数据集概述
本数据集为Distephanus属分子系统发育研究的配套数据,包含4个核基因组和质体基因组分子标记的多序列比对文件、生物地理分析脚本、地理数据及时间校准分化时间分析配置文件,共8个文件。数据支持验证Distephanus属单系性、划分新分类单元Distephaneae族的研究结论。
文件详解
- 序列比对文件(.fasta格式)
- 文件名称:psbA_Final.fasta、ndhF_Final.fasta、ITS_Final.fasta、trnL_Final.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含核基因组与质体基因组分子标记的多序列比对数据,用于分子系统发育分析
- 地理数据文件
- 文件名称:geog.data
- 文件格式:.data
- 字段映射介绍:支持生物地理分析的地理信息数据
- 说明文档
- 文件名称:README.md
- 文件格式:Markdown
- 字段映射介绍:数据集描述、文件结构及使用说明
- 生物地理分析脚本
- 文件名称:BGB_Script_Feb2024.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:BioGeoBEARS生物地理分析的脚本文件
- 分化时间分析配置文件
- 文件名称:4Locus_Concat_18Oct2023.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:BEAST软件进行时间校准分化时间分析的配置文件
数据来源
Dryad数据库(https://doi.org/10.5061/dryad.vq83bk41c)
适用场景
- 植物系统分类研究:用于验证Distephanus属的单系性及新分类单元Distephaneae族的划分
- 分子系统发育分析:基于核基因组与质体基因组标记数据,开展植物类群亲缘关系研究
- 生物地理分析:结合地理数据与脚本,探究Distephanus属及相关类群的地理分布格局
- 分化时间研究:利用XML配置文件,进行植物类群多样化事件的时间校准分析