数据集概述
本数据集聚焦德克萨斯蓝花楹（Lupinus texensis）野生种群与人工播种种群的遗传同质化研究，通过基因分型测序获取11,741个全基因组单核苷酸多态性（SNPs）及叶绿体基因组SNPs，分析12对相邻野生与播种种群（共187个个体）的种群结构与遗传多样性，揭示人类活动对该物种遗传结构的影响。
文件详解
- 说明文档类（.txt格式）：
- README_for_Bluebonnet_supmat_rev.txt：补充材料说明文档
- README_for_TotalRawSNPs.vcf.txt：原始SNPs数据（VCF格式）说明文档
- README_for_reference.fasta.txt：参考基因组（fasta格式）说明文档
- README_for_mainparams.txt：STRUCTURE分析主参数说明文档
- README_for_dDoccat.FinalSNP.txt：最终SNPs数据集（dDoccat方法）说明文档
- README_for_chloroplast.txt：叶绿体基因组数据说明文档
- 数据文件类：
- dDoccat.FinalSNP.structure：STRUCTURE分析输入文件（最终SNPs数据集）
- dDoccat.FinalSNP.vcf：最终SNPs数据集（VCF格式）
- TotalRawSNPs.vcf.gz：原始SNPs数据集（VCF格式，压缩包）
- reference.fasta.gz：参考基因组序列（fasta格式，压缩包）
- chloroplast.zip：叶绿体基因组数据压缩包
- mainparams：STRUCTURE分析主参数文件
- 补充材料类：
- Bluebonnet_supmat_rev.pdf：研究补充材料（PDF格式）
适用场景
- 植物遗传学研究：分析野生与人工种群的遗传结构差异及同质化机制
- 保护生物学研究：评估人类活动对野生植物遗传多样性的影响
- 进化生物学研究：探讨物种基因流模式及人工选择对自然种群的作用
- 生态管理应用：为野生花卉保护及人工播种政策制定提供科学依据
