找到15个数据集

格式: ZIP 标签: PDB格式

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  • LANA_ET_AFSample模型_排序置信度与NMR引导评分数据集

    2025年12月9日 30 92 23

    数据集概述 本数据集包含LANA_ET目标的AFSample建模结果、排序置信度数据及NMR引导评分数据，提供模型文件、分析用数据文件和精选高评分模型，支持相关生物信息学分析。 文件详解 LANA_ET_processed.zip：压缩文件，包含针对该目标的AFSample 1和2建模生成的PDB格式模型文件...
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  • 受限支持的金亲合作用数据集

    2025年12月9日 30 73 20

    数据集概述 本数据集包含超分子笼（1892128、H、B1-B4、B10）和金配合物（G、G2、1-4）的处理后结构数据文件，以及通过pyKVFinder计算的空腔体积和尺寸参数，为研究受限环境下的金亲合作用提供结构与计算数据支持。 文件详解 文件名称: Aurophilic-Dataset.zip 文件格式: ZIP压缩包 包含内容:...
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  • 牙龈卟啉单胞菌T9SS组分复合物的AlphaFold2预测结构数据集

    2025年12月8日 30 98 31

    数据集概述 本数据集包含通过AlphaFold2预测的牙龈卟啉单胞菌IX型分泌系统（T9SS）核心膜复合物相关结构数据，涉及PorK-PorN二聚体、PorK-PorN环、PorM二聚体与PorL五聚体复合物、PorK与PorM结构域2-4二聚体复合物等多种复合物的预测结构，为研究T9SS核心膜复合物的组成与功能提供结构基础。 文件详解...
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  • SARS_CoV_2刺突蛋白与宿主受体复合物补充结构模型

    2025年12月7日 30 68 65

    数据集概述 该数据集包含SARS-CoV-2刺突蛋白受体结合域（RBD）与215种动物ACE2受体结合的结构模型（PDB格式），以及人类TMPRSS2的结构模型。模型通过FunMod流程构建，为研究病毒跨物种感染机制提供结构数据支持。 文件详解 文件名称: ACE2_TMPRSS2_structural_models.zip 文件格式:...
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  • 细胞色素P450_2C8无配体结合结构及葡糖醛酸苷相互作用实验数据集

    2025年12月7日 30 29 14

    数据集概述 本数据集包含细胞色素P450 2C8（CYP2C8）的无配体结合晶体结构数据，以及其与氯吡格雷酰基葡糖醛酸苷、吉非罗齐酰基葡糖醛酸苷等配体的表面等离子体共振（SPR）和等温滴定量热法（ITC）相互作用实验数据，为研究CYP2C8的结构与配体结合特性提供支持。 文件详解 晶体结构文件：...
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  • UBTR012574化学系列扩展数据集

    2025年12月7日 30 80 33

    数据集概述 该数据集围绕UBTR012574化学系列扩展展开，通过对接Enamine REAL数据库和SciFinder中的类似物化合物与USP5锌指泛素结合域，优先排序化合物，并使用表面等离子共振测定结合效力。 文件详解 分子结构与对接文件：...
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  • 番茄NRC分支辅助NLR免疫蛋白自活性在本氏烟prf突变体中无变化补充数据集

    2025年12月7日 30 152 95

    数据集概述 本数据集为研究番茄NRC分支辅助NLR免疫蛋白自活性在本氏烟prf突变体中变化的补充数据，包含系统发育分析、载体图谱、测序原始数据、细胞死亡量化数据及蛋白结构文件等5个补充数据集，以压缩包形式存储。 文件详解 Supplementary Dataset 1.zip：压缩文件，包含Prf分支的系统发育分析数据 Supplementary...
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  • Alpha_synuclein_ColabFold_Based_α_突触核蛋白结构建模完整数据

    2025年12月6日 30 75 25

    数据集概述 本数据集包含通过ColabFold工具对野生型人类α-突触核蛋白（alpha-synuclein）及其Ser129Asp突变体进行结构建模的结果，涵盖蛋白质结构模型文件、建模日志、参考文献、预测精度评估图表等多种类型文件，为研究该蛋白质野生型与突变体的结构差异提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种类型的文件，具体说明如下： -...
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  • CART_Modeling_Based_生物大分子结构CART模型可视化完整数据

    2025年12月6日 30 137 12

    数据集概述 本数据集为CART建模相关的文件存储库，包含ICN3D图像文件及模型结构文件，支持模型可视化与结构分析，提供两种不同格式的文件资源。 文件详解 文件名称: ranked_0.pdb 文件格式: PDB (.pdb) 内容说明: 可能为模型的三维结构文件，用于存储生物大分子或分子模型的结构信息 文件名称:...
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  • USP5锌指泛素结合域与化合物XSR00035795a共晶结构及选择性测试数据集

    2025年12月6日 30 178 93

    数据集概述 该数据集包含USP5锌指泛素结合域（Zf-UBD）与化合物XSR00035795a的共晶结构数据，以及通过表面等离子体共振实验测试化合物选择性的相关文件，用于分析配体与结合口袋的相互作用及甲基基团对USP5/HDAC6选择性的影响。 文件详解 XSR00035795a.mtz: MTZ格式文件，可能为晶体学数据文件，存储衍射数据相关信息...
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  • ACVR1_ALK2与M4K2009结合晶体结构沉积数据集

    2025年12月6日 30 134 102

    数据集概述 该数据集包含ACVR1/ALK2蛋白与化合物M4K2009结合的晶体结构沉积数据，涵盖结构解析相关的原始数据、处理文件及报告文档，为研究该蛋白与小分子的相互作用提供结构生物学数据支持。 文件详解 结构数据文件： ACVR1A_M4K2009_free.mtz：MTZ格式文件，可能为ACVR1A与M4K2009结合的自由状态衍射数据文件...
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  • 甲基转移酶复合物R_M2_S全长与R_M2_S2截断预测结构数据集

    2025年12月5日 30 172 13

    数据集概述 该数据集包含甲基转移酶复合物R-M2-Sfull-length和R-M2-S2cut的预测结构数据，以蛋白质数据库文件和图片文件形式呈现，为研究甲基转移酶复合物的结构特征提供支持。 文件详解 蛋白质数据库文件（PDB格式）： fold_dna_26x2_new_r_m2_fl_s_model_0.pdb：R-M2-Sfull-...
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  • SARS_CoV_2刺突蛋白成药性探索的监督分子动力学数据集

    2025年12月5日 30 149 113

    数据集概述 该数据集包含针对SARS-CoV-2刺突蛋白受体结合域（RBD）与ACE2结合抑制的分子动力学模拟数据，涉及2421种已批准小分子的虚拟筛选及后续验证，重点分析了头孢磺啶等候选药物对RBD-ACE2结合的影响，为抗病毒药物研发提供动态分子作用依据。 文件详解 分子动力学轨迹文件（.xtc格式）：共13个，记录蛋白质-...
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  • 丙酮丁醇梭菌钨依赖性醛_铁氧还蛋白氧化还原酶配体对接数据集

    2025年12月5日 30 158 140

    数据集概述 该数据集包含丙酮丁醇梭菌钨依赖性醛：铁氧还蛋白氧化还原酶结构中的配体对接数据，通过Caver Web工具完成。数据涵盖多种配体（如乙酸、甲醛等）在不同隧道的对接结果，以PDBQT、PDB和PDF格式存储，为酶结构与配体相互作用研究提供支持。 文件详解 配体对接结果文件（PDBQT格式，16个）：...
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  • PORCN分子结构模型数据集

    2025年12月4日 30 189 100

    数据集概述 本数据集提供PORCN（Porcupine）的分子结构模型相关文件，PORCN是Wnt信号通路关键酶，其结构模型有助于理解底物识别、催化机制及药物抑制原理，支持癌症治疗等研究。 文件详解 Readme.pdf：PDF格式文档，可能包含数据集背景、文件说明、使用方法等补充信息。...
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