找到213个数据集

标签: FASTA格式

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  • Ha等人关于生物防治线虫感染灰田蛞蝓的微生物组动态研究数据产品

    2025年12月14日   

    数据集概述 该数据集是Ha等人关于生物防治线虫(Phasmarhabditis hermaphrodita)感染灰田蛞蝓的微生物组动态研究的数据产品,包含处理后的微生物组数据文件及补充材料,支持相关微生物组结构与变化的分析。 文件详解 该数据集包含处理后数据文件和补充材料,具体说明如下: - 处理后数据产品: -...
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  • 单分子标记界定物种贫乏数据集研究数据集

    2025年12月14日   

    数据集概述 本数据集围绕单分子标记界定物种贫乏数据集展开研究,对比条形码间隙检测、单倍型网络和GMYC模型在不同物种数量、种群规模等条件下的性能,为物种界定方法选择提供依据。 文件详解 文档文件: countffrs_readme.txt:TXT格式,包含countffrs.pl程序的使用说明,需输入FASTA格式文件、随机抽样个体数等参数...
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  • SARS_CoV_2全基因组结构与功能建模数据集

    2025年12月14日   

    数据集概述 本数据集提供了针对SARS-CoV-2基因组中所有蛋白质的同源模型及功能注释信息,涵盖蛋白质结构模型、序列数据和多序列比对文件,为研究新冠病毒蛋白质的结构特征与功能机制提供数据支持。 文件详解 文件名称: models (1).zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明: 包含SARS-CoV-2蛋白质的同源模型数据 文件名称: seq...
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  • 真菌NUDIX酶多样性分析数据集

    2025年12月14日   

    数据集概述 本数据集涵盖真菌NUDIX酶多样性分析的原始数据,包含补充文件(如真菌组装列表、蛋白ID、基序保守性等)和多个文件夹(分子对接结果、结构文件、序列比对、系统发育树),为研究真菌NUDIX酶的多样性与功能提供支持。 文件详解 补充文件: Supplementary_File_S1.xlsx:...
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  • 东南亚淡水鱼类多基因遗传数据及古流域连通性分析数据集

    2025年12月14日   

    数据集概述 本数据集包含东南亚三个生物多样性热点地区淡水鱼类的多基因分子遗传数据及相关分析文件,旨在研究第四纪气候变化及古流域重组对水生动物多样性的影响,为区域生物多样性保护提供数据支持。 文件详解 该数据集由多种格式的文件组成,具体说明如下: - 遗传序列文件: -...
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  • 珊瑚礁鱼类集合种群迁徙交换与混合观测数据集

    2025年12月13日   

    数据集概述 本数据集聚焦商业重要性珊瑚礁鱼类——蓝脊鼻鱼(Naso unicornis)的集合种群动态,通过线粒体DNA(mtDNA)和微卫星标记,研究马里亚纳群岛南部250公里范围内386尾新定居幼体的迁徙交换与混合模式,为理解海洋种群连通性提供关键数据。 文件详解 数据文件(.xls格式):...
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  • 马丁_穆勒博士论文补充材料_气液界面培养的分化支气管上皮细胞中尼帕病毒的表征及雪松病毒反向遗传学

    2025年12月13日   

    数据集概述 本数据集为马丁·穆勒博士论文的补充材料,核心内容围绕气液界面培养的分化支气管上皮细胞中尼帕病毒的表征,以及雪松病毒反向遗传学研究展开,包含实验相关的序列、统计数据、图像等多种类型文件。 文件详解 说明文件: 00_description.txt:TXT格式,包含文件清单及简要描述,如siRNA序列文件的用途说明 Supplement...
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  • NSDV_GP38免疫原性与弗林蛋白酶作用补充数据集

    2025年12月13日   

    数据集概述 本数据集为NSDV GP38免疫原性及弗林蛋白酶在其蛋白水解加工中作用的研究补充数据,包含感染绵羊的抗体检测、序列比对、信号强度定量等实验结果,支持相关学术发表。 文件详解 该数据集包含9个文件,具体说明如下: - CSV数据文件(6个): -...
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  • 数据16S核糖体RNA基因口腔序列数据集

    2025年12月13日   

    数据集概述 本数据集包含人类口腔细菌和古菌完整基因组中的16S rRNA基因数量及其变体信息,涵盖3192个口腔细菌和191个口腔古菌的完整基因组,可通过提供的Python脚本按分类学筛选序列并计算分类群的基因数平均值。 文件详解 序列数据文件: bacteria_genes.fasta、archaea_genes.fasta:...
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  • 油杉寄生属_Arceuthobium_质体基因组与核系统发育数据集

    2025年12月12日   

    数据集概述 本数据集包含油杉寄生属(Arceuthobium)的质体基因组与核系统发育研究数据,涉及基因组测序组装结果、系统发育树文件、凭证标本信息表及分析方案文档,为该属系统发育关系、分类学及质体基因组演化研究提供支持。 文件详解 基因组序列文件(FASTA格式):...
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  • 硬松类系统基因组学研究数据集

    2025年12月12日   

    数据集概述 本数据集基于硬松类(Pinus subsection Ponderosae)的系统基因组学研究,包含130个个体的样本数据,涉及703个低拷贝核基因序列和近完整质体基因组序列,用于构建系统发育树与物种树,分析核质一致性与网状进化关系。 文件详解 说明文档与结果文件:...
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  • ALK2_ACVR1与M4K2117共结晶结构数据集_PDB_6SRH

    2025年12月12日   

    数据集概述 该数据集包含ALK2(ACVR1)与化合物M4K2117共结晶的结构数据,已在PDB数据库以代码6SRH存档。数据涵盖结晶结构相关的多种文件类型,为研究该蛋白与化合物的相互作用提供支持。 文件详解 结构与序列文件: M4K2117_refine_12.cif:CIF格式,可能包含经精修的晶体结构信息...
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  • Trichodesmium蛋白质鉴定宏基因组数据集2025

    2025年12月12日   

    数据集概述 本数据集是Anderson等人2025年研究的补充数据,包含Trichodesmium宏基因组序列、KEGG注释、补充表格及图表,用于分析海洋不同区域资源可用性对该生物蛋白质丰度模式的影响,支持蛋白质组学相关研究。 文件详解 宏基因组与注释文件:...
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  • 地衣共生体相互作用与光生物多样性研究数据集

    2025年12月12日   

    数据集概述 本数据集围绕地衣共生体相互作用展开,分析了2356条藻类ITS序列,涉及梅衣科等真菌属及培养的小球藻菌株,探究真菌对藻类的特异性与选择性,以及生态地理分布对共生关系的影响,包含序列比对、系统发育分析及补充数据。 文件详解 序列比对与系统发育文件(.nex格式):...
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  • 甲壳动物肢体发育与再生基因表达动态补充数据集

    2025年12月12日   

    数据集概述 本数据集为《甲壳动物肢体发育与再生过程中的基因表达动态》研究论文的补充数据,包含基因表达量、聚类分析结果、序列注释等多类型文件,支持论文结论的验证与扩展分析。 文件详解 数据文件(CSV格式,共26个):...
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  • 新型捕食性全动物类系统发育与双组分信号系统祖先数据集

    2025年12月12日   

    数据集概述 本数据集包含三种新型捕食性单细胞全动物类(Pigoraptor vietnamica、Pigoraptor chileana、Syssomonas multiformis)的形态学与转录组测序数据,涉及系统发育分析、基因功能研究及双组分信号系统演化等内容,为动物起源相关研究提供支持。 文件详解 系统发育分析文件:...
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  • 统计物理方法的密码子使用优化辅助代码与数据集

    2025年12月12日   

    数据集概述 该数据集包含用于密码子设计统计物理模型研究的辅助代码与数据,涵盖基因组预处理、过滤代码及处理后的数据集,支撑《A statistical-physics approach for codon usage optimisation》一文的研究内容。 文件详解 readme.txt:TXT格式,提供数据及代码的详细说明...
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  • 绿藻属Caulerpa的tufA参考序列库数据集

    2025年12月11日   

    数据集概述 本数据集包含绿藻属Caulerpa的tufA基因参考序列库,涵盖八十九种Caulerpa物种和九种Pseudochlorodesmis物种的基因序列比对、系统发育树及分类单元详情,支持藻类分类与系统发育研究。 文件详解 基因序列比对文件:...
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  • Portullugo分支_石竹目_光合作用基因系统发育与分子进化数据集

    2025年12月10日   

    数据集概述 该数据集围绕Portullugo分支(石竹目)的光合作用基因展开,包含系统发育重建与分子进化分析相关数据,涉及多基因家族的靶向富集方法应用,为研究C4和CAM光合作用起源的适应性氨基酸替换提供支持。 文件详解 文档类文件: suppl_methods_2018_08_19.pdf:PDF格式,补充方法说明文档...
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  • 双侧对称动物sNPF型神经肽信号起源与进化数据集

    2025年12月10日   

    数据集概述 本数据集围绕双侧对称动物(Urbilateria)中sNPF型神经肽信号系统的起源与进化展开,包含用于系统发育分析的原始序列、修剪序列及系统发育树文件,支持研究神经肽信号系统的演化历史及跨物种比较。 文件详解...
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