数据集概述
本数据集围绕结直肠癌（CRC）传统治疗对肿瘤免疫编辑及免疫微环境的影响展开，包含转移性CRC患者接受mFOLFOX6联合贝伐珠单抗新辅助治疗前后的多组学数据，涵盖外显子测序、RNA测序及新抗原预测结果，可用于分析治疗对肿瘤免疫特性的调控机制。
文件详解
- WES_sequenza_CNVs.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含PatientID（患者ID）、chromosome（染色体）、start（起始位置）、end（终止位置）、length（长度）、nMajor（主要等位基因数量）、nMinor（次要等位基因数量）等拷贝数变异相关字段
- Neoantigen_predictions.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：压缩包，推测包含新抗原预测相关数据
- WES_SomaticVariant_all_variants.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含PatientID（患者ID）、Gene（基因）、feature（特征）、feature_type（特征类型）、variant_type（变异类型）、variant（变异）、chrom（染色体）、pos（位置）等体细胞变异相关字段
- RNAseq_salmon_raw_gene_counts.tsv
- 文件格式：TSV
- 内容说明：RNA测序原始基因计数数据
- RNAseq_salmon_gene_tpm.tsv
- 文件格式：TSV
- 内容说明：RNA测序基因TPM（每百万转录本）表达量数据
适用场景
- 结直肠癌免疫治疗机制研究: 分析传统治疗对肿瘤免疫编辑及免疫微环境的调控作用
- 肿瘤新抗原预测研究: 利用新抗原预测数据探索潜在免疫治疗靶点
- 多组学联合分析: 整合外显子测序与RNA测序数据，解析治疗相关的基因表达与变异关联
- 免疫治疗敏感性研究: 为微卫星稳定型（MSS）CRC患者的联合治疗策略开发提供数据支持
