数据集概述
本数据集为巴西圣埃斯皮里图州大西洋森林中发现的新种Chiasmocleis(姬蛙科、Gastrophryninae亚科)的研究数据,包含分子遗传数据(如ND2、16S等基因序列)、系统发育分析文件及分区方案等,支持该新物种的分类学描述与系统发育关系研究,共12个文件。
文件详解
- 分子序列文件(.fas格式)
- 文件名称:ND2.fas、16S.fas、12S.fas、BDNF.fas
- 内容:包含不同基因片段的DNA序列数据,用于分子系统发育分析
- 系统发育分析相关文件
- 文件名称:Beast_50K.tre、RAxML.tre(.tre格式);RAxML_infile.phy(.phy格式);Beast_50K.xml(.xml格式);Beast_50K.trees.txt、Beast_50K.log.txt(.txt格式)
- 内容:系统发育树结果文件、分析输入文件、贝叶斯分析参数配置文件及分析日志文件
- 数据矩阵文件
- 文件名称:datamatrix.nex(.nex格式)
- 内容:整合的分子数据矩阵,用于系统发育分析
- 分区方案文件
- 文件名称:partition_scheme.txt(.txt格式)
- 内容:记录DNA序列的分区信息,如“DNA, p1 = 1-700”等,用于系统发育分析中的模型分区设置
数据来源
论文“A new species of Chiasmocleis (Microhylidae, Gastrophryninae) from the Atlantic Forest of Espírito Santo State, Brazil”
适用场景
- 两栖动物分类学研究: 用于新物种Chiasmocleis的形态与分子特征整合分析,支持物种描述与分类界定
- 分子系统发育分析: 利用基因序列文件和分区方案,开展Chiasmocleis属及相关类群的系统发育关系重建
- 生物多样性研究: 为巴西大西洋森林两栖动物多样性调查与保护提供基础数据
- 进化生物学研究: 分析该新物种与近缘种的遗传分化,探究其进化历史与地理分布格局