数据集概述
本数据集包含北美拟蝗蛙属（Pseudacris）物种树估计研究的相关数据，采用简化基因组文库方法开发标记，通过Illumina MiSeq平台进行平行标记扩增子测序，涉及27个核基因座和3个线粒体基因座的44个个体样本，可用于分析基因树异质性、核质基因不一致性及物种系统发育关系。
文件详解
- 代码文件
- 文件名称：Manipulator1.7.py
- 文件格式：PY
- 字段映射介绍：用于数据处理或分析的Python脚本文件
- 压缩包文件（共8个）
- 文件名称：MB.zip、Illumina-Reads.zip、Nexus_alignments.zip、BUCKy-a01.zip、SB-speciesTree.zip、RAxML_26nucDNA.zip、SB-44taxa.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含Illumina测序原始 reads、Nexus格式序列比对文件、BUCKy贝叶斯一致性分析结果、物种树分析结果、RAxML核DNA分析结果等系统发育研究相关数据
适用场景
- 系统发育研究：用于构建北美拟蝗蛙属的物种树，分析不同基因座的系统发育信号及物种间亲缘关系
- 基因树异质性分析：比较核基因与线粒体基因的系统发育树拓扑结构差异，探究基因树冲突机制
- 非模式生物测序技术应用：验证简化基因组文库方法结合Illumina MiSeq平行测序在非模式生物系统发育研究中的实用性
- 分子进化分析：通过核质基因数据集的比较，研究线粒体基因渐渗或选择性清除等进化过程
