数据集概述
本数据集包含Becchimanzi等人2025年手稿相关的原始数据和输出文件,核心内容为榛子内生镰刀菌分离株(Fusarium sp. Hzn5)的基因组测序数据,以及antiSMASH分析结果和系统发育重建文件,用于支持系统发育与代谢组学研究。
文件详解
- 文件名称:Becchimanzi2025_raw_data_zenodo_upload-20250325T104945Z-001.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含两类核心内容:一是Fusarium sp. Hzn5菌株的antiSMASH分析输出文件(.gbk格式);二是系统发育重建文件夹,每个文件夹含fasta序列、比对文件及带bootstrap支持值的RAxML输出树。
数据来源
论文"Genome Sequencing of a Fusarium Endophytic Isolate from Hazelnut: Phylogenetic and Metabolomic Implications"(Becchimanzi et al 2025)
适用场景
- 微生物基因组学研究:分析榛子内生镰刀菌分离株的基因组结构与功能元件
- 系统发育分析:利用fasta序列、比对文件及RAxML树数据,研究该菌株的进化关系
- 代谢组学分析:通过antiSMASH输出的.gbk文件,预测该镰刀菌的次生代谢产物合成潜力
- 植物内生菌与宿主互作研究:为榛子内生真菌的生物学功能及与宿主关系提供基因组学依据