数据集概述
本数据集围绕转录与microRNA协同调控靶基因相对浓度稳定性展开,包含人类基因调控网络中相关的调控关系数据,支持研究microRNA作为主调控因子的前馈环(FFL)结构及其对基因浓度稳定性的作用,涉及ENCODE和Jaspar数据库来源的调控信息。
文件详解
- README文件
- 文件名称:README_for_ENCODE_micFFL.txt、README_for_Jaspar_micFFL.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:分别说明ENCODE和Jaspar来源的micFFL数据清单内容及结构
- 调控关系数据文件
- 文件名称:ENCODE_micFFL.txt
- 文件格式:TXT(制表符分隔)
- 字段映射介绍:包含microRNA名称、转录因子(TF)、miRNA-TF链接数据库标识、靶基因(T)、miRNA-T链接数据库标识等字段,记录具体调控关系
- 压缩数据文件
- 文件名称:Jaspar_micFFL.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含Jaspar数据库来源的micFFL相关数据,具体内容需解压后查看
数据来源
论文“A combination of transcriptional and microRNA regulation improves the stability of the relative concentrations of target genes”
适用场景
- 基因调控网络结构分析: 研究microRNA作为主调控因子的前馈环(FFL)拓扑结构及其功能
- 转录与microRNA协同调控机制研究: 分析两者协同调控对靶基因浓度稳定性的作用
- 细胞周期调控研究: 以E2F1-RB1-miR-17家族调控为例,探究细胞周期G0/G1到S期转换的稳定性调控
- 生物信息学数据库整合分析: 整合ENCODE和Jaspar数据库数据,挖掘人类基因调控网络特征