。 文件详解 参考转录组文件 文件名称：C3W_final_transcriptome.fasta 文件格式：FASTA...
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Dryad_Based_阿拉斯加粉鲑种群基因结构与地理隔离研究数据_2013
数据集概述 本数据集包含阿拉斯加66个粉鲑（Oncorhynchus keta）产卵种群的基因结构研究数据，通过90个核基因和3个线粒体单核苷酸多态性（SNP）分析，探究冰期动态环境下种群的距离隔离模式。数据反映了不同空间尺度和地理区域的基因分化差异，识别出9个偏离区域隔离模式的异常种群，为粉鲑种群遗传结构与地理因素的关系研究提供支持。 文件详解...
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Nothofagus_Based_巴塔哥尼亚森林南水青冈属基因组资源开发数据
数据集概述 本数据集包含通过下一代测序技术开发的巴塔哥尼亚森林南水青冈属（Nothofagus）物种基因组资源，涵盖叶绿体、线粒体及核基因的组装与注释结果，以及单核苷酸多态性（SNP）和简单序列重复（SSR）标记等分子遗传资源，为该属物种的遗传研究与资源管理提供支持。 文件详解 README_for_Nothofagus_assemblies.txt...
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Laparocerus_ITQD_Based第四纪岛屿物种形成气候模型分析数据
数据集概述 本数据集是第四纪岛屿物种形成地形气候模型（ITQD）研究的配套数据，针对加那利群岛大加那利岛的拉帕尔科鲁斯象鼻虫物种复合体（Laparocerus tessellatus），通过ddRAD-seq技术获取单核苷酸多态性（SNP）数据，分析其基因组关系、物种边界、种群历史及空间连接模式，验证ITQD模型对岛屿物种分化的解释力。 文件详解...
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Accipiter_Hawks_Based加勒比岛屿特有鹰类进化与保护研究数据
数据集概述 本数据集聚焦加勒比岛屿特有Accipiter鹰类的系统进化与保护研究，包含38个样本的超保守元件（UCEs）、线粒体基因组序列及单核苷酸多态性（SNPs）相关分析文件，用于探究加勒比种群与大陆种群的亲缘关系、遗传分化及物种界定，支持该类群的保护评估。 文件详解 序列与比对文件 文件名称：Catanachetal2021_UCE.fasta...
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Selasphorus_sasin_Based_艾伦蜂鸟南加州种群基因研究数据
数据集概述 本数据集围绕加州艾伦蜂鸟（Selasphorus sasin）的三个种群（迁徙型、南加州大陆定居型、海峡群岛定居型）开展基因研究，通过单核苷酸多态性（SNP）分析探究其遗传关系，核心发现南加州大陆种群为两个亚种的杂交后代。数据集包含基因数据、样本信息、分析代码等11个文件，支持种群基因组学分析。 文件详解 数据文件...
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Heliconius_Based蝴蝶适应性颜色模式分化与趋同基因组结构研究数据
数据集概述 本数据集围绕Heliconius蝴蝶适应性颜色模式分化与趋同的基因组结构展开，通过全基因组重测序等技术，分析了其杂交区的遗传变异，识别了调控红色颜色模式变异的基因组区间，探究了适应性等位基因的进化历史，为理解生物多样性起源提供支撑。 文件详解 序列与进化分析文件（.nex格式，共19个）...
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Gadus_morhua_Based_大西洋鳕鱼跨大西洋基因组数据合成分析数据集
数据集概述 本数据集为大西洋鳕鱼（Gadus morhua）跨大西洋基因组数据合成分析结果，整合多个区域全基因组单核苷酸多态性（SNP）数据集，形成覆盖54个地点、1494个个体、796个公共位点的跨大西洋数据集，用于解析其跨大西洋分化及二次接触的系统地理模式。 文件详解 文件名称：Cod synthesis SNP list.xlsx...
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Conservation_Genomics_美国鼠兔非侵入性采样基因组学研究数据
数据集概述 本数据集是关于美国鼠兔（Ochotona princeps）的保护基因组学研究成果，通过对非侵入性采集的毛发样本进行基因分型测序，在两个海拔样带上的8个位点识别并分型了3803个高置信度单核苷酸多态性（SNPs），同时检测出55个受选择的候选基因区域。数据揭示了基因多样性与海拔的正相关关系及低海拔种群的近交现象，包含1个文件。 文件详解...
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Clemento_etal_2014_奇努克鲑鱼SNP遗传种群识别基线数据_压缩包
数据集概述 本数据集是加州海流大型海洋生态系统中奇努克鲑鱼的单核苷酸多态性（SNP）遗传种群识别基线，包含69个种群的8000余尾个体在96个SNP位点的基因型数据，可用于精准识别个体来源种群及混合样本的种群组成，支持渔业管理决策。 文件详解 文件名称：Clemento_etal_2014_Chinook_SNP_baseline.zip...
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Triturus_Newt_Genetic_Data_塞尔维亚东部蝾螈遗传分析数据集
数据集概述 本数据集包含对塞尔维亚东部Vrtovać地区9个Triturus蝾螈样本（含T. arntzeni模式标本及副模式标本）的核基因数据，通过二代测序获取52个标记。数据与当地4种冠螈参考序列对比，分析样本遗传成分，为物种分类提供依据。 文件详解 原始数据文件 文件名称：1 - FASTQ_IonTorrent.zip...
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Plasmodium_falciparum_New_World殖民化_抗原选择模式研究数据
数据集概述 本数据集围绕恶性疟原虫在新大陆殖民后红细胞结合抗原（eba基因）的选择模式展开，包含3个eba基因、2个管家基因的序列数据及272个SNP数据集、补充表格，共7个文件。通过对比南美与非洲种群的基因多态性，分析eba基因在新宿主环境下的选择压力差异，为疟原虫进化研究提供基础数据。 文件详解 基因序列文件（.fas格式，共5个）...
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Inbreeding_Genomics_Based个体近交系数测量方法比较研究数据2015
数据集概述 本数据集围绕基因组学时代个体近交系数测量展开，通过计算机模拟比较系谱近交系数（FP）与基因组标记法（FH、FROH、FE）对实际基因组同源性（IBDG）的预测效果，验证了基因组标记法在大样本SNP下的优越性，为生态学、进化和保护生物学领域提供方法参考。 文件详解 文档文件...
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RAD_seq_MassARRAY_北美东部橡树核DNA条形码及植物园杂交研究数据
数据集概述 本数据集为北美东部8种常见白橡树核DNA条形码研究及植物园杂交分析相关数据。研究通过RAD-seq技术开发含80个SNP的条形码工具包，结合MassARRAY技术验证，分析Morton Arboretum中移栽橡树与本地树种的杂交情况。包含5个文件，涉及SNP提取脚本、不同筛选阶段的SNP矩阵及基因座序列压缩包。 文件详解...
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酿酒酵母CBS_493_94基于全基因组测序的单核苷酸多态性_SNP_距离矩阵数据
数据集概述 本数据集为酿酒酵母CBS 493.94菌株的全基因组测序相关数据，核心内容是SNP（单核苷酸多态性）距离矩阵，以单个Excel文件形式存储，可用于分析该菌株基因组的遗传变异特征。 文件详解 文件名称：Annex 1_ CBS493.94_SNP distance matrix.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：包含酿酒酵母CBS...
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刺盖鱼_Gasterosteus_aculeatus_耐盐性变异的遗传基础研究数据
数据集概述 本数据集围绕三刺鱼（Gasterosteus aculeatus）溯河型与溪流型生态型的盐度耐受性遗传机制展开，通过整合基因组学方法识别盐度适应相关候选基因。包含海水胁迫下血浆钠浓度的数量性状位点（QTL）定位、鳃组织基因表达分析、全基因组测序及基因组扫描结果，涉及ATP合成、激素信号等通路基因，为解析盐度适应的遗传基础提供数据支撑。...
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Notochthamalus_SNP_Based_智利海岸藤壶种群遗传学研究补充数据
数据集概述 本数据集是智利海岸藤壶Notochthamalus scabrosus种群遗传学研究的补充数据，包含130个单核苷酸多态性（SNP）的核基因多态性数据，用于分析线粒体谱系与核基因组信号的一致性，揭示该物种沿智利海岸生物地理分布模式的形成机制。 文件详解 文件名称：Supplement S2 SNP Data.xlsx 文件格式：XLSX...
