数据集概述
本数据集为兰科植物系统发育分析提供转录组挖掘的315个单拷贝直系同源基因串联数据。选取覆盖兰科5个亚科的10个代表物种,提取其转录组中的单拷贝直系同源基因用于构建系统发育树,解决传统方法在退化质体基因组物种定位上的难题,为兰科植物系统发育研究提供高效可靠的基因资源。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称:README_for_Unigene.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:Unigene相关的说明文档
- 文件名称:README_for_single_copy.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:单拷贝基因相关的说明文档
- 压缩文件
- 文件名称:Unigene.rar
- 文件格式:RAR
- 字段映射介绍:包含Unigene相关数据的压缩包
- 文件名称:single_copy.rar
- 文件格式:RAR
- 字段映射介绍:包含315个单拷贝直系同源基因数据的压缩包
数据来源
标题为“Data from: Mining from transcriptomes: 315 single-copy orthologous genes concatenated for the phylogenetic analyses of Orchidaceae”的研究
适用场景
- 兰科植物系统发育关系研究: 利用315个单拷贝直系同源基因数据构建兰科植物系统发育树,分析物种间的进化关系
- 植物基因家族分析: 研究兰科植物单拷贝直系同源基因的特征与功能
- 转录组数据挖掘应用: 探索转录组数据在植物系统发育研究中的应用方法
- 退化质体基因组物种定位: 解决因质体基因组退化导致的兰科物种系统发育定位难题
- 生物信息学方法优化: 优化基于多基因标记的植物系统发育分析方法