NOVOWrap_Based_质体基因组组装与结构标准化软件测试数据

数据集概述

本数据集为质体基因组组装工具NOVOWrap的测试数据,包含该软件在11种植物(石松类、裸子植物、被子植物)上的基准测试结果,涉及组装结果验证、注释、模块性能评估等内容,支持研究者验证软件功能及获取标准化基因组数据。

文件详解

  • 文件名称:S1._Evaluation_of_variance_of_loci_for_seeds_selecting.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含种子选择过程中位点方差的评估统计数据
  • 文件名称:S3._Annotation_results_of_assembled_sequences.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:组装序列的注释结果压缩包
  • 文件名称:S2._Validation_of_the_assembly_results_of_different_seeds.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:不同种子组装结果的验证数据压缩包
  • 文件名称:S5._PCR_verification_of_junctions_of_plastid_genomes.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:质体基因组连接区PCR验证数据压缩包
  • 文件名称:S4._The_benchmark_of_the_Merge_module.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:Merge模块性能基准测试数据压缩包

数据来源

论文“NOVOWrap: an automated solution for plastid genome assembly and structure standardization”

适用场景

  • 基因组组装软件评估: 用于测试NOVOWrap工具在不同植物类群质体基因组组装中的准确性与稳定性
  • 质体基因组结构分析: 基于注释结果研究质体基因组的结构特征与标准化方法
  • 基因组组装参数优化: 通过位点方差评估数据优化种子选择策略
  • 植物系统发育研究: 利用标准化组装的质体基因组数据开展植物类群的进化分析
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 15.13 MiB
最后更新 2026年1月23日
创建于 2026年1月23日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。