基于高通量测序的DNA饮食研究序列比例量化数据集

数据集概述

该数据集围绕高通量测序生成的序列比例能否量化饮食相对丰度展开研究,通过分析圈养斑海豹粪便DNA的Ion Torrent扩增子测序数据,探究测序方向、质量过滤等因素对物种序列比例的影响,为饮食研究中序列比例的定量解读提供方法参考。

文件详解

  • 说明文档(PDF格式):
  • README_for_3 MER R code summary.pdf:3 MER R代码摘要说明文档
  • README_for_Ion Torrent diet data.pdf:Ion Torrent饮食数据说明文档
  • README_for_1 MER paper functions.pdf:1 MER论文函数说明文档
  • README_for_2 MER R code database.pdf:2 MER R代码数据库说明文档
  • 代码文件(R格式):
  • 1 MER paper functions.r:1 MER论文相关函数代码
  • 2 MER R code database.r:2 MER R代码数据库文件
  • 3 MER R code summary.r:3 MER R代码摘要文件
  • 数据压缩包(ZIP格式):
  • Ion Torrent diet data.zip:Ion Torrent饮食数据压缩包

适用场景

  • 环境DNA饮食研究:分析高通量测序序列比例与实际饮食丰度的关联
  • 测序方法优化:探究测序方向、质量过滤等参数对物种序列比例的影响
  • 生物信息学分析:验证不同数据处理策略在饮食数据定量解读中的效果
  • 实验设计参考:为高通量测序在饮食研究中的应用提供实验设计依据
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 146.87 MiB
最后更新 2025年12月16日
创建于 2025年12月16日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。