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枯叶树DRYAD在大肠杆菌长期进化实验中的核心基因快速进化研究
2026年1月29日 30 183 63
数据集概述 本数据集围绕大肠杆菌长期进化实验（LTEE）展开，分析核心基因的进化特征。包含60株大肠杆菌共有的约2000个核心基因，对比其在实验中的突变情况与自然环境中的保守性，发现核心基因在LTEE中积累更多非同义突变，且受正选择的核心基因在自然中更保守，部分适应性突变可修饰蛋白功能。 文件详解 文件名称：README_for_DRYAD-LTEE-...
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盐生植物线粒体基因组分析补充材料2_同义密码子使用数据_2021
2026年1月28日 30 204 50
数据集概述 本数据集为论文《Sea Lavenders质体基因组分析揭示IR扩张与正选择》的补充材料2，包含Limonium（Sea Lavenders）质体基因组的相对同义密码子使用数据，用于分析该植物类群的密码子偏好性特征，支持其基因组进化研究。 文件详解 文件名称：oo_527176.xlsx 文件格式：XLSX...
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WAP65_HPX_Based鱼类与哺乳动物基因适应性进化分析数据
2026年1月27日 30 87 47
数据集概述 本数据集围绕鱼类暖温适应相关蛋白（WAP65）及其哺乳动物同源物血红素结合蛋白（HPX）的适应性功能分化展开，包含系统发育树、序列比对、选择压力分析等5类压缩文件，支持基因进化动力学、蛋白质功能差异及三维结构的研究。 文件详解 系统发育树文件 文件名称：PhylogeneticTree.zip 文件格式：ZIP...
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Noctilionoidea_Based蝙蝠觅食行为与视觉预适应研究数据
2026年1月22日 30 54 29
数据集概述 本数据集聚焦夜蛾总科（Noctilionoidea）蝙蝠的觅食行为转变与视觉预适应机制，分析视觉相关基因的正选择与放松选择水平，探究其生态适应性进化过程，涉及食性分化（如昆虫食性向植物性食性转变）与视觉功能的关联，包含1个压缩文件。 文件详解 文件名称：Alignments_from_Davies_et_al.zip 文件格式：ZIP...
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Limonium_Plastome_Based质体基因组重复分析补充数据2021
2026年1月19日 30 61 33
数据集概述 本数据集是论文《Plastome analysis unveils Inverted Repeat (IR) expansion and positive selection in Sea Lavenders》的补充材料1，包含四种Limonium植物质体基因组的重复分析结果，为研究该属植物质体基因组结构特征提供数据支持。 文件详解...
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Eopsaltria_australis_Based鸟类线粒体基因组选择分析数据
2026年1月15日 30 104 65
数据集概述 本数据集围绕澳大利亚鸲鹟（Eopsaltria australis）的线粒体基因组展开，分析其存在的正选择和纯化选择信号。研究聚焦于该鸟类线粒体与核基因组的不一致性现象，通过分析两个线粒体谱系的完整基因组，识别氧化磷酸化通路相关基因（ND4、ND4L、cyt-b）中的正选择位点，为探究自然选择对种群分化的影响提供数据支持。 文件详解...
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MHC_Adriatic_Based_宽吻海豚MHC_II类基因变异与平衡选择研究数据
2026年1月14日 30 163 51
数据集概述 本数据集聚焦亚得里亚海宽吻海豚MHC II类基因的遗传多样性，分析了DRA、DQA、DQB等位基因的多态性，涉及50只亚得里亚海个体（1997-2011年采集）及12只其他地中海个体。数据揭示DQA、DQB及三基因座单倍型的显著变异，支持正选择及长期平衡选择的存在，为保护遗传学研究提供依据。 文件详解 文件名称：MHC class II...
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Snake_Phototransduction_Genes_选择压力变化与光感受器转导研究数据
2026年1月11日 30 186 148
数据集概述 本数据集聚焦蛇类视觉系统进化的分子机制，包含蛇类光转导基因的转录组、基因组及选择压力分析相关数据。通过测序7个蛇眼转录组，结合全基因组和靶向捕获测序数据，分析基因丢失及选择压力变化，为蛇类进化起源、光感受器转导的分子基础提供支撑。 文件详解 Transcriptome Assemblies.zip 文件格式：ZIP...
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EVOB_D_16_00044R3_Based_附肢骨骼模式形成_半乳糖凝集素系统发育组学研究数据
2026年1月6日 30 169 83
数据集概述 本数据集围绕调控脊椎动物附肢骨骼模式形成的串联重复半乳糖凝集素（Gal-1和Gal-8）展开系统发育组学研究，对比软骨鱼、辐鳍鱼、肉鳍鱼及四足动物的Gal-8基因进化差异，分析其在附肢骨骼模式分化中的作用，包含1份研究文档。 文件详解 文件名称：BMC Evolutionary Biology EVOB-D-16-00044R3.docx...
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Phytophthora_ramorum_Based_入侵森林病原体有丝分裂重组与基因组进化研究数据
2026年1月4日 30 144 80
数据集概述 本数据集来源于关于入侵森林病原体疫霉属（Phytophthora ramorum）的研究，聚焦其有丝分裂重组与基因组快速进化机制。研究通过107个基因组测序，分析该病原菌如何克服入侵遗传悖论，揭示非核心基因组加速进化、基因丢失及效应基因正选择等特征，为理解生物入侵适应性提供数据支持。 文件详解...
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黑猩猩亚种Pan_troglodytes的基因组纯化及正向选择推断数据_Archive_VCF_Dryad
2025年12月30日 30 63 59
数据集概述 本数据集基于外显子捕获技术，研究三种现存黑猩猩亚种（中部、东部、西部）的全基因组核苷酸多样性，包含SNVs和indels变异位点信息，以及选择压力相关分析结果，可用于探究黑猩猩亚种的遗传多样性、种群历史及选择作用差异。 文件详解 README文件 文件名称：README_for_Archive_VCF_Dryad.rtf 文件格式：RTF...
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鲸类视觉与听觉基因的正选择和失活数据集
2025年12月23日 30 178 121
数据集概述 该数据集聚焦鲸类向水生生活过渡中感官系统的分子适应，分析了179个感官基因（含167个视觉与听觉相关基因）的正选择与假基因化情况，涉及54种鲸类及河马，揭示其听觉和视觉基因的适应性变化及视锥介导视觉基因的失活证据。 文件详解 数据集包含9个文件，具体说明如下： - 表格文件（.xlsx格式，共5个）： -...
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Relate量化正选择分析示例数据集
2025年12月19日 30 155 139
数据集概述 本数据集提供了一个完整的示例，展示如何使用Relate工具对1000 Genomes Project中CEU样本的LCT基因区域进行正选择分析。通过构建Relate树并利用RelateSelection模块，计算每个SNP的p值以量化其竞争优势。 文件详解 该数据集包含两个文件，具体说明如下： - 文件名称:...
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真兽类配子识别基因快速分化促进宏观进化数据集
2025年12月16日 30 76 48
数据集概述 本数据集围绕真兽类配子识别基因（Zan）的快速分化展开，包含17个真兽目112个物种的基因序列及系统发育树文件，用于探究Zan基因在物种分化和真兽类适应性辐射中的作用。 文件详解 系统发育树文件（.tre格式，共40个）： 示例文件：Zan.con.tre、izumo1.nex.con.tre、adam2.nex.con.tre等...
