数据集概述
该数据集为研究论文《阿卡波糖偏好性葡萄糖苷酶催化代谢分子机制》的补充数据，包含分子动力学模拟（MD）和量子力学/分子力学（QM/MM）相关的计算数据，支持对阿卡波糖代谢分子机制的分析。
文件详解
- 分子结构文件（.xyz格式，10个）：如TS4.xyz、EP1.xyz、ES.xyz等，存储分子动力学模拟和QM/MM计算的坐标数据
- 输入参数文件（.inp格式，6个）：如1-SP.resp.inp、pathCV.inp、qmSMD.inp等，包含模拟计算的参数配置
- 脚本文件（.tcl格式，5个）：如pathCV.tcl、qmString_sequential.tcl、eABF.tcl等，用于模拟流程控制
- 分子动力学参数文件（.mdp格式，4个）：如2eq.mdp、3eq.mdp、4md.mdp等，设置分子动力学模拟参数
- 执行脚本文件（.sh格式，3个）：如2-ESP.resp.sh、1-SP.resp.sh、runGMX.sh等，用于运行模拟程序
- 压缩文件（.zip格式，1个）：MDcoordinate.zip，可能包含分子动力学模拟的坐标数据压缩包
- 数据文件（.xlsx格式，1个）：SourceData.xlsx，可能包含研究中提取的原始数据
适用场景
- 酶催化机制研究：分析阿卡波糖偏好性葡萄糖苷酶催化代谢的分子动力学过程
- 计算生物学研究：用于分子动力学模拟和QM/MM计算方法的复现与验证
- 药物代谢机制分析：探究阿卡波糖代谢相关的分子相互作用与构象变化
- 生物化学模拟方法开发：为相关计算模拟工具的参数优化提供数据支持
