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基于高通量测序的DNA饮食研究序列比例量化数据集
数据集概述 该数据集围绕高通量测序生成的序列比例能否量化饮食相对丰度展开研究,通过分析圈养斑海豹粪便DNA的Ion Torrent扩增子测序数据,探究测序方向、质量过滤等因素对物种序列比例的影响,为饮食研究中序列比例的定量解读提供方法参考。 文件详解 说明文档(PDF格式): README_for_3 MER R code summary.pdf:3...
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太平洋鲱鱼种内DNA污染与漂白去污对RAD测序及群体遗传统计影响数据集
数据集概述 本数据集围绕太平洋鲱鱼样本的种内DNA污染问题展开,验证漂白去污方法对限制位点相关DNA(RAD)测序的有效性,以及污染对群体遗传统计结果的影响,为海洋鱼类群体遗传研究中的样本处理提供数据支持。 文件详解 文件名称:README_for_DataS1.pdf 文件格式:PDF(.pdf)...
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家猫乙型肝炎病毒的古老起源与全球传播补充数据集
数据集概述 本数据集是论文《家猫乙型肝炎病毒的古老起源与全球传播》的补充数据,包含支持共进化分析、假设检验及高通量测序的原始数据,为研究家猫乙肝病毒的进化历史与传播路径提供基础资料。 文件详解 共进化分析文件(NEXUS格式): CytBnt.nex:NEXUS格式文件,用于宿主与嗜肝病毒的序列比对及共进化分析...
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多物种鱼类环境DNA高通量测序补充材料8
数据集概述 本数据集为多物种鱼类环境DNA高通量测序研究的补充材料8,聚焦MiSeq测序读数与qPCR定量DNA拷贝数的关系,包含总鱼类及两种特定鱼类(日本鳀、日本竹䇲鱼)的相关性分析图表及回归结果说明。 文件详解 文件名称: oo_186036.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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湖泊真菌群落Blast分析补充材料
数据集概述 本数据集为湖泊真菌群落研究的补充材料,包含基于NCBI nt数据库(2015年6月)的真核生物Blast分析结果,以Megan5图形式呈现,支持对德国东北部温带贫中营养型施特希林湖不同生境真菌群落特异性的研究。 文件详解 该数据集包含一个PDF格式的文档文件,具体如下: - 文件名称: oo_107543.pdf - 文件格式: PDF...
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鱼类环境DNA多物种定量监测补充材料3
数据集概述 本数据集为鱼类环境DNA多物种定量监测研究的补充材料,包含TaqMan探针特异性测试说明及补充表S1、S2,支持环境DNA高通量测序相关研究的验证与参考。 文件详解 文件名称: oo_173176.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 包含TaqMan探针特异性测试的详细描述,以及补充表S1和S2的相关数据内容 适用场景...
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斯利科克溪流域生物资源调查2016年扫网样本宏基因组原始数据集
数据集概述 该数据集包含2016年美国阿拉斯加基奈半岛斯利科克溪流域生物资源调查中扫网样本的宏基因组原始数据,含125个样本的高通量测序FASTQ文件及采集数据,用于分析流域内节肢动物等生物多样性。 文件详解...
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Galaxy_CRISPR_Screen_Based_基因编辑筛选分析完整数据
数据集概述 该数据集为Galaxy平台CRISPR筛选分析教程配套数据,包含原始测序数据、分析配置文件、结果报告等多种类型文件,覆盖CRISPR实验从原始数据到分析结果的全流程,为学习和实践CRISPR筛选数据分析提供完整支持。 文件详解 该数据集包含10个文件,具体说明如下: - 原始测序数据文件(.gz格式): -...
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海岸雾沙漠地衣真菌近缘谱系物种边界与微特有性假设检验数据集
数据集概述 本数据集围绕海岸雾沙漠地衣真菌近缘谱系的物种边界问题展开,通过基因组数据检验微特有性假设,探讨传统表型方法与高通量测序技术在物种界定中的应用差异,以及分子界定模型面临的进化因素与计算局限。 文件详解 分析结果文件(PDF格式): supplementary_S5_topologies_IQtree_svdquartets.pdf:IQ-...
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鱼类环境DNA高通量测序多物种定量监测补充材料5
数据集概述 本数据集为鱼类环境DNA高通量测序多物种定量监测研究的补充材料5,内容聚焦52个样本的回归残差与标准DNA拷贝数之间的关系,通过虚线标注零残差点,为研究提供支撑。 文件详解 文件名称: oo_173173.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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锚定杂交富集高通量系统发育基因组学数据集
数据集概述 本数据集围绕锚定杂交富集技术展开,该技术通过脊椎动物基因组保守锚定区域设计探针,在非模式物种中高效获取大量基因位点,可应用于不同时间尺度的系统发育研究,具备低成本、快速数据收集的特点。 文件详解 说明文档文件: README_for_Lemmon-etal2012_Scripts.txt:TXT格式,可能说明脚本相关信息...
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数据16S宏基因组学示例数据集
数据集概述 本数据集是基于Batista et al. (2015)数据转换得到的16S宏基因组学示例数据,包含野生型未处理(WT untreated)和链霉素处理后(WT after Streptomycin treatment)两种条件,各五个重复样本,每个样本原始正向测序读段提取一万条,含元数据、测序读段及参考数据集,共13个文件。 文件详解...
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群体表观遗传学简化ATAC_seq协议支持数据集
数据集概述 该数据集是研究论文《群体表观遗传学简化ATAC-seq协议》的支持数据,包含简化的转座酶可及性染色质高通量测序(ATAC-seq)实验相关文件,适用于小型生物样本,提供染色质可及区域的研究支持。 文件详解 实验分析报告文件(PDF格式): BioAnalyser.pdf、BioAnalyser 2.pdf、BioAnalyser...
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细胞条形码图像识别与分类数据集CellBarcodeImageRecognitionandClassificationDataset-susanshly
细胞条形码图像识别与分类数据集CellBarcodeImageRecognitionandClassificationDataset-susanshly 数据来源:互联网公开数据 标签:细胞条形码, 图像识别, 机器学习, 单细胞分析, 生物信息学, 高通量测序, 数据挖掘, 细胞分类 数据概述:...
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基因表达预测多基因数据集GeneExpressionPredictionMulti-GeneDataset-m7mdalbaddawi
基因表达预测多基因数据集GeneExpressionPredictionMulti-GeneDataset-m7mdalbaddawi 数据来源:互联网公开数据 标签:基因表达, 基因组学, 预测模型, 多基因, 基因芯片, 生物信息学, 高通量测序, 机器学习 数据概述:...
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单细胞转录组基因表达谱数据集Single-CellTranscriptomeGeneExpressionProfiles-yanasem
单细胞转录组基因表达谱数据集Single-CellTranscriptomeGeneExpressionProfiles-yanasem 数据来源:互联网公开数据 标签:单细胞, 转录组, 基因表达, 生物信息学, 细胞分析, 高通量测序, 机器学习, 细胞异质性 数据概述:...
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基因表达谱分析数据集GeneExpressionProfileAnalysis-zpj666
基因表达谱分析数据集GeneExpressionProfileAnalysis-zpj666 数据来源:互联网公开数据 标签:基因表达, 基因组学, 生物信息学, 表达谱, 高通量测序, 基因调控, 疾病研究, 机器学习 数据概述: 该数据集包含来自高通量测序实验的基因表达数据,记录了多种基因在不同样本中的表达水平。主要特征如下:...
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肿瘤基因表达谱数据集TumorGeneExpressionProfileDataset-ganluqin
肿瘤基因表达谱数据集TumorGeneExpressionProfileDataset-ganluqin 数据来源:互联网公开数据 标签:基因表达, 肿瘤, 基因组学, 生物信息学, 机器学习, 癌症研究, 疾病分类, 高通量测序 数据概述:...
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基因表达谱数据集GeneExpressionProfileDataset-gargithakur09
基因表达谱数据集GeneExpressionProfileDataset-gargithakur09 数据来源:互联网公开数据 标签:基因表达, 生物信息学, 基因组学, 表达谱分析, 高通量测序, 生物医学研究, 机器学习, 数据挖掘 数据概述: 该数据集包含来自基因表达研究的数据,记录了不同样本中基因的表达水平。主要特征如下:...
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免疫缺陷疾病皮肤病毒组研究数据集ImmunodeficiencySkinViromeResearchDataset-fabulinus
免疫缺陷疾病皮肤病毒组研究数据集ImmunodeficiencySkinViromeResearchDataset-fabulinus 数据来源:互联网公开数据 标签:免疫学, 病毒学, 皮肤病学, 宏基因组学, 高通量测序, 生物信息学, 疾病研究, 文本分析 数据概述:...



