数据集概述
本数据集围绕猪脐带血微生物群研究工作流构建，包含从采样、DNA提取到生物信息学分析的相关数据，涉及13份脐带血样本和2份阴性对照样本的微生物群特征，同时记录了实验过程中的污染物考量，为研究猪脐带血微生物群提供结构化数据支持。
文件详解
- Ps_umbilical.rds
- 文件格式：RDS
- 字段映射介绍：由DADA2创建的phyloseq对象文件，包含13份猪脐带血样本和2份阴性对照样本的扩增子序列变体（ASVs）数据。
- R-script.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：包含用于表征15份脐带血样本（原文应为13份脐带血样本+2份阴性对照样本）和2份阴性对照样本在应用Decontam R包前后分类组成的脚本。
- metadata.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：为R-script.docx提供的元数据文件。
适用场景
- 猪脐带血微生物群结构分析: 利用phyloseq对象文件中的ASVs数据，研究猪脐带血微生物的物种组成与丰度。
- 微生物实验污染物评估: 通过阴性对照样本数据，分析DNA提取和扩增过程中的污染物对实验结果的影响。
- 微生物组学数据分析方法验证: 使用R脚本文件验证Decontam R包在微生物数据去污染处理中的应用效果。
- 猪早期肠道微生物定植研究: 基于脐带血微生物群数据，探索新生仔猪早期肠道微生物的潜在来源。
