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Glazer_三刺鱼基因组组装优化与适应性性状定位数据
2026年1月30日 30 121 67
数据集概述 本数据集围绕三刺鱼基因组组装优化及适应性性状定位展开,包含通过GBS方法构建的连锁图谱数据,用于锚定、调整基因组 scaffolds,提升组装完整性;同时包含侧线板数量、鳃耙长度等进化性状的QTL定位结果,揭示适应性性状的遗传基础。 文件详解 文档类文件 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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基于真核细胞核外源性DNA序列依赖性活性与区室化研究的数据
2026年1月30日 30 148 118
数据集概述 本数据集围绕真核细胞核中外源性DNA的序列依赖性活性与区室化展开研究。通过将细菌基因组整合到酿酒酵母中,探究DNA序列与染色质组分自发性加载及活性的关系,识别出转录与沉默两种染色质原型,其形成依赖序列组成且不混合,呈现 bipartite 核区室化特征,数据集含17个不同类型文件。 文件详解 文档类文件...
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ScISOr_Seq_Based三刺鱼单细胞测序基因组注释优化数据
2026年1月27日 30 89 62
数据集概述 本数据集为单细胞Iso-Seq技术优化基因组注释的补充数据,包含通过ScISOr-Seq技术生成的三刺鱼基因模型注释文件、CellRanger输出信息、Iso-Seq处理数据等,可提升scRNAseq分析中基因计数完整性与细胞类型识别准确性,支持基因组注释优化研究。 文件详解 文档文件 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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WIND_Based_sncRNA_seq数据深度分析补充表格数据
2026年1月27日 30 89 56
数据集概述 本数据集为论文“WIND (Workflow for pIRNAs aNd beyonD): a strategy for in-depth analysis of small RNA-seq data”的补充表格压缩包,包含5个补充表格,涵盖人类和小鼠基因组GFT文件统计、spike-...
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Aureobasidium_pullulans_CRUB_1823菌株基因组注释数据
2026年1月18日 30 67 41
数据集概述 本数据集为出芽短梗霉(Aureobasidium pullulans)CRUB 1823菌株的基因组注释数据,包含3个不同格式的文件,覆盖基因组注释摘要、基因结构注释及功能注释补充材料,可用于该菌株的基因组功能分析与生物学特性研究。 文件详解 IDP_Apul-CRUB.0125.0.10.summary.tab 文件格式:TAB...
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Drosophila_simulans_M252_马达加斯加菌株基因组组装注释数据
2026年1月14日 30 73 17
数据集概述 本数据集包含马达加斯加起源的果蝇Drosophila simulans M252菌株的基因组组装与注释结果,该菌株来自D. simulans的祖先分布区。数据验证了M252基因组的高质量,记录了52%多外显子基因的可变剪接、70%基因的UTR注释、225个新基因及781个假基因,为果蝇遗传学研究提供资源。 文件详解...
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OryCun2_0_Based_家兔肾脏上皮细胞EHV_1感染时间进程扩展转录本注释数据2024
2026年1月7日 30 159 152
数据集概述 本数据集为基于CF_000003625.3_OryCun2.0参考基因组的扩展转录本注释GTF文件压缩包,数据来自家兔肾脏上皮细胞系感染马α疱疹病毒1型的时间进程实验,是2024年Tombácz等人相关研究的补充材料。 文件详解 文件名称:Supporting_Data_observed_transcripts.gtf.zip...
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Phytophthora_infestans_Based_爱尔兰马铃薯晚疫病病原菌效应分泌组注释数据
2026年1月3日 30 50 14
数据集概述 本数据集包含马铃薯晚疫病病原菌Phytophthora infestans T30-4菌株的效应分泌组注释信息,以及基因组组装和转录本注释文件。数据源自2009年公布的基因组序列,2015年起固定效应因子列表,采用PITG_xxxxx编号体系,可关联至GenBank组装版本GCA_000142945.1,支持植物病原菌效应蛋白的研究与分析。...
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Drosophila_Y_to_autosome_reversal_Genomic_changes_data
2025年12月29日 30 108 33
数据集概述 本数据集记录果蝇伪暗果蝇中Y染色体逆转自染色体后的基因组变化,包括约10-15百万年前祖先Y染色体与点状染色体融合事件的研究数据,涉及基因组组装、基因表达及注释等信息,共包含3个文件。 文件详解 文件名称:merged_de.gtf 文件格式:GTF...
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ewas_suite_Based_黑色素瘤耐药甲基化分析完整数据
2025年12月22日 30 164 93
数据集概述 该数据集是Galaxy Training Network教程的训练数据,用于分析Hugo等人2015年发表研究中的EWAS数据,识别与黑色素瘤MAPKi耐药相关的差异甲基化区域和位点,包含基因表达、表型等多类型文件。 文件详解 核心数据文件:...
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大鼠lncRNA_Bdnf_as定位扩展补充材料数据集
2025年12月13日 30 109 68
数据集概述 本数据集是“Mapping rat lncRNA Bdnf-as”研究的扩展补充材料,包含序列比对文件、BAM文件、从头组装GTF文件等,为大鼠长链非编码RNA Bdnf-as的定位研究提供支持。 文件详解 该数据集包含20个文件,具体说明如下: - 序列比对与组装文件: -...
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南美牡蛎基因组草图数据集
2025年12月10日 30 184 177
数据集概述 该数据集包含南美牡蛎(Crassostrea gasar和Crassostrea rhizophorae)的基因组草图相关文件,涵盖基因组组装注释结果、实验图表及数据表,为大西洋西南部牡蛎养殖研究提供关键资源。 文件详解 gasar_annotation.gtf.bz2: .bz2压缩格式,可能包含Crassostrea...
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多样性远交系小鼠肝脏性别偏向性lncRNA与性别相反基因共表达网络负相关数据集
2025年12月7日 30 75 50
数据集概述 本数据集围绕多样性远交系(DO)小鼠肝脏中性别偏向性长链非编码RNA(lncRNA)展开研究,分析其与性别相反基因共表达网络的负相关关系,包含基因结构、表达模式及垂体切除响应类别的调控机制相关数据。 文件详解 README文件(PDF格式): README_for_Suppl Figs...



