数据集概述
本数据集包含拟南芥ABCG36/PDR8/PEN3转运体的坐标文件，用于分子动力学（MD）和量子力学（QM）计算，旨在研究ABCG转运体底物特异性的决定因素，重点关注全长拟南芥ABCG36转运体的胞外门关键残基对底物质量控制的作用。
文件详解
- 文件名称：README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：包含数据集内容说明，列出平衡模拟系统的PDB文件，如wt-iaa.pdb、wt-iba.pdb、wt-clx.pdb等CHARMM-GUI输出文件，涵盖蛋白质、ATP、混合脂质膜、水和离子信息
- 文件名称：abcg36-3d-zenodo.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包包含拟南芥ABCG36转运体相关的结构文件，具体内容需解压后查看
数据来源
论文“A key residue of the extracellular gate provides quality control contributing to ABCG substrate specificity”
适用场景
- 膜转运蛋白结构功能研究: 分析ABCG36转运体的三维结构特征及其与底物的相互作用机制
- 分子动力学模拟复现: 基于提供的PDB文件重现ABCG36转运体与不同底物（如IAA、IBA、CLX）的分子动力学模拟
- 底物特异性机制分析: 研究胞外门关键残基对底物质量控制的作用，揭示ABCG转运体底物特异性的分子基础
- 量子力学计算支撑: 为ABCG36转运体相关的量子力学计算提供结构坐标基础数据
