数据集概述
本数据集是Syngnatharia鱼类（含海马、海龙、鲂鱼等）系统基因组学与历史生物地理学研究的补充材料，包含169种鱼类的基因组数据、时间校准树、祖先分布区估计及敏感性分析结果，覆盖该类群全部10科约25%的物种多样性，用于探究生物地理推断不确定性的驱动因素。
文件详解
- README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含研究标题、附录说明及文件清单，说明各补充材料的内容与用途
- Appendix_1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录研究中检测的169种Syngnatharia鱼类标本信息，可能包含物种名、标本编号、采集地等基础元数据
- Phylogenetic_trees.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：存储RAxML和ASTRAL方法构建的系统发育树，以NEXUS格式记录树结构与分支支持度
- Biogeographic_analyses.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内含祖先分布区估计结果、生物地理模型敏感性分析数据（如不同区域划分、扩散参数设置下的推断结果）
- Supplementary_material.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：研究补充文档，包含方法细节、附加分析结果及图表说明
- Alignments_Nexusformat.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内含Ultraconserved Elements（UCEs）序列比对文件，如包含185个类群、932个UCE位点的Alignment_matrix_75p.nex等
数据来源
Santaquiteria et al 2021研究论文
适用场景
- 鱼类系统基因组学研究：利用UCE序列比对数据与系统发育树，分析Syngnatharia鱼类的演化关系与分类地位
- 历史生物地理学分析：通过祖先分布区估计结果，探究Syngnatharia鱼类的起源地（古特提斯海）及扩散路径（ Indo-Pacific至东太平洋、大西洋的迁移事件）
- 生物地理模型敏感性评估：对比不同区域划分、扩散参数（j值）对推断结果的影响，优化生物地理分析方法
- 海洋生物多样性保护：基于物种分布历史与演化速率，识别Syngnatharia鱼类的演化热点区域与保护优先类群
