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  • 胆固醇对膜影响的非普遍性研究数据集

    2025年12月7日 30 6 5

    数据集概述 本数据集包含原子分子动力学模拟的设置文件、参数文件及后处理分析用的修改轨迹,围绕胆固醇对膜的流动性、曲率感知和弹性的非普遍性影响展开,对应2023年发表于《Nature Comm.》的研究。 文件详解 压缩文件: Membrane-...
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  • Peter_Tieleman_DPPC_Berger_NaCl_Based_1molNaCl下DPPC双层膜MD模拟完整数据

    2025年12月6日 30 162 4

    数据集概述 该数据集包含1摩尔氯化钠(NaCl)环境下完全水合DPPC双层膜的分子动力学(MD)模拟轨迹及相关文件。采用Berger-DPPC-98力场和Gromos离子力场,模拟条件为323K、72个脂质分子、2778个SPC水分子及51对Na/Cl离子,轨迹时长120纳秒,分析使用最后60纳秒数据。 文件详解 分子动力学参数与拓扑文件:...
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  • DPPC_Berger_NaCl_scaled分子动力学模拟数据集

    2025年12月6日 30 89 3

    数据集概述 该数据集包含150mM氯化钠溶液中完全水合的DPPC双层膜的分子动力学模拟轨迹及相关文件。使用Peter Tieleman提供的Berger-DPPC-98力场与Gromacs...
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  • Gromacs_DPPC_Berger_OPLS06_NaCl_Based_盐溶液中DPPC双层膜120ns模拟完整数据

    2025年12月6日 30 174 62

    数据集概述 本数据集包含150mM NaCl溶液中完全水合DPPC双层膜的分子动力学(MD)模拟轨迹及相关文件,采用Berger-DPPC-06力场与Gromacs 4.6.7生成,离子电荷缩放系数为0.7,提供120ns模拟数据及后60ns分析结果。 文件详解 模拟轨迹文件: md.xtc: 轨迹文件,存储120ns模拟的原子坐标信息...
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  • PeterTielemanLab_DPPC_Berger_NaCl_1Mol_Based_盐环境下DPPC双层膜动力学完整数据

    2025年12月6日 30 182 11

    数据集概述 本数据集包含完全水合的DPPC双层膜在1摩尔氯化钠环境下的分子动力学模拟轨迹及相关文件,基于Berger-DPPC-98力场和Gromacs 5.0.4软件生成,离子电荷缩放系数为0.7,模拟时长120纳秒。 文件详解 分子动力学模拟文件: md.gro:GROMACS结构文件,存储模拟系统的原子坐标与拓扑信息...
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  • 小Boc保护赖氨酸环肽的阴离子复合物溶液数据集

    2025年11月29日 30 191 96

    数据集概述 本数据集记录了含Boc保护侧链的四、五、六元赖氨酸环肽与多种阴离子(氯、溴、碘、硝酸根等)在乙腈(MeCN)和二甲亚砜(DMSO)中的结合特性,包含ITC滴定、NMR测试及分子动力学模拟等实验数据,为研究环肽阴离子受体设计提供支持。 文件详解 该数据集按溶剂分类存储实验数据,具体说明如下: - DMSO溶剂实验数据(位于DMSO/目录下):...
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