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Zinc_IFN_λ3_Based锌抑制干扰素信号通路实验数据
数据集概述 本数据集来自锌对IFN-λ3信号通路抑制作用的研究，聚焦IFN-λ3信号通路与锌的相互作用机制，包含实验相关的结构化数据，支持锌对IFN-λ3信号通路抑制作用的分析验证。 文件详解 文件名称：Array.xlsx 文件格式：XLSX...
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Prednisolone_GIOP斑马鱼基因表达与信号通路数据
数据集概述 本数据集为泼尼松龙诱导斑马鱼幼鱼骨质疏松样表型的研究数据，包含RNA-seq基因表达结果及KEGG通路分析相关补充数据。研究聚焦糖皮质激素性骨质疏松（GIOP）机制，揭示泼尼松龙通过黏着斑信号通路调控itga10、itgbl1等基因表达的作用，共含4个Excel文件。 文件详解 文件名称：Supplementary excel 1.xlsx...
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tpj16734_sup_豌豆种子外皮驯化基因表达及代谢物数据
数据集概述 本数据集为论文“Domestication has altered gene expression and secondary metabolites in pea seed coat”的补充数据，包含24个表格和28个图，涵盖豌豆种皮驯化过程中的基因表达、代谢物分析、蛋白质组学及仪器参数等内容，支持研究豌豆种皮驯化对基因与代谢物的影响。...
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Supplementary_data_手稿与转录组分析原始数据
数据集概述 本数据集为科研手稿的补充数据，包含手稿源数据压缩包和转录组分析原始数据表格，共2个文件。数据未进行训练/测试、数据/标签或原始/处理拆分，可用于支持相关科研手稿的转录组分析验证与补充研究。 文件详解 文件名称：Source data.rar 文件格式：RAR 字段映射介绍：科研手稿的源数据压缩包，具体内容需解压后查看 文件名称：Raw...
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KGDRP_Based生物医学知识图谱驱动的药物反应预测数据集
数据集概述 本数据集为KGDRP框架配套数据，包含生物医学知识图谱（BioHG）及药物反应相关多组学数据，整合药物、蛋白质、细胞系等实体交互关系，支持可解释的药物反应预测，助力表型药物发现与靶点优先级排序。数据存储于./data/文件夹，含知识图谱、特征数据及负样本等文件。 文件详解 知识图谱文件 文件名称：dppc_kg.csv 文件格式：CSV...
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Cox_Sage_Based_癌症预后基因临床处理数据_待发表
数据集概述 本数据集为论文“Cox-Sage: Enhancing Cox proportional hazards model with interpretable graph neural networks for cancer...
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空间分辨转录组学_小鼠骨骼肌神经损伤空间转录组数据_发布版本1
数据集概述 本数据集为小鼠骨骼肌可逆神经损伤的空间转录组数据，是论文“Spatially resolved transcriptomics reveals innervation-responsive functional clusters in skeletal...
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Delta_Ct_HCV相关肝癌肿瘤与癌旁组织基因表达验证数据
数据集概述 本数据集包含通过定制多重阵列qPCR技术，在59对匹配的HCV相关肝癌（HCC）肿瘤组织和癌旁组织中验证90个基因表达的Delta Ct数据，采用ΔΔCt法计算基因表达水平，共包含一个文件。 文件详解 文件名称：Delta Ct HCC peritumours and tumours.xlsx 文件格式：XLSX...
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Gm364_Based_雌性生育力调控AKT激活实验补充数据集
数据集概述 本数据集为Gm364基因调控雌性生育力研究的补充数据，包含四个文件，对应论文中不同图表的实验结果。内容涉及生育力实验的随机分配表、基因表达FPKM值、DNA甲基化数据及差异表达基因/区域的Top20分析，支持研究Gm364通过AKT激活调控雌性生育力的机制。 文件详解 Supplementary dataset 1.xlsx...
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SOAPy_Source_Python包空间架构分析配套数据集
数据集概述 本数据集为SOAPy（用于解析空间架构、动态和通信的Python包）文章及教程配套数据，包含五个文件，涵盖空间组学样本数据、数据来源说明及聚类结果。数据可用于空间组学分析相关研究，支持用户通过数据来源文件获取原始数据链接。 文件详解 数据来源说明文件 文件名称：data sources.xlsx 文件格式：XLSX...
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Grisanti_Based_心脏βAR刺激时序基因表达调控数据
数据集概述 本数据集源自C57BL/6小鼠心脏实验，记录慢性β-肾上腺素能受体（βAR）刺激下，心脏转录本（含细胞因子）的时序变化及吉非替尼（Gef）的干预效果。实验设1周/2周时间点，分析心脏收缩功能、肥大/纤维化/凋亡指标，通过RNAseq和RT-qPCR验证基因表达模式，探究EGFR转激活的调控作用，共含1个文件。 文件详解...
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SED_Based_乳腺癌空间肿瘤形状临床意义与分子特征研究数据
数据集概述 本数据集包含2250例2000-2007年手术乳腺癌患者的三维肿瘤大小、体积数据，通过椭球与球体体积差（SED）评估肿瘤偏心度，同时包含41例患者的转录组和外显子测序数据，用于分析肿瘤空间形状的临床意义及分子机制。 文件详解 文件名称：SED vs Transcriptome Profile.xlsx 文件格式：XLSX...
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FUSCC_Based_HER2_low乳腺癌最小数据集2023
数据集概述 本数据集为复旦大学附属肿瘤医院（FUSCC）HER2-low乳腺癌研究的最小数据集，对应2023年发表于《Nature Communications》的研究，包含中国HER2-low乳腺癌患者的分子特征与临床异质性相关数据，共1个文件。 文件详解 文件名称：Minimum dataset.xlsx 文件格式：XLSX...
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Celf1_Based_晶状体发育纤维细胞核降解调控机制研究数据
数据集概述 本数据集为RNA结合蛋白Celf1调控晶状体发育的研究数据，包含13个文件，主要记录Celf1通过转录后调控p27Kip1、Dnase2b等关键基因控制晶状体纤维细胞核降解的相关实验结果，涉及基因表达、蛋白结合及形态调控等内容，支持晶状体发育分子机制研究。 文件详解 数据文件组（共13个）...
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RT_qPCR_Based_tsRNAs和mRNAs引物序列数据
数据集概述 本数据集提供RT-qPCR实验中使用的tsRNAs和mRNAs引物的详细序列信息，为分子生物学实验中的基因表达检测提供引物设计参考。数据集仅包含一个文件。 文件详解 文件名称：Table S1.docx 文件格式：DOCX 字段映射介绍：包含RT-...
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Mimulus_Based_气候变化下基因表达可塑性进化分析数据
数据集概述 本数据集包含北美西部猩红色猴面花（Mimulus cardinalis）的基因表达可塑性分析数据及R脚本，用于研究高温调控基因表达的空间变异与气候变化下可塑性进化的关系。数据基于不同纬度、年份（2010和2017）样本在两种热环境下的转录组分析，验证表型可塑性随气候变暖的进化模式，共含32个文件。 文件详解 样本信息文件...
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生态相关性与能量代谢_潮间带帽贝能量代谢基因表达数据_2015年
数据集概述 本数据集聚焦潮间带帽贝Cellana toreuma在温度、干燥和降雨胁迫下的能量代谢转录响应，量化能量感知、分解代谢及能量消耗相关生物标志物的基因表达水平，通过基因表达模式将个体分为三组能量胁迫等级，分析单一及复合胁迫对细胞能量状态的影响，含2个相关文件。 文件详解 说明文档： 文件名称：README_for_Gene...
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PIC_Based_紫檀芪调节破骨细胞分化凋亡实验数据_原始数据
数据集概述 本数据集为紫檀芪（PIC）对破骨细胞影响的实验数据，包含PIC抑制RANKL诱导的破骨细胞形成、骨吸收及促进成熟破骨细胞凋亡的相关实验结果，涉及细胞计数、活性检测、基因表达等指标，共6个文件，支持骨疾病治疗机制研究。 文件详解 细胞计数文件：TRAP cell count.xls，格式XLS，记录TRAP染色的破骨细胞数量数据...
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H_desertis_G11_nEPS合成基因标准曲线与表格数据
数据集概述 本数据集包含H desertis G11菌株中与nEPS（中性胞外多糖）合成相关的基因信息及标准曲线数据，核心为一份文档文件，记录了相关基因的分子生物学分析基础数据，可用于微生物nEPS合成机制的研究。 文件详解 文件名称：Standard curves and table of genes implicated in EPS...
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nicotine_Based_尼古丁对碱烧伤角膜愈合影响研究数据
数据集概述 本数据集为研究尼古丁对急性碱烧伤后角膜伤口愈合影响的相关数据，包含实验结果的图表文件和Excel文件，共5个文件。研究通过动物模型和体外实验，分析尼古丁对角膜新生血管形成、纤维化过程及相关基因表达的影响，探究其作用机制。 文件详解 图表文件（共4个） 文件名称：Figure 1.zip、Figure 2.zip、Figure...
