锚定杂交富集高通量系统发育基因组学数据集

数据集概述

本数据集围绕锚定杂交富集技术展开,该技术通过脊椎动物基因组保守锚定区域设计探针,在非模式物种中高效获取大量基因位点,可应用于不同时间尺度的系统发育研究,具备低成本、快速数据收集的特点。

文件详解

  • 说明文档文件:
  • README_for_Lemmon-etal2012_Scripts.txt:TXT格式,可能说明脚本相关信息
  • README_for_Lemmon-etal2012_Alignments.txt:TXT格式,可能说明比对文件相关信息
  • README_for_Lemmon-etal2012_Probes.txt:TXT格式,包含探针坐标对应人类基因组hg19版本、探针ID编码规则等信息
  • 压缩文件:
  • Lemmon-etal2012_Alignments.zip:ZIP格式,可能包含序列比对数据
  • Lemmon-etal2012_Phylogenetics_BEST_Tetrapod_treeDist.zip:ZIP格式,可能包含四足动物最佳系统发育树及距离数据
  • Lemmon-etal2012_Phylogenetics_BEST_Tetrapod.zip:ZIP格式,可能包含四足动物最佳系统发育树数据
  • Lemmon-etal2012_Scripts.zip:ZIP格式,可能包含分析脚本
  • Lemmon-etal2012_Contigs.zip:ZIP格式,可能包含重叠群数据
  • Lemmon-etal2012_Phylogenetics_BEST_Amniote_treeDist.zip:ZIP格式,可能包含羊膜动物最佳系统发育树及距离数据
  • Lemmon-etal2012_Phylogenetics_BEST_Amniote.zip:ZIP格式,可能包含羊膜动物最佳系统发育树数据
  • 表格文件:
  • Lemmon-etal2012_SupplementalTables.xls:XLS格式,可能包含补充表格数据
  • PDF文件:
  • Lemmon-etal2012_SupplementalMaterials.pdf:PDF格式,可能包含补充材料内容

适用场景

  • 系统发育树构建:用于深尺度和浅尺度生物类群的系统发育关系解析
  • 基因组技术研究:分析锚定杂交富集技术在非模式物种中的应用效果
  • 进化生物学研究:探究不同时间尺度下生物类群的进化历程
  • 分子生态学研究:为物种多样性、种群结构等研究提供基因位点数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 287.11 MiB
最后更新 2025年12月8日
创建于 2025年12月8日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。