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MLMD_PAH_Based多环芳烃非谐红外光谱计算补充材料数据
2026年1月28日 30 151 51
数据集概述 本数据集为论文《Computing Anharmonic Infrared Spectra of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons Using Machine-Learning Molecular...
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GdmCl_MD_Data_Set_胍阳离子气液界面吸附分子动力学模拟数据
2026年1月21日 30 110 109
数据集概述 本数据集包含胍氯化物（GdmCl）在水汽界面附近的分子动力学（MD）模拟采样的集体变量及光谱数据，与论文“Adsorption of Guanidinium Cations to the Air-Water Interface”配套发布，用于研究胍阳离子的表面活性，支持计算与实验研究验证。 文件详解 README.md（文档文件）...
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MD_Based_环辛烯氧化物在ACN_水混合电解质中的分子动力学模拟方法与结果数据
2026年1月18日 30 130 98
数据集概述 本数据集包含环辛烯氧化物在ACN/水混合电解质中的分子动力学（MD）模拟方法及扩展结果，为《通过调控电解质溶剂化结构微调电合成路径》视角文章提供支持，涵盖模拟方法说明与相关结果数据，共2个文件。 文件详解 Dorchies et al_MD_simulations_electrolyte_structure.docx 文件格式：DOCX...
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MD_Based_Asymmetric_CorA门控机制分子动力学模拟再现数据集
2026年1月15日 30 51 7
数据集概述 本数据集用于再现论文中描述的分子动力学（MD）模拟研究，核心内容为Asymmetric CorA门控机制相关的模型与参数文件，仅包含一个压缩文件，可支持相关模拟实验的复现与验证。 文件详解 文件名称：send.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：为压缩文件，包含论文“An asymmetric CorA gating mechanism...
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ALICE_MD_Simulations_生物分子慢构象转变增强采样与机器学习数据_2024
2026年1月12日 30 181 38
数据集概述 本数据集为论文“Enhanced Sampling of Biomolecular Slow Conformational Transitions Using Adaptive Sampling and Machine Learning”的官方实现，包含Ala2和Ala10两个示例的MD模拟轨迹（PLUMED COLVAR文件）、自动化模拟...
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数据40Ar_diffusion_Phlogopite_金云母中40Ar扩散原子校准与地幔动力学数据
2026年1月4日 30 186 159
数据集概述 本数据集为金云母中40Ar扩散的分子动力学（MD）模拟结果，包含PVT原子校准数据，以及对Ar-熔体-固体动力学相互作用、地幔捕虏体和金伯利岩上升动力学的模拟分析。数据通过MD模拟生成，为研究金云母中氩扩散行为及相关地质过程提供量化参考。 文件详解 文件名称：Results Of MD Simulations_Phlogopite.xlsx...
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ado1544_Science_Based_二维水传输结构超润滑性研究数据_Supplementary
2026年1月2日 30 60 0
数据集概述 本数据集是Science论文“Probing structural superlubricity of two-dimensional water transport with atomic...
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约束测试文件数据集
2025年12月9日 30 37 14
数据集概述 本数据集包含约束回归测试相关的文件，主要由行业基准系统和T4溶菌酶轨迹两部分组成，为约束测试的验证与分析提供数据支持。 文件详解 该数据集包含两个压缩文件，具体说明如下： - industry_benchmark_systems.zip:...
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FicD的TPR结构域功能动力学与ATP和BiP相互作用数据集
2025年12月23日 30 55 47
数据集概述 本数据集包含FicD的TPR结构域功能动力学研究相关的分子动力学（MD）模拟数据，核心围绕其与ATP和BiP相互作用的调控机制，为蛋白质结构功能分析提供数据支持。 文件详解 文件名称: FicD-MD-Data.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip） 文件内容:...
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RXR_RAR基因调控的分子动力学与随机建模整合数据集
2025年12月21日 30 158 20
数据集概述 该数据集围绕RXR-RAR核受体系统的基因调控机制展开，整合原子分子动力学（MD）模拟与随机建模方法，探究配体诱导的变构通讯、受体动力学及DNA识别，揭示分子尺度互作与长时程调控动态的关联。 文件详解 文件名称: data_naresh.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip） 内容说明: 压缩包内包含支持RXR-...
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晶体中功能性蛋白质动力学手稿数据集
2025年12月18日 30 116 36
数据集概述 本数据集为手稿《晶体中功能性蛋白质动力学》的配套数据，包含分子动力学（MD）模拟数据及手稿主文本图表的基础数据，基于PDZ结构域晶体结构（PDB ID：5E11）构建多种模拟系统，使用三种力场进行模拟，支持蛋白质动力学相关研究。 文件详解 核心文件： data.zip：压缩文件，包含两个子目录 md_data目录：含基于PDZ结构域（PDB...
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白细胞介素17受体A_泛素连接酶TRAF3IP2信号枢纽多尺度计算研究数据集
2025年12月18日 30 20 6
数据集概述 该数据集包含针对白细胞介素17受体A（IL-17RA）与泛素连接酶TRAF3IP2信号枢纽的多尺度计算研究资料，涵盖分子对接、分子动力学模拟、口袋分析及结合亲和力分析等完整工作流程的输入文件与结果数据，为自身免疫及抗炎治疗靶点研究提供结构动力学与热点区域的计算支持。 文件详解 Dock.zip:...
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数据5_HT1AR受体与不同拮抗剂结合机制研究数据集
2025年12月15日 30 69 58
数据集概述 本数据集包含5-HT1AR受体与Lecozotan、NAD299等七种拮抗剂结合的分子动力学（MD）模拟输入文件及参数文件，为研究受体与拮抗剂结合机制提供原始数据支持。 文件详解 文件列表：共7个ZIP格式压缩文件，分别对应不同模拟系统 SDZ216-525.zip：SDZ216-525拮抗剂系统的MD模拟输入及参数文件...
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MD模拟与AFM图像文件数据集
2025年12月9日 30 82 70
数据集概述 本数据集包含两类核心内容：一类是通过GROMACS 4.7.0进行的分子动力学（MD）模拟数据，研究不同单价（Na+、K+）和二价（Mg2+、Ca2+、Sr2+）阳离子与Drew-Dickerson B-DNA十二聚体的相互作用；另一类是通过JPK Nanowizard ULTRA...
