数据集概述
本数据集基于锚定杂交富集技术生成的522个单拷贝核基因系统发育数据,用于重建天牛科(Cerambycidae)的高级系统发育关系。样本覆盖31个叶甲总科类群及4个外群,聚焦天牛科的系统发育地位与亚科间关系,为天牛科进化历史研究提供基础数据。
文件详解
- 文件名称:concatenated_nt.phy
- 文件格式:.phy
- 字段映射介绍:天牛科系统发育分析用的串联核苷酸序列数据文件
- 文件名称:concatenated_aa.phy
- 文件格式:.phy
- 字段映射介绍:天牛科系统发育分析用的串联氨基酸序列数据文件
- 文件名称:part_nt.txt
- 文件格式:.txt
- 字段映射介绍:包含DNA序列子集的位置信息,如Subset1对应的碱基区间等
- 文件名称:part_aa.txt
- 文件格式:.txt
- 字段映射介绍:氨基酸序列相关的子集划分或位置信息文件
- 文件名称:Coleoptera_AHE_probes.xlsx
- 文件格式:.xlsx
- 字段映射介绍:鞘翅目锚定杂交富集实验所用的探针序列数据文件
数据来源
论文“Anchored hybrid enrichment provides new insights into the phylogeny and evolution of longhorned beetles (Cerambycidae)”
适用场景
- 天牛科高级系统发育研究: 利用串联核苷酸/氨基酸序列数据,重建天牛科及叶甲总科的系统发育关系
- 昆虫进化历史分析: 探究天牛科的起源、分化时间及亚科间的进化关系
- 分子系统学方法验证: 评估锚定杂交富集技术在昆虫系统发育研究中的应用效果
- 鞘翅目探针设计参考: 基于Coleoptera_AHE_probes.xlsx文件,为鞘翅目其他类群的系统发育研究提供探针设计依据