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ZooKeys_Supplementary_Material_1_双背甲马陆线粒体基因组测序研究数据_2016
2025年12月28日 30 166 37
数据集概述 本数据集为论文配套的补充材料1，包含双背甲马陆（Polydesmida目）的线粒体基因组测序相关补充表格。数据由下一代测序技术获得，是2016年发表于ZooKeys期刊的研究成果的补充支撑材料，用于记录和展示研究中的详细数据信息。 文件详解 补充表格文档 文件名称：oo_112696.docx 文件格式：DOCX...
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Grallaria_hypoleuca_Based_安第斯山脉蚁鸫物种形成历史研究数据_原始序列与系统发育文件
2025年12月28日 30 147 136
数据集概述 本数据集为安第斯山脉“湾背蚁鸫”复合体（Grallaria hypoleuca s. l.）物种形成历史研究的序列数据与系统发育分析结果，包含线粒体DNA与GBS技术生成的短读序列，以及系统发育树、基因分型等文件，共16个文件，用于解析该鸟类类群的地理分化历史与演化过程。 文件详解 系统发育树文件（.tree、.trees格式）...
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Elucidating_Steroid_Biosynthesis_加州藜芦甾体生物碱途径解析研究数据_2015
2025年12月28日 30 172 121
数据集概述 本数据集围绕加州藜芦甾体生物碱生物合成展开，聚焦环巴胺前体藜芦嗪的合成途径研究。通过在Sf9细胞中重构候选基因，发现催化胆固醇生成藜芦嗪的四种关键酶，包含研究相关的文档和序列文件，总计2个文件。 文件详解 README文档 文件名称：README_for_Augustin_etal_2015_p450.txt 文件格式：TXT...
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Development_validation_high_throughput_非模式物种序列标记设计与分析数据
2025年12月28日 30 116 82
数据集概述 本数据集围绕非模式物种序列标记的开发、验证及高通量分析展开，提供了适用于无参考基因组物种的遗传标记设计框架相关数据，包含标记序列、基因型数据、生物信息学脚本及参考序列等，可支持群体遗传学、系统发育学研究中标记的应用与分析。 文件详解 VCF_files.tar 文件格式：TAR（压缩包）...
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Olfactory_receptors_Supplementary_Data_喙头蜥嗅觉受体基因组项目补充数据
2025年12月28日 30 183 182
数据集概述 本数据集是喙头蜥（Sphenodon punctatus）基因组项目的补充数据，包含从其基因组组装中识别出的嗅觉受体基因相关信息，涵盖完整嗅觉受体基因列表、系统发育关系推断所用的比对文件，以及从 scaffolds 中识别出的嗅觉受体基因（含假基因和部分基因）的Excel表格，共三个文件。 文件详解 完整嗅觉受体基因列表...
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ZooKeys补充材料2_Ancyronyx_pulcherrimus进化分支的COI序列DNA条形码模式数据
2025年12月27日 30 192 27
数据集概述 本数据集为论文的补充材料2，包含Ancyronyx pulcherrimus分支648bp长COI序列比对中可变核苷酸位点的DNA条形码模式表格。数据聚焦该昆虫分支的基因序列特征，支持物种分类学研究，仅含1个文件。 文件详解 文件名称：oo_486560.docx 文件格式：DOCX 字段映射介绍：对应Table...
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BDJ_补充材料1_蕨类植物新真菌Monilochaetes_pteridophytophila系统发育分析数据
2025年12月27日 30 54 49
数据集概述 本数据集为论文“Monilochaetes pteridophytophila (Australiascaceae, Glomerellales), a new fungus from tree fern”的补充材料1，包含基于LSU和ITS序列数据的系统发育分析相关内容，是研究该新种真菌分类地位的关键支持数据。 文件详解...
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补充材料_ZSE_99_95222_Source_Jorunna_liviae新种COI与16S序列贝叶斯树数据
2025年12月27日 30 113 37
数据集概述 本数据集为新种海绵状裸鳃亚目软体动物Jorunna liviae的系统发育分析补充材料，包含基于COI和16S序列比对构建的贝叶斯最大可信度树，用于支持该新种的分类学鉴定与系统发育关系研究。 文件详解 文件名称：oo_795299.docx 文件格式：DOCX 字段映射介绍：包含Jorunna liviae sp....
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补充材料3_MycoKeys数据库中关于罗氏地衣属_Roccellinastrum_及其共生藻Cenozosia的序列比对登录号数据
2025年12月27日 30 134 35
数据集概述 本数据集为论文《Roccellinastrum, Cenozosia and Heterodermia: Ecology and phylogeny of fog lichens and their photobionts from the coastal Atacama...
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乳酸片球菌HN9基因组研究补充材料
2025年12月23日 30 121 114
数据集概述 本数据集为乳酸片球菌HN9（分离自泰国传统发酵牛肉Nhang的潜在益生菌菌株）基因组研究的补充材料，包含支撑研究结论的图表与表格，涉及基因组注释、系统发育分析、细菌素编码基因等内容。 文件详解 图表文件（.png格式，共6个）： Figure S1.png：基于RAST注释服务器的HN9菌株子系统信息图表 Figure...
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非洲南部牛眼菊属一年生分支分类修订数据集
2025年12月19日 30 136 122
数据集概述 本数据集围绕非洲南部牛眼菊属一年生分支的分类修订展开，整合了分子系统发育（cpDNA与nrDNA序列）和形态学证据，包含系统发育分析数据、补充附录及图表，为该类群的分类研究提供支持。 文件详解 该数据集包含七个文件，具体说明如下： - 说明文件： -...
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位点与谱系异质性下不变量与经典四元组推断数据集
2025年12月19日 30 20 17
数据集概述 本数据集围绕位点与谱系异质性下的系统发育四元组推断展开，包含相关研究的附录文档、代码说明及数据压缩包，为比较不变量方法与经典系统发育重建方法（如邻接法、最大似然法）的性能提供数据支持。 文件详解 README_for_Erik2.txt:...
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多毛类_腹足类共生关系研究COI基因序列Genbank登录号数据集
2025年12月25日 30 70 12
数据集概述 本数据集为研究多毛类与腹足类共生关系的学术资料，核心内容是研究中使用的COI基因序列对应的Genbank登录号表格，记录了多种环节动物的物种名称及基因序列编号。 文件详解 文件名称：table.html 文件格式：HTML（.html） 字段映射：包含两列核心字段——GenusSpecies（属种名称，如Protodorvillea...
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胡萝卜属线粒体DNA序列系统发育数据集
2025年12月25日 30 128 64
数据集概述 本数据集围绕胡萝卜属（Daucus）线粒体DNA序列的系统发育研究展开，包含36个胡萝卜属样本及2个外类群的测序数据，通过与质体DNA、核DNA数据的系统发育结果对比，分析线粒体基因在属级系统发育研究中的适用性。 文件详解 数据文件：...
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表型_基因型密码子模型检测适应性进化数据集
2025年12月18日 30 204 28
数据集概述 该数据集包含与表型-基因型密码子模型（PG-BSM）相关的研究数据，PG-BSM用于检测与离散表型进化相关的适应性密码子进化证据。数据集提供了研究中使用的真实比对数据、模拟数据及补充材料，支持对分子适应性进化机制的分析。 文件详解 文件名称：sysbio_paper_real_alignments.zip 文件格式：ZIP压缩包...
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海洋线虫DNA条形码参考数据集评估补充材料16
2025年12月24日 30 142 104
数据集概述 本数据集为海洋线虫DNA条形码参考数据集评估研究的补充材料16，包含基于"filtered"数据集的Clustal-O比对构建的邻接树（Neighbor joining tree），以图片格式呈现，用于支持树基分类学分配方法的评估。 文件详解 文件名称: oo_85409.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 文件内容:...
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布氏厌氧菌ITS1区域引物匹配分析补充材料
2025年12月24日 30 55 41
数据集概述 本数据集为布氏厌氧菌（Buwchfawromyces eastonii）研究的补充材料，聚焦于不同属厌氧真菌ITS1区域部分序列的比对，分析MN100引物与布氏厌氧菌的结合匹配情况，揭示其与其他属真菌的引物结合差异。 文件详解 文件名称: oo_39050.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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新世界鼠耳蝠线粒体与核基因组进化历史冲突数据集
2025年12月24日 30 206 63
数据集概述 该数据集聚焦新世界鼠耳蝠的基因组进化研究，包含37个代表性物种的完整线粒体基因组序列及3648个超保守元件（UCEs）的靶向测序数据，通过多种系统发育方法分析核基因与线粒体基因树的冲突，探索驱动鼠耳蝠独特进化历史的因素。 文件详解...
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Nudix超家族功能进化数据集
2025年12月23日 30 115 52
数据集概述 该数据集围绕Nudix超家族蛋白功能进化展开，整合了205个Nudix蛋白的实验与结构数据，修正并补充了基因本体注释，构建了序列比对与系统发育树，分析了水解酶基序下游环区的结构功能关系，揭示功能辐射的结构基础及系统发育规律。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件，具体说明如下： - 代码文件: - 3DCOMB_alignment.py:...
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稻属植物3号染色体基因树不一致性分析数据集
2025年12月23日 30 195 48
数据集概述 本数据集围绕稻属植物3号染色体短臂基因组序列，通过20种分析流程探究基因树不一致性的方法学与生物学成因，分析数据选择、比对等环节对结果的影响，为物种树推断及稻属进化研究提供数据支持。 文件详解 文档类文件： onlineAppendices.docx：DOCX格式，可能包含在线附录的详细说明...
