数据集概述
本数据集包含四个新西兰棘刺鹩物种（三种已灭绝、一种现存）的新型线粒体基因组序列，用于解析该科鸟类的系统发育关系并修订分类。数据支持形态学分析与遗传结果的结合，为雀形目早期进化及新西兰生物群研究提供关键遗传信息，助力分子定年及灭绝物种进化历史探究。
文件详解
- 测序数据文件
- 文件名称：Pachyplichas_yaldwyni_Av18213.fastq.gz、Traversia_lyalli_S27777.fastq.gz、Xenicus_longipes_Av37320.fastq.gz
- 文件格式：fastq.gz
- 字段映射介绍：包含棘刺鹩物种的线粒体基因组原始测序数据，记录碱基序列及质量信息
- 分析工具文件包
- 文件名称：RAxML_files.zip、BEAST_files.zip、MrBayes_files.zip
- 文件格式：zip
- 字段映射介绍：分别对应系统发育分析工具RAxML、分子定年工具BEAST、贝叶斯系统发育分析工具MrBayes的相关输入输出文件
- 形态学数据文件包
- 文件名称：Morphology_files.zip
- 文件格式：zip
- 字段映射介绍：包含用于结合遗传结果重新分析的形态学数据集
- 测序流程脚本文件包
- 文件名称：NGS_pipeline_scripts.zip
- 文件格式：zip
- 字段映射介绍：记录新一代测序（NGS）数据处理的流程脚本
数据来源
论文“Ancient mitochondrial genomes clarify the evolutionary history of New Zealand's enigmatic acanthisittid wrens”
适用场景
- 雀形目早期进化研究：通过线粒体基因组数据解析棘刺鹩与其他雀形目鸟类的系统发育关系
- 新西兰生物群演化分析：探究人类抵达前新西兰特有雀形目鸟类的多样性及灭绝物种的进化地位
- 古生物分子定年：利用现存与灭绝棘刺鹩的遗传数据建立分子钟校准点，推算物种分化时间
- 形态与遗传数据整合研究：结合形态学与基因组数据验证物种分类及亲缘关系
- 生物地理学分析：通过分子定年结果探讨新西兰棘刺鹩是否经历渐新世海洋淹没事件
