数据集概述
本数据集为质体基因组组装工具NOVOWrap的测试数据,包含该软件在11种植物(石松类、裸子植物、被子植物)上的基准测试结果,涉及组装结果验证、注释、模块性能评估等内容,支持研究者验证软件功能及获取标准化基因组数据。
文件详解
- 文件名称:S1._Evaluation_of_variance_of_loci_for_seeds_selecting.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含种子选择过程中位点方差的评估统计数据
- 文件名称:S3._Annotation_results_of_assembled_sequences.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:组装序列的注释结果压缩包
- 文件名称:S2._Validation_of_the_assembly_results_of_different_seeds.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:不同种子组装结果的验证数据压缩包
- 文件名称:S5._PCR_verification_of_junctions_of_plastid_genomes.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:质体基因组连接区PCR验证数据压缩包
- 文件名称:S4._The_benchmark_of_the_Merge_module.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:Merge模块性能基准测试数据压缩包
数据来源
论文“NOVOWrap: an automated solution for plastid genome assembly and structure standardization”
适用场景
- 基因组组装软件评估: 用于测试NOVOWrap工具在不同植物类群质体基因组组装中的准确性与稳定性
- 质体基因组结构分析: 基于注释结果研究质体基因组的结构特征与标准化方法
- 基因组组装参数优化: 通过位点方差评估数据优化种子选择策略
- 植物系统发育研究: 利用标准化组装的质体基因组数据开展植物类群的进化分析