数据集概述
本数据集为外显子捕获系统发育基因组学研究相关数据,针对澳大利亚石龙子蜥蜴(冠群年龄约8000万年)开展,使用目标富集技术测序约3000个蛋白编码外显子,研究不同系统发育分化水平下目标基因座的富集效率,同时开发了低至中等分化样本的分析工作流程。
文件详解
- README_for_dryad_34274.zip.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据和代码关联的文章信息、样本信息文件说明(library_sample.csv含样本信息、文库名称及NCBI SRA数据库登录号,所属项目PRJNA289283),以及数据和工作流程目录说明
- dryad_34274.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包文件,包含与研究相关的原始数据、代码及分析工作流程等内容
数据来源
Dryad数据仓库(关联文章:Bragg J, Potter S, Bi K, Moritz C Exon capture phylogenomics: efficacy across scales of divergence)
适用场景
- 系统发育基因组学方法评估: 研究外显子捕获技术在不同演化分化尺度下的富集效率和适用性
- 蜥蜴演化历史研究: 基于约3000个蛋白编码外显子数据,分析澳大利亚石龙子蜥蜴的演化关系
- 基因组测序工作流程开发: 参考低至中等系统发育分化样本的外显子捕获分析流程
- 生物信息学方法应用: 探索目标富集技术在大规模基因组位点采样中的实践价值