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Rtapas_R包相关的协同进化信号评估数据集
数据集概述 本数据集包含与Rtapas R包相关的文件,Rtapas用于评估两个进化历史间的协同进化信号,可处理大型系统发育树,适用于复杂宿主-共生体进化历史分析及不同DNA标记系统发育树的拓扑一致性评估。 文件详解 README.md:...
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原生蚂蚁超级群落镶嵌结构数据集
数据集概述 本数据集围绕原生蚂蚁超级群落的镶嵌结构展开,基于包容适应性理论,研究了蚁属Formica exsecta两个超级群落的空间结构与遗传相关性,通过核基因和线粒体标记揭示了超级群落社会组织的不同空间遗传结构形成路径。 文件详解 文件名称: README_for_Seppa et al_dryad...
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南非隐象鼻虫修订附录1_PCR引物及条件数据集
数据集概述 本数据集为《南非隐象鼻虫修订及新属新种描述》一文的附录1,内容为PCR引物及反应条件表格,包含COI、EF1等基因的引物序列、参考来源及M13尾标记信息,支持隐象鼻虫分类学研究的分子数据验证。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 内容说明:...
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巨蚓科与粗环蚓类系统发育分析表4数据集
数据集概述 本数据集为巨蚓科与粗环蚓类系统发育研究中的表4数据,记录了SUM模型树节点的单独及联合分区支持度,包含似然权重置信集、Bootstrap值、分区支持度等指标,用于分析不同数据集对进化分支的支持或冲突情况。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段示例: c: 似然权重置信集指标...
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矾根属系统发育基因组冲突数据集
数据集概述 本数据集围绕矾根属(Heuchera)的系统发育基因组冲突展开,整合了核基因、质体和线粒体三类独立基因组数据,通过多种分析策略揭示物种杂交导致的系统发育不一致现象,为植物进化研究提供多维度数据支持。 文件详解 该数据集包含53个文件,涵盖多种格式,具体说明如下: - 附录与统计文件: - Appendix1_Coverage...
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莫尔莫普蝙蝠_翼手目_莫尔莫普科_分化地理研究表3数据集
数据集概述 本数据集为《莫尔莫普蝙蝠分化地理研究》中的表3内容,记录了基于不同分子与形态数据集(如细胞色素b、线粒体DNA、Rag 2基因、形态学)对莫尔莫普科蝙蝠各类群间亲缘关系的支持度,包括Bremer支持值和刀切法值。 文件详解 文件名称:table.html 文件格式:HTML(.html)...
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被子植物生命树综合系统基因组学平台数据集
数据集概述 该数据集是基于Angiosperms353序列捕获探针的被子植物核基因系统基因组学研究成果,包含验证后的样本数据、物种树及中间文件,通过邱园生命树探索器公开访问,支持被子植物进化关系研究。 文件详解 核心数据压缩包: Baker_et_al_data_and_trees.zip: 压缩文件,包含主要数据和进化树文件 补充材料文档:...
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中欧淡水腹毛动物基因序列特征数据集
数据集概述 本数据集为Table 1的内容,记录了七种中欧淡水腹毛动物(Heterolepidoderma属和Halichaetoderma属)的核基因与线粒体基因序列特征,包含基因长度、GC含量及GenBank登录号等核心信息。 文件详解 文件名称:table.html 文件格式:HTML 字段映射:包含物种名称、标本编号、18S...
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秘鲁捕鸟蛛Homoeomma_peruvianum修订研究中的分子标记数据表
数据集概述 该数据集对应研究论文中的表格1,内容为秘鲁捕鸟蛛Homoeomma peruvianum分类修订研究中使用的分子标记、基因组归属及对应引物序列信息,涵盖线粒体COI、核基因18S和28S等分子标记的引物设计细节,为捕鸟蛛分类及演化研究提供分子数据支撑。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html)...
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雪田鼠系统学研究数据集
数据集概述 本数据集围绕雪田鼠属(Chionomys)的系统学研究展开,包含基于线粒体和Y染色体分子标记的遗传变异数据,用于解析雪田鼠的进化历史、物种间关系及分类地位,为其起源与扩散研究提供支持。 文件详解 说明文档类: 1_README.doc、1_README.pdf:数据集整体说明文档,格式分别为DOC和PDF...
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跳小蜂亚科系统发育与分类研究的PCR引物及条件数据表
数据集概述 该数据集是一份HTML格式的表格文件,记录了用于跳小蜂亚科(Liviinae)系统发育与分类研究的PCR引物序列、扩增片段长度及反应条件,涉及COI、Cytb、H3、wg等基因,包含常规PCR和巢式PCR的相关参数。 文件详解 数据集包含一个HTML格式的表格文件,具体说明如下: - 文件名称: table.html - 文件格式:...
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真蛙属时空多样化研究数据集
数据集概述 该数据集围绕真蛙属(Rana)的时空多样化展开,包含基于核基因与线粒体基因序列构建的系统发育树及相关补充材料,支持“走出亚洲”的扩散模式、新旧大陆分化轨迹等进化历史研究,为模型生物真蛙属的比较分析提供基础。 文件详解 文件名称:...
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天门冬属分子系统发育研究物种及基因库登录号数据集
数据集概述 本数据集为天门冬属(Asparagus)分子系统发育研究的配套表格数据,记录了研究涉及的天门冬属及外类群物种的基本信息,包括物种名称、分布型、来源凭证及GenBank基因库登录号,为相关系统发育分析提供基础数据支持。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML(.html) 字段映射: Species: 物种名称...
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热带植物金莲木科系统基因组学分析数据表
数据集概述 本数据集为热带植物金莲木科(Ochnaceae)系统基因组学研究的配套数据表,记录了264个样本在核基因靶向富集实验中的组装与富集统计数据,覆盖科内主要分支,为该科系统发育分析提供基础支撑。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 内容字段:...
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巨蚓科与粗线蚓类系统发育研究测序分类单元表
数据集概述 本数据集为巨蚓科与粗线蚓类系统发育研究的测序分类单元表,基于Jamieson分类系统,包含外类群(蛭纲)和内类群(寡毛纲)的分类单元、采集地点、核基因(28S)及线粒体基因(12S、16S)的GenBank登录号等信息,为环节动物门寡毛纲的系统发育分析提供基础数据。 文件详解 文件名称:table.html 文件格式:HTML...
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加勒比地区类银腹蛛系统地理研究补充材料2
数据集概述 本数据集为学术研究的补充材料,包含基于两个核基因的贝叶斯系统发育树图谱,用于支撑加勒比地区类银腹蛛及其古巴新隐存种的系统地理分析研究,为物种演化关系提供可视化证据。 文件详解 该数据集包含一个PDF格式的文档文件,具体如下: - 文件名称: oo_107229.pdf - 文件格式: PDF (.pdf) - 文件内容:...
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北美蝉类辐射演化系统发育矩阵分区方案表
数据集概述 该数据集为表格式文件,呈现了通过PartitionFinder 2分析得到的北美蝉类辐射演化系统发育矩阵分区方案。内容涵盖基于nDNA、mtDNA及串联矩阵的三类分析,明确了不同基因区域对应的进化模型,为蝉类系统发育研究提供标准化的矩阵分区参考。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 文件内容:...
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蜥蜴属Liolaemus杂交现象研究数据集
数据集概述 本数据集围绕南美蜥蜴属Liolaemus中杂交现象展开研究,包含127个个体的12个核基因与2个线粒体基因分子数据,通过基因树冲突分析及新提出的“额外谱系贡献”统计方法,验证L. boulengeri和L. rothi复合体间的杂交假设,为理解该属进化中杂交的作用提供数据支持。 文件详解 README_for_fasta-...
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新蛇属种分子系统发育研究引物与PCR条件数据表
数据集概述 该数据集为研究论文《Hiding in the mists》中的表1,记录了用于分析新蛇属种分子系统发育的引物序列及PCR反应条件,包含线粒体和核基因位点的引物信息、退火温度及来源文献。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射: Locus: 基因位点 Gene type: 基因类型(线粒体/核基因)...
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巴拿马云雾林新属Synchrospora系统发育数据集
数据集概述 本数据集包含巴拿马热带云雾林中新发现的霜霉科新属Synchrospora的系统发育研究数据,涉及核基因(ITS、LSU、β-微管蛋白)和线粒体基因(cox1、cox2)的序列分析,支持该新属及模式种S. medusiformis的分类学描述。 文件详解...



