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灯兰属组分子系统研究引物序列表
数据集概述 该数据集为灯兰属组（番杏科）分子系统研究的引物序列表，包含叶绿体trnL-trnF、核ITS及5S NTS基因区域的扩增与测序引物序列，以HTML格式呈现相关实验所用引物信息。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 内容说明:...
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路易斯安那州立大学2022年生物信息学研讨会课程材料
数据集概述 本数据集为2022年路易斯安那州立大学生物信息学研讨会课程材料，围绕桡足类动物盐度胁迫下的RNA-Seq数据分析展开，包含实验流程、数据分析工具使用及相关示例文件，供学员学习生物信息学分析方法。 文件详解 文档类文件（PDF格式，共9个）：...
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MiXCR分析TCR_seq与BCR_seq数据输出文件
数据集概述 本数据集为MiXCR软件分析T细胞受体测序（TCR-seq）和B细胞受体测序（BCR-seq）数据后生成的输出文件，以压缩包形式存储，未提供具体内容预览，为免疫组库相关研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称：mixcr4_TCR_BCR.zip 文件格式：ZIP压缩包（.zip） 内容说明：包含MiXCR分析TCR-seq和BCR-...
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海洋线虫DNA元条形码分析参考数据集补充材料18
数据集概述 本数据集为海洋线虫DNA元条形码分析的补充材料，包含基于“过滤”数据集经MAFFT比对后构建的邻接树（Neighbor joining tree）相关图像，用于支持树基分类学分配方法的参考数据集评估研究。 文件详解 文件名称：oo_85411.jpg 文件格式：JPG（.jpg）...
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细胞迁移掩码图像跟踪教程数据集
数据集概述 本数据集为教程数据，用于演示如何使用掩码图像通过TrackMate工具进行细胞迁移跟踪。包含大小两种演示影片及相关辅助文件，帮助用户掌握该跟踪方法。 文件详解 文件名称: Cancer_migration_masks.xml，文件格式: XML，可能为跟踪配置或元数据文件 文件名称: A_Cancer_migration_masks-...
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韩国本土鸡单核苷酸多态性面板密度与参考群体规模的插补性能评估数据集
数据集概述 本数据集围绕韩国本土鸡（KNC）和燕山乌鸡（YO）群体，评估不同单核苷酸多态性（SNP）面板密度与参考群体规模对基因型插补性能的影响，为地方畜禽遗传改良提供数据支持。 文件详解...
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单核细胞转录组学细胞状态数据集_DECODE
数据集概述 该数据集为单核细胞转录组学数据，包含细胞状态相关信息（DECODE），以压缩文件形式存储，未提供具体内容预览。 文件详解 文件名称：Monocytes_sce.zip 文件格式：ZIP（压缩文件） 内容说明：未提供文件内容预览，推测包含单核细胞转录组学及细胞状态相关的原始或处理后数据。 适用场景...
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Dryocosmus属物种表型语义陈述补充材料
数据集概述 该数据集为Dryocosmus属物种相关研究的补充材料，包含以OWL曼彻斯特语法撰写的自然语言表型语义陈述，用于结构化描述物种表型特征，支持生物分类学相关分析。 文件详解 文件名称: oo_115574.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 内容说明: 采用Protégé...
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埃塞俄比亚特有层状齿鼠基因组多样性研究数据集
数据集概述 本数据集为埃塞俄比亚特有层状齿鼠（Otomys属）基因组多样性研究的配套表格数据，记录了ddRAD测序生成的不同占有率数据集的核心指标，包括基因座数、单核苷酸多态性、简约信息位点及样本量，为物种进化历史与分类研究提供支撑。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射:...
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Relate量化正选择分析示例数据集
数据集概述 本数据集提供了一个完整的示例，展示如何使用Relate工具对1000 Genomes Project中CEU样本的LCT基因区域进行正选择分析。通过构建Relate树并利用RelateSelection模块，计算每个SNP的p值以量化其竞争优势。 文件详解 该数据集包含两个文件，具体说明如下： - 文件名称:...
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环境富集对神经三维染色质互作组的年龄依赖性效应数据集
数据集概述 本数据集包含年轻与老年小鼠海马神经元经低输入启动子捕获Hi-C（liCHi-C）及RNA-seq处理后的相关数据，用于探究年龄及环境富集对染色质互作组组织与基因表达的影响，涉及13个处理后数据文件及附加文件。 文件详解 说明文档：...
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生物信息学科学工作流开发的大语言模型评估数据集
数据集概述 本数据集包含6个PDF文件，围绕大语言模型（LLMs）在生物信息学科学工作流开发中的应用展开多维度评估，涵盖LLMs对基础概念、Galaxy与Nextflow平台的理解，以及针对具体任务生成实际工作流的能力。 文件详解 基础概念评估文件： Table-2...
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GHOST模型系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集围绕GHOST模型展开，包含系统发育分析相关的序列比对、树文件、补充文档及基因序列文件，用于验证该模型在处理异速进化序列时的性能，支持系统发育推断研究。 文件详解 文件名称: Chiari_amnios248genes_nt.nex 文件格式: .nex 内容: 包含248个基因的核苷酸序列比对数据，用于系统发育分析。 文件名称:...
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空间模式增强的细胞与组织识别_空间转录组学_数据集
数据集概述 本数据集为空间转录组学研究提供支持，包含用于验证SPECTRUM方法的模拟数据及R语言软件包。SPECTRUM方法结合已知细胞类型标记与空间加权，用于细胞类型识别和空间群落检测，数据集助力相关算法性能评估与复现。 文件详解 simulate_MPOA_data.rds：R语言数据格式（.rds），模拟MPOA组织空间转录组数据...
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Halamphora_witkowskii_rbcL系统发育分析文件
数据集概述 该数据集包含用于Halamphora witkowskii物种rbcL基因系统发育分析的相关文件，涵盖系统发育树可视化、序列信息及基因序列比对数据，为研究该物种的分子系统发育关系提供支持。 文件详解 文件名称：Supplementary File 1. HW_1.1_fulltree.jpg 文件格式：JPG 内容说明：Halamphora...
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临床与实验生物学转录组学研究补充数据集
数据集概述 本数据集是《Transcriptomics for clinical and experimental biology research: hang on a seq》论文的补充资料，包含生成论文图表的R脚本、源数据文件及额外图表，支持转录组学相关研究的复现与扩展分析。 文件详解 该数据集包含以下文件类型及内容： - 代码文件： -...
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IWTomics_ETn_Based_小鼠内源性逆转录病毒整合偏好完整数据
数据集概述 该数据集包含小鼠内源性逆转录病毒ETn整合位点相关的基因组区域数据及重组热点特征。具体包括ETn固定区域、对照区域两组区域数据，以及基于1千碱基窗口测量的重组热点含量特征，为研究ETn整合与固定偏好提供数据支持。 文件详解 描述文件: DESCRIPTION.txt: TXT格式，说明数据集包含的区域数据集和特征内容 区域数据文件:...
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mimicINT工作流应用案例数据集
数据集概述 本数据集围绕mimicINT工作流的应用案例构建，包含其在识别大肠杆菌效应蛋白与人类蛋白互作界面、推断马尔堡病毒蛋白与人类蛋白互作中的应用数据，以压缩包形式存储。 文件详解 文件名称：Choteau-etal_Supplementary-Data.zip 文件格式：ZIP压缩包...
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生物医学可变剪接可视化网络应用使用说明
数据集概述 本数据集为GeneAPPExplorer生成的示例输出文件，展示了GeneAPP（一款注册软件）在整合、探索和可视化可变剪接数据方面的应用。GeneAPP通过客户端-服务器管道套件，将不同工具的差异可变剪接分析结果与生物数据库结合，提供图形化展示，辅助实验验证候选靶点的选择。 文件详解 文件名称:...
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第勒尼安壁蜥紫外线反射色块信息含量与体色视觉感知数据集
数据集概述 本数据集包含与同名科学出版物对应的第勒尼安壁蜥（Podarcis tiliguerta）紫外线反射色块信息含量及体色视觉感知相关的实验数据和分析脚本，为验证该研究的结论提供了完整的数据支持。 文件详解 数据文件：...
