数据集概述
本数据集为马达加斯加伪蝰蛇(Pseudoxyrhophiinae)系统发育研究的原始数据,包含基于5个Sanger测序基因位点和377个锚定基因组位点的两种分子数据集,用于比较不同测序规模和分析方法对物种树构建的影响,为蛇类系统进化研究提供基础数据。
文件详解
- 文件名称:AHE_Snake_ProbeDesign.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含锚定杂交富集(AHE)技术中蛇类探针设计的相关文件,用于377个基因组位点的测序捕获。
- 文件名称:All_files_for_Pseudoxyrhophiines.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含23种伪蝰蛇的5个Sanger基因位点与377个锚定基因组位点的原始测序数据、基因树与物种树分析结果文件,支持系统发育拓扑结构比较与方法学验证。
数据来源
论文“Comparing species tree estimation with large anchored phylogenomic and small Sanger-sequenced molecular datasets: an empirical study on Malagasy pseudoxyrhophiine snakes”
适用场景
- 蛇类系统发育研究:用于分析马达加斯加伪蝰蛇的属间亲缘关系与进化历史。
- 分子数据集规模比较:探究Sanger测序与锚定基因组测序在物种树构建中的差异。
- 系统发育方法学验证:评估不同基因树/物种树分析方法(如STAR、MP-EST、*BEAST)的准确性与适用性。
- 生物多样性进化分析:为马达加斯加蛇类多样性形成机制研究提供分子系统学依据。