数据集概述
本数据集为南非Memecylon属植物进化研究相关数据,包含基因树、物种树、序列比对、分区文件等多种类型文件,用于探究该属植物类群的系统发育关系、基因流及网状进化证据,支持植物分类学与进化生物学研究。
文件详解
- Dryad_ReadMe.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据背景、使用方法等信息
- 4_Gene_trees.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:基因树文件,记录各基因的系统发育关系
- 5_Astral_Memecylon.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:基于Astral方法构建的Memecylon属物种树文件
- 3_RAxML_bipartitions.from_trimmed_concatinated_introns
- 文件格式:from_trimmed_concatinated_introns
- 字段映射介绍:RAxML分析结果文件,包含串联内含子序列的系统发育树及分支支持率
- 2_Partition_file.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:分区文件,记录不同序列文件的分区信息,如DNA序列的位置范围映射
- 1_SequenceAlignments_Memecylon_Trimmed_introns.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:Memecylon属修剪后的内含子序列比对文件,包含多个样本的基因序列信息
数据来源
Dryad
适用场景
- 植物系统发育研究:分析南非Memecylon属植物的基因树与物种树关系,探究类群系统发育位置
- 进化生物学分析:研究该属植物的基因流、网状进化及多倍体证据,揭示进化历史
- 植物分类学研究:基于系统发育数据重新评估该属植物的分类地位与物种界定
- 生物多样性保护:识别该属植物的优先保护种群,为保护策略制定提供数据支持