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Xylem_Based美洲黑杨木质素生物合成关键调控因子系统遗传学分析数据
数据集概述 本数据集是美洲黑杨木质素生物合成系统遗传学分析的结果数据，通过整合基因组、转录组和表型数据，识别出调控木质素合成的关键转录因子MYB125。数据包含WGCNA分析模块基因列表及绿松石模块基因特征基因连接性信息，支持木质素生物合成通路及次生细胞壁形成机制的研究。 文件详解...
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PrimitiveCattleGenotypes_原始欧洲牛与原牛遗传数据
数据集概述 本数据集包含原始欧洲牛与原牛（Bos primigenius）的遗传起源、混合模式及种群历史相关数据，基于全基因组单核苷酸多态性分析，涉及欧洲不同地区牛群与原牛的基因交流、种群结构及纯合子片段（ROH）等信息，支持相关遗传研究。 文件详解 文件名称：README_for_PrimitiveCattleGenotypes.docx...
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Dryad_Based所罗门群岛特有鸟类种群规模与遗传风险评估数据2021
数据集概述 本数据集围绕所罗门群岛科伦班加拉岛两种特有绣眼鸟（Z. murphyi和Z. kulambangrae）展开，整合野外调查与基因组序列数据，对比分析成体种群数量（N）与有效种群数量（Ne），揭示种群遗传风险，为长期保护提供基线数据。 文件详解 说明文档...
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Motacilla_alba_Based白鹡鸰亚种杂交区基因组与形态分化数据
数据集概述 本数据集聚焦白鹡鸰（Motacilla alba）alba与personata亚种杂交区，包含19,437个SNP位点的基因组数据及多种形态特征数据，通过3000公里样带分析表型分化对生殖隔离的作用，核心探究头部羽色等性状与基因组分化的关联及 assortative交配偏好的维持机制。 文件详解 文件名称：Sampling, genomic...
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Cryptic_primates_Based_鼠狐猴微特有种分化模式研究数据
数据集概述 本数据集围绕马达加斯加东北部微特有鼠狐猴的物种分化模式展开，补充地理采样缺口并生成新基因组数据，通过多物种 coalescent 模型分析 RADseq 数据，探讨近缘姐妹谱系的生殖隔离进化、基因流差异及物种界定方法的应用价值。 文件详解 文件名称：SupplementaryData.tgz 文件格式：TGZ...
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Acc_tcga_2018_Processed_Based_临床基因组整合数据
数据集概述 本数据集是对cBio portal获取的Acc_tcga_2018数据预处理后，与Pathway Commons节点整合的最终结果，包含边索引、患者信息、生存时间等内容，适用于PyTorch Geometric构建图神经网络（GNNs），共8个文件。 文件详解 图结构文件 文件名称：edge_index.pt 文件格式：PT...
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Arachnida_UCE_Based_蛛形纲超保守元件探针集系统发育分析数据
数据集概述 本数据集包含用于蛛形纲系统发育研究的超保守元件（UCEs）探针集相关数据，涵盖32种不同蛛形纲物种的目标测序结果，平均获取487个UCE位点，可支持系统发育分析、物种界定及多样性研究，共包含2个压缩文件。 文件详解 Trinity_assemblies.zip 文件格式：ZIP...
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Gadus_morhua_Based_大西洋鳕鱼跨大西洋基因组数据合成分析数据集
数据集概述 本数据集为大西洋鳕鱼（Gadus morhua）跨大西洋基因组数据合成分析结果，整合多个区域全基因组单核苷酸多态性（SNP）数据集，形成覆盖54个地点、1494个个体、796个公共位点的跨大西洋数据集，用于解析其跨大西洋分化及二次接触的系统地理模式。 文件详解 文件名称：Cod synthesis SNP list.xlsx...
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Dryad_Based_绿安乐蜥野生种群基因组系统地理学研究数据_archive
数据集概述 本数据集为绿安乐蜥（Anolis carolinensis）野生种群的基因组系统地理学研究数据，通过锚定杂交富集技术分析数百个遗传标记，识别出五个强支持的系统地理群，解决了线粒体DNA与核基因座研究的冲突，揭示其从佛罗里达南部向北分化的进化历史。 文件详解 压缩文件 文件名称：dryad.zip 文件格式：ZIP...
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Pelargonium_Based_澳大利亚天竺葵基因分型种群与系统基因组分解数据
数据集概述 本数据集围绕澳大利亚天竺葵属（Pelargonium）物种，通过基因分型测序开展种群与系统基因组分解研究，整合系统基因组分析、种群遗传聚类、繁殖系统研究及性状分析，探究谱系形成过程，揭示遗传分化与形态分类的差异，涉及物种界定、平行进化及生态型分化等内容。 文件详解 文档文件 文件名称：README_for_PART 2...
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Stickleback_Sex_chromosome_日本三刺鱼物种分化基因组数据
数据集概述 本数据集围绕日本三刺鱼同域物种对的性染色体周转展开，包含日本海种群（新性染色体系统）与太平洋种群（简单XY系统）的基因组测序相关数据，用于探究性染色体周转在表型分化和基因组进化中的功能作用，涉及基因表达、序列分化等研究维度。 文件详解 Brain.xlsx 文件格式：XLSX...
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Uroctonus_Genomic_Based_加州森林蝎子基因组与微特有性研究数据
数据集概述 本数据集包含加州植物区系省（CFP）森林蝎子Uroctonus的基因组数据及分析文件，通过ddRADseq技术获取遗传结构信息，并结合物种分布模型（SDMs）分析现生及末次盛冰期栖息地。数据揭示该物种存在两大遗传类群及多个微特有种群，反映CFP生物多样性形成的历史驱动因素，共含14个文件。 文件详解 说明文档（.docx格式）...
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DeepSTARR_manuscript_Based_基因组区域DNA序列与活性数据
数据集概述 本数据集包含训练和评估DeepSTARR模型所用的基因组区域DNA序列数据、序列活性数据，以及已训练的DeepSTARR模型文件。数据集共8个文件，涵盖训练集、验证集、测试集的序列与活性信息，支持基因组学相关模型的训练与性能评估。 文件详解 序列数据文件...
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Dryad_MEC_21_1349_Based_考拉基因组与环境数据协同管理研究数据
数据集概述 本数据集围绕考拉（Phascolarctos cinereus）的保护展开，整合基因组与环境数据，分析其种群结构、适应性遗传变异及气候演化对生存的影响。研究识别出5个主要遗传集群，探讨了更新世冰川期避难所与适应性在物种存续中的作用，为考拉保护策略提供科学依据。 文件详解 README.docx 文件格式：DOCX...
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gentoo_penguin_Source_巴布亚企鹅物种界定综合研究数据_补充资料
数据集概述 本数据集为巴布亚企鹅物种界定综合研究的补充数据，包含基因组、生态学、形态学等多维度证据，支持将巴布亚企鹅划分为4个独特物种，并描述1个新物种。数据涵盖基因组谱系分析、适应性选择基因、形态测量及未来生态位预测等内容，为研究企鹅物种形成与环境适应提供多源支持。 文件详解 README.md 文件格式：MD...
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Selection_Scans_Based_犬类选择性清除检测_选择扫描性能评估数据
数据集概述 本数据集包含25个犬品种、每个品种25个个体的基因组数据，围绕12个与犬类特定表型相关的因果突变位点，分析其群体基因组选择信号。通过测量因果突变频率识别受正选择的品种，作为阳性对照评估选择扫描统计方法的性能，涉及单倍型和核苷酸多态性模式分析。 文件详解 基因型数据文件...
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Metazoa_Phylogenetic_Signal_后生动物系统发育基因组数据集
数据集概述 本数据集为后生动物系统发育研究的基因组数据，包含1080个直系同源基因座，源自36个公开基因组，覆盖主要动物类群。数据用于优化系统发育信号分区，支持栉水母作为其余后生动物姊妹群的结论，提供基因组系统发育分析的工作流与工具，共15个文件。 文件详解 RAxML_single_genes.zip 文件格式：ZIP...
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Chorthippus_binotatus_Based蚱蜢进化辐射基因组表型整合分析数据
数据集概述 本数据集为蚱蜢（Chorthippus binotatus群）进化辐射研究的基因组与表型整合分析数据，包含两个物种及八个假定亚种的系统发育关系与物种界定相关信息，用于评估不同数据处理方案下的竞争假设，探究位点数量、表型特征等因素对分析结果的影响。 文件详解 03_BPP-iBPP input files.zip 文件格式：ZIP...
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Hodgson_Based马达加斯加近期混合人群Duffy_null等位基因自然选择研究数据
数据集概述 本数据集围绕马达加斯加近期混合人群中Duffy-null等位基因的自然选择展开研究，包含相关程序与数据文件。研究通过基因组数据和模拟分析，探究该等位基因高频出现的原因，支持疟疾抗性驱动其固定的假说，为人类适应性遗传变异研究提供数据支撑。 文件详解 README_for_Hodgson et al Duffy program and...
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Syngnatharia_Based鱼类系统基因组学与历史生物地理学研究补充材料
数据集概述 本数据集是Syngnatharia鱼类（含海马、海龙、鲂鱼等）系统基因组学与历史生物地理学研究的补充材料，包含169种鱼类的基因组数据、时间校准树、祖先分布区估计及敏感性分析结果，覆盖该类群全部10科约25%的物种多样性，用于探究生物地理推断不确定性的驱动因素。 文件详解 README.txt 文件格式：TXT...
